| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 1917264 = | 99 (1.330) | 8 (0.120) | 7/232 | NT | 8.3% | coding (1003/1083 nt) | PP_1718 | EAL domain‑containing diguanylate phosphodiesterase |
| ? | NC_002947 | 1917343 = | 87 (1.280) | coding (924/1083 nt) | PP_1718 | EAL domain‑containing diguanylate phosphodiesterase | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTGGCATTCAAGTGCACTGTCGGTTGTTCA > NC_002947/1917198‑1917490 | ccTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCg < 1:820407/150‑1 (MQ=255) cTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCg‑g > 2:57079/1‑150 (MQ=255) gccgattgcagggggtgcgggttgattcacagggatgcgctgcctgtgccgccaccgTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCa > 1:1378693‑M1/58‑150 (MQ=255) 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gCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAgcgc < 2:1147342/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAgcgc < 1:1880189/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGACTAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATccc > 2:265966/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCt > 1:463832/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCTCCGTAGGCGCAGGTCCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCtgt < 2:1499989/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCtgt > 2:195281/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCtgt < 1:859382/150‑1 (MQ=255) ctgGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTTTGa < 1:1225939/150‑1 (MQ=255) tgGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGTATcc < 2:1500301/143‑1 (MQ=255) gCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATc > 2:412512/1‑150 (MQ=255) 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cccGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCACCCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCaaa > 1:1458236/1‑125 (MQ=255) cccGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAATAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTgg < 2:553635/150‑1 (MQ=255) cccGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTgg > 2:1579793/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTGGCATTCaa < 2:1255133/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTg > 2:1869645/1‑140 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTg < 1:1869645/140‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTGGCATTCAAGt < 2:4105/150‑1 (MQ=255) ccgcgaataG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCa > 2:1062461‑M2/10‑103 (MQ=255) ccgcgaataG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCa < 1:1062461‑M2/94‑1 (MQ=255) ccgcgaataG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTGGCATTCAAGTGCACTGTCgg > 1:1092913‑M2/10‑150 (MQ=255) cgcgaataG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTGGCATTCAAGTGCACTGTCGgt > 1:904510‑M2/9‑150 (MQ=255) gaataG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCCGCAGCTGCCCGATCGTGGCATTCAAGTGCACTGTCGgttgt > 1:1373292‑M2/6‑150 (MQ=255) taG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTGGCATTCAAGTGCACTGTCGGTTGTTCa < 1:245006‑M2/148‑1 (MQ=255) taG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTGGCATTCAAGTGCACTGTCGGTTGTTCa < 1:326951‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCTGAGCGAAAAGGCAGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGTCGTTCTCCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGATTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAG‑GCCG‑GCACAGGCAGCGCATCCCTGTGAATCAACCCGCA‑CCCCCTGCCATCGGCATCCACCACTTCCAATGCCTCCAGGTGCTGGTATCGGCCAAACAGCTCCAGCAGCTGCCCGATCGTGGCATTCAAGTGCACTGTCGGTTGTTCA > NC_002947/1917198‑1917490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |