New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 1917343 = | 87 (1.280) | coding (924/1083 nt) | PP_1718 | EAL domain‑containing diguanylate phosphodiesterase |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GTGGTTCGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAG‑CCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATG > NC_002947/1917117‑1917413 | tgaacaaccgacagtgcacttgaatgccacgatcgggcagctgctggagctgtttggccgataccagcacctggaggcattggaagtggtggatgccgatggcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccggccTa < 1:326951‑M1/2‑1 (MQ=255) ttCGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAG‑CCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTcgc < 1:377094/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAG‑CCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTcgc < 1:1692787/150‑1 (MQ=255) 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aCAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAG‑CCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:1494477/1‑150 (MQ=255) gCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAG‑CCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:1212719/150‑1 (MQ=255) tCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAG‑CCTATTCGTTATCGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCt < 1:793993/150‑1 (MQ=255) ccGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAG‑CCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCtga > 1:808893/1‑150 (MQ=255) ccGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAG‑CCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCtga < 2:808893/150‑1 (MQ=255) 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ccGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCAcccc < 2:1525646/150‑1 (MQ=255) cgccgtTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTACTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACGCGTGATAGCTGATTTGGCCGTCTGCCCCGTAGATCGGGGGTGACTCGTGAAGAGGCCGGGAGAGGCAGCGCATCACTATGAATCAACACGCAccccc > 2:872256/4‑150 (MQ=255) gtcgtTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGCGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCt > 2:318403/1‑150 (MQ=255) gtcgaTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCt > 2:477295/1‑150 (MQ=255) ttCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTGGTGTTTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCa > 1:990801/1‑150 (MQ=255) ttCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCa > 2:245006/1‑150 (MQ=255) ctcCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATc > 1:4105/1‑150 (MQ=255) tcCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCg < 1:834984/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCa < 2:338644/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCAt > 1:689926/1‑150 (MQ=255) ccgccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATcca < 1:1428164/150‑1 (MQ=255) cACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTc > 2:326951/1‑150 (MQ=255) cACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTc > 2:1710641/1‑150 (MQ=255) aCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTc > 1:545759/1‑149 (MQ=255) aCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTc < 2:545759/149‑1 (MQ=255) cGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCaa < 2:1603285/150‑1 (MQ=255) cGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCaa < 1:877808/150‑1 (MQ=255) TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATg < 2:1744438‑M1/150‑1 (MQ=255) | GTGGTTCGGGTGTTCGAGTACAGCTATCCCGAAACGGCCTGAAGCGTTGCCCATTCCAG‑CCTATTCGTTATAGGTGGTGACCCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATG > NC_002947/1917117‑1917413 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |