New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1811479 | 76 (1.020) | 7 (0.110) | 5/208 | NT | 9.8% | intergenic (+44/+84) | ispD/PP_1615 | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase/LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1811513 | 67 (1.100) | intergenic (+78/+50) | ispD/PP_1615 | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase/LysR family transcriptional regulator |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTAC > NC_002947/1811330‑1811628 | gTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > 1:1232590‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaa < 2:1541906/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGa > 2:339657/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCCGCGGCTGGGGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGa < 1:1272444/150‑1 (MQ=255) gcAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGGCAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGa < 2:240982/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGAtt > 1:1252970/1‑150 (MQ=255) cgGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACGTAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGAGCTGGCCTTTTCGAGGGTAAACCCGCTCCTACTATGGATTGCATCggt < 2:1011394/150‑1 (MQ=255) tggtggAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAATGGATTGCGTCGGTGGtt > 2:372374/1‑150 (MQ=255) ggtggAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTg < 1:650161/150‑1 (MQ=255) ggAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGac > 1:1598922/1‑150 (MQ=255) gAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGaca < 1:1284083/150‑1 (MQ=255) gAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGaca < 1:786630/150‑1 (MQ=255) gAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCAGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGaca < 1:1185781/150‑1 (MQ=255) aGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > 2:378308‑M1/1‑123 (MQ=255) aGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 1:378308‑M1/123‑1 (MQ=255) gcgcAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGAc < 1:1448986/150‑1 (MQ=255) gcAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACcg > 2:1662470/1‑150 (MQ=255) aGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACcgtc < 1:556630/150‑1 (MQ=255) aGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACcgtc > 1:157709/1‑150 (MQ=255) aacaTAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGa > 2:1716597/1‑133 (MQ=255) acaTAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggag < 2:1030438‑M2/150‑8 (MQ=255) caTAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCTAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagc < 1:1697325‑M2/150‑9 (MQ=255) caTAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGTCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagc < 2:1505694‑M2/150‑9 (MQ=255) aTAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcg > 1:1155587‑M2/1‑141 (MQ=255) tAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgg < 1:995757‑M2/150‑11 (MQ=255) tAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTCGGCGGGTGAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgg < 2:1398655‑M1/150‑45 (MQ=255) aaaagGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgg < 1:1675825‑M1/149‑45 (MQ=255) ccGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGa > 1:1704951/1‑125 (MQ=255) ccGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGa < 2:1704951/125‑1 (MQ=255) ccGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttacccgc > 1:1753287‑M2/1‑130 (MQ=255) ccGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGGCggaggaccgggtttccccgc < 2:905054‑M2/150‑21 (MQ=255) ccGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTCGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttacccgc < 2:1343599‑M2/150‑21 (MQ=255) gCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:1631967‑M2/1‑127 (MQ=255) gCCCGAAGAGCTCGAATGGTTGCGCCGGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGGGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:682224‑M2/1‑127 (MQ=255) ccGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 1:339657/150‑1 (MQ=255) actagctcGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTGGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 1:1466961/145‑1 (MQ=255) aaGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 1:1662470/150‑1 (MQ=255) aaGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTGCTCCTGGGCTGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 1:1873950/150‑1 (MQ=255) aGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagc > 1:201883‑M2/1‑121 (MQ=255) aGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagc < 2:201883‑M2/129‑9 (MQ=255) aGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagc > 1:1155309‑M2/1‑121 (MQ=255) aGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagc < 2:1155309‑M2/129‑9 (MQ=255) gATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCa < 2:1697325/150‑1 (MQ=255) tcGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATg < 2:1889416/86‑1 (MQ=255) tcGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTAc > 2:1925068/1‑150 (MQ=255) tcGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAATAc > 1:320067/1‑150 (MQ=255) aaTGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACcag < 1:847381/150‑1 (MQ=255) aaTGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACcag < 1:876238/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGGGCGGGTAACCGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGCAAACCCGCTGCTACACTGGATCGCCTCGGTGGTGGGACCTTGCCCGTCGTCGGAGGGGGTGGTGCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGcaca < 2:1163769/150‑1 (MQ=255) gcCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATc < 1:937268/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATccc > 1:1858036/1‑150 (MQ=255) aGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagtgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagc < 2:176161‑M1/150‑84 (MQ=255) tcttggCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGCCCCCCGGCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCa < 1:1367642/146‑1 (MQ=37) gcTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttac < 2:1782162‑M1/114‑51 (MQ=255) gcTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttac > 1:1782162‑M1/1‑64 (MQ=255) gcTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGATCTAACACGAAGATGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCa > 2:1095532/1‑150 (MQ=255) tAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCCAAAAAACTTATTCCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGa > 2:1400138/1‑150 (MQ=38) aaaCGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGtt < 2:609232/73‑1 (MQ=255) cTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTcc < 2:1598922/150‑1 (MQ=255) gCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttaccc < 2:861027‑M2/96‑19 (MQ=255) gCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttaccc > 1:861027‑M2/1‑78 (MQ=255) gTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAAc < 1:1340471/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGAACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGc < 1:1095532/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag < 1:1389699/91‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAAcccc > 2:1086589/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAACAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAAcccc < 1:978220/150‑1 (MQ=255) gCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCcctc > 2:1099218/1‑150 (MQ=255) ctcttcgcGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATAGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagc > 1:1297229‑M2/4‑60 (MQ=255) ctcttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGc > 2:1297229/4‑68 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCtt > 1:1089724/1‑150 (MQ=255) taggagcgGGTTTACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCtt > 1:853227/6‑150 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAg < 2:1232590/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtcgaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgg < 2:1343599‑M1/150‑131 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgg > 1:1895529‑M1/1‑20 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgg > 1:1753287‑M1/1‑20 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgg < 1:1161539‑M1/150‑131 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagc > 1:1691007‑M2/1‑54 (MQ=255) gcgGGTAAACCCACTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgg > 1:176161‑M2/1‑54 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattc > 1:814941‑M1/1‑18 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattc < 2:814941‑M1/132‑115 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgc < 2:861027‑M1/96‑79 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTaa < 2:1123759/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagc < 2:1782162‑M2/114‑65 (MQ=255) cccGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATccacca > 1:1566156/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgggtcaccttta > 1:333962‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgggtcacctttt < 1:1675825‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgggtcaccttta < 2:641591‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgttcacccgccgagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgggtcaccttta < 2:1398655‑M2/150‑107 (MQ=255) ccGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAg > 2:742787/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAg > 2:477576/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAg > 1:53574/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatct > 1:1155309‑M1/1‑8 (MQ=255) gCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatct > 1:201883‑M1/1‑8 (MQ=255) gCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgaccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgggtcacctttatg < 2:1505694‑M1/150‑143 (MQ=255) gCTCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgc < 2:1691007‑M1/62‑55 (MQ=255) cctCCTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcgctggcgcaaccattcgagatcttcgggccgggtcacctttatg < 2:1915710‑M1/149‑143 (MQ=255) ccTACgacggtctgtgtccaaccaccgatgcaatccattgtaggagcgggtttgcccgcgaaaaggccagcccaggagaacgctcagcgtttacccgcccagcactggcgcaaccattcgagatcttcgggccgggtcacctttatgttg < 1:92694‑M1/150‑146 (MQ=255) ccTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAgccgcc < 1:1440825/150‑1 (MQ=255) cAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTAc > 2:722994/1‑150 (MQ=255) cAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTAc < 2:202258/150‑1 (MQ=255) | GTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTAC > NC_002947/1811330‑1811628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |