New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2302335 = | 78 (1.050) | 6 (0.080) | 6/242 | NT | 7.7% | coding (606/654 nt) | PP_5497 | rhs repeat‑associated core domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 2302364 = | 70 (0.990) | coding (635/654 nt) | PP_5497 | rhs repeat‑associated core domain‑containing protein |
GCATCCAGGCAGGATAAAAGGAGCCTCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGA > NC_002947/2302189‑2302481 | ggtgcgaagcgcccccagggtcttcgcatcacagccaaatcgccgggccatgttgcggccctctgcgaccggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAg > 1:219586‑M1/147‑150 (MQ=255) cATCCAGGCAGGATAAAAGGAGCCTCACACCACTGCTGATCGGTCCACAAGGCGACGGGGCTAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGagcagc < 1:961329/150‑1 (MQ=255) tgcgaagcgcccccagggtcttcgcatcacagccaaatcgccgggccatgttgcggccctctgcgaccggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgcctctgcgtaaaaccattctgctttacGCAGcc > 1:989044‑M1/145‑150 (MQ=255) aTCCAGGCAGGATAAAAGGAGCCTCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGcc > 1:1090006/1‑150 (MQ=255) aggcaggATAAAAGGAGCCTCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGAGGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCt > 2:24265/1‑150 (MQ=255) aagcgcccccagggtcttcgcatcacagccaaatcgccgggccatgttgcggccctctgcgaccggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAg > 2:1444143‑M1/141‑144 (MQ=255) aagcgcccccagggtcttcgcatcacagccaaatcgccgggccatgttgcggccctctgcgaccggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAg < 1:1444143‑M1/4‑1 (MQ=255) aggATAAAAGGAGCCTCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGt < 1:1724248/150‑1 (MQ=255) aTAAAAGGAGCCTCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCgg > 1:1811168/1‑150 (MQ=255) tAAAAGGAGCCTCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGc > 2:354516/1‑150 (MQ=255) ataaaGGAGCCTCAAACAACTGCTGAGCGTTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACTCCAATGATCGACGCGCGTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGAAGCCCGCTCAGTCGGc < 2:475944/148‑1 (MQ=255) cTCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTg > 2:1149387/1‑150 (MQ=255) cTCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTg > 1:844301/1‑150 (MQ=255) tCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACgg < 1:998532/146‑1 (MQ=255) tCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGc > 1:1257179/1‑150 (MQ=255) tCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCACTTCCCGCCCAAGCCAGCGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACgg > 2:998532/1‑146 (MQ=255) gcatcacagccaaatcgccgggccatgttgcggccctctgcgaccggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGc > 1:1198634‑M1/122‑150 (MQ=255) atcacagccaaatcgccgggccatgttgcggcactctgcgaccggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGt > 1:548055‑M1/120‑150 (MQ=255) aaCCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑a > 2:1178049/1‑150 (MQ=255) aCCACTGCTGCGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑aa > 1:1036662/1‑150 (MQ=255) ccACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGACCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑aaa < 1:1193685/150‑1 (MQ=255) cGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGtt < 1:937637/150‑1 (MQ=255) cGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCACCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGtt < 1:1315309/150‑1 (MQ=255) tCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGACCGATCCCTTCCCGCCCAATCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTa > 1:233379/1‑150 (MQ=255) tCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTa > 2:298956/1‑150 (MQ=255) tGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGatcatc < 2:844301/150‑1 (MQ=255) gCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGACGACGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGAtcatca > 1:1076940/1‑150 (MQ=255) cATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCaa < 2:1674147/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAg < 1:1888791/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAg > 1:766229/1‑150 (MQ=255) tCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAgg > 2:323680/1‑150 (MQ=255) tCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAgg > 2:1922222/1‑150 (MQ=255) cAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGt < 2:1721801/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAATGATCGACGCGCTTCTGCATCCGAATGCGTCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcgg > 1:1892982/1‑150 (MQ=255) ggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑aaa > 2:1485110‑M1/77‑110 (MQ=255) ggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑aaa < 1:1485110‑M1/34‑1 (MQ=255) cGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAgg < 1:221088/140‑1 (MQ=255) cGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAgg > 2:221088/1‑140 (MQ=255) cGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggtt < 1:1010519/150‑1 (MQ=255) gCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggttc < 1:1149387/150‑1 (MQ=255) gCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggttc > 2:10018/1‑150 (MQ=255) aaTGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggttcggt > 2:618919/1‑150 (MQ=255) aTCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCAt < 2:1257179/150‑1 (MQ=255) tCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCAtt > 1:218848/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATtgtg < 1:354516/150‑1 (MQ=255) cgcgCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTgg < 1:1328579/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCa > 1:296301/1‑99 (MQ=255) gcgcTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCa < 2:296301/99‑1 (MQ=255) cTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGc < 2:1603255/150‑1 (MQ=255) tGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCCGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTgg < 2:1121453/142‑1 (MQ=255) tGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTgg > 1:1121453/1‑142 (MQ=255) tCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGa > 1:1394288/1‑140 (MQ=255) tCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGa < 2:1394288/140‑1 (MQ=255) tCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGc > 1:15091/1‑150 (MQ=255) cGAACAATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCg < 2:9900/150‑1 (MQ=255) gAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGc < 2:723342/77‑1 (MQ=255) gAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGc > 1:723342/1‑77 (MQ=255) gAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTAAGGTTCATGTTGGGAGCTGCCTTGCCgg > 2:1883962/1‑150 (MQ=255) gAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGC‑CCGCAGAGGCTTCGGAGTAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCgg > 2:543703/1‑150 (MQ=255) gAACGATCCCTTCCCGCCAAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCgg > 2:603536/1‑150 (MQ=255) aCGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGAAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGAc < 2:1090006/150‑1 (MQ=255) cGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGAcc > 2:1861306/1‑150 (MQ=255) gATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGagca < 2:1377983/47‑1 (MQ=255) gATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGagca > 1:1377983/1‑47 (MQ=255) gATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggttc > 1:810979/1‑119 (MQ=255) gATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggttc < 2:810979/119‑1 (MQ=255) aTCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCgg > 1:1884774/1‑150 (MQ=255) gcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCt > 1:1356710‑M1/42‑68 (MQ=255) gcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCt < 2:1356710‑M1/27‑1 (MQ=255) ccTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCg > 2:1914354/1‑150 (MQ=255) ccTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCg > 1:1330874/1‑150 (MQ=255) cTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGc > 2:1786480/1‑150 (MQ=255) ttCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGcc > 2:454677/1‑149 (MQ=255) cccGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGc > 1:118961/1‑130 (MQ=255) cccGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGc < 2:118961/130‑1 (MQ=255) cccGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCg < 2:1624437/142‑1 (MQ=255) cccGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCg > 1:1624437/1‑142 (MQ=255) gCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAggg > 1:1864102/1‑150 (MQ=255) gCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAggg < 1:1786480/150‑1 (MQ=255) ccAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGCGACGCTTTTGCTGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGcc < 2:1892982/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGc > 1:45585/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTGACGGCTGCGT‑CAAGGAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAAc > 2:245354/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTTATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAAc < 1:444698/150‑1 (MQ=255) cAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCGTGACGGACCACTCGCATAGGGCCGCAACa < 2:1662717/150‑1 (MQ=255) gggCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATg > 1:1113622/1‑150 (MQ=255) ggCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATgg < 2:766229/150‑1 (MQ=255) ggCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATgg < 1:1206578/150‑1 (MQ=255) ggCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATgg < 2:1811168/150‑1 (MQ=255) ccAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGcc < 2:724070/150‑1 (MQ=255) aaCCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCg > 2:1463983/1‑150 (MQ=255) aGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTAGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTgg > 2:948056/1‑150 (MQ=255) agagCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGa < 1:618919/150‑1 (MQ=255) agagCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGa < 1:836354/150‑1 (MQ=255) | GCATCCAGGCAGGATAAAAGGAGCCTCAAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGA > NC_002947/2302189‑2302481 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |