New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2302335 = | 78 (1.050) | 6 (0.080) | 6/242 | NT | 7.7% | coding (606/654 nt) | PP_5497 | rhs repeat‑associated core domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 2302364 = | 70 (0.990) | coding (635/654 nt) | PP_5497 | rhs repeat‑associated core domain‑containing protein |
AAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTGGGGGCGCTTCGCACC > NC_002947/2302216‑2302509 | atcacagccaaatcgccgggccatgttgcggcactctgcgaccggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGt > 1:548055‑M1/120‑150 (MQ=255) aaCCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑a > 2:1178049/1‑150 (MQ=255) aCCACTGCTGCGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑aa > 1:1036662/1‑150 (MQ=255) ccACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGACCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑aaa < 1:1193685/150‑1 (MQ=255) cGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGtt < 1:937637/150‑1 (MQ=255) cGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCACCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGtt < 1:1315309/150‑1 (MQ=255) tCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGACCGATCCCTTCCCGCCCAATCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTa > 1:233379/1‑150 (MQ=255) tCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTa > 2:298956/1‑150 (MQ=255) tGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGatcatc < 2:844301/150‑1 (MQ=255) gCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGACGACGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGAtcatca > 1:1076940/1‑150 (MQ=255) cATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCaa < 2:1674147/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAg > 1:766229/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAg < 1:1888791/150‑1 (MQ=255) tCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAgg > 2:1922222/1‑150 (MQ=255) tCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAgg > 2:323680/1‑150 (MQ=255) cAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGt < 2:1721801/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAATGATCGACGCGCTTCTGCATCCGAATGCGTCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcgg > 1:1892982/1‑150 (MQ=255) ggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑aaa < 1:1485110‑M1/34‑1 (MQ=255) ggtccggcaaggcagctcccacaatgaaccgaaccgcaaacccttgatgatcgtgcttaaaaccattctgctttacGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑aaa > 2:1485110‑M1/77‑110 (MQ=255) cGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAgg > 2:221088/1‑140 (MQ=255) cGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAgg < 1:221088/140‑1 (MQ=255) cGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggtt < 1:1010519/150‑1 (MQ=255) gCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggttc > 2:10018/1‑150 (MQ=255) gCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggttc < 1:1149387/150‑1 (MQ=255) aaTGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGcggttcggt > 2:618919/1‑150 (MQ=255) aTCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCAt < 2:1257179/150‑1 (MQ=255) tCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCAtt > 1:218848/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATtgtg < 1:354516/150‑1 (MQ=255) cgcgCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTgg < 1:1328579/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCa < 2:296301/99‑1 (MQ=255) gcgcTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCa > 1:296301/1‑99 (MQ=255) cTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGc < 2:1603255/150‑1 (MQ=255) tGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCCGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTgg < 2:1121453/142‑1 (MQ=255) tGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTgg > 1:1121453/1‑142 (MQ=255) tCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGa < 2:1394288/140‑1 (MQ=255) tCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGa > 1:1394288/1‑140 (MQ=255) tCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGc > 1:15091/1‑150 (MQ=255) cGAACAATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCg < 2:9900/150‑1 (MQ=255) gAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTAAGGTTCATGTTGGGAGCTGCCTTGCCgg > 2:1883962/1‑150 (MQ=255) gAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGC‑CCGCAGAGGCTTCGGAGTAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCgg > 2:543703/1‑150 (MQ=255) gAACGATCCCTTCCCGCCAAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCgg > 2:603536/1‑150 (MQ=255) 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cccGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCg > 1:1624437/1‑142 (MQ=255) cccGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCg < 2:1624437/142‑1 (MQ=255) gCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAggg > 1:1864102/1‑150 (MQ=255) gCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAggg < 1:1786480/150‑1 (MQ=255) ccAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGCGACGCTTTTGCTGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGcc < 2:1892982/150‑1 (MQ=255) 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gcagccgtgaagccgactgagcgggctgcGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGc > 1:1198634‑M2/30‑150 (MQ=255) agccgtgaagccgactgagcgggctgcGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGc > 1:1356710‑M2/28‑68 (MQ=255) agccgtgaagccgactgagcgggctgcGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGc < 2:1356710‑M2/41‑1 (MQ=255) GCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGaa > 2:701356‑M1/1‑150 (MQ=255) CCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAg < 1:852285‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGAATAGTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAg < 1:126094‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGa < 1:120549‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGa > 2:120549‑M1/1‑150 (MQ=255) gTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTggg < 2:218848/150‑1 (MQ=255) gTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTggg < 2:1330874/150‑1 (MQ=255) tCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTgggg > 1:1719389/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTgggg < 1:1922222/150‑1 (MQ=255) cGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGGTCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTggggg < 2:1884774/150‑1 (MQ=255) acTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGCGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTGGGGgcg > 2:471136/2‑150 (MQ=255) cACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTGGGGGCGCTTc < 1:784629/150‑1 (MQ=255) aCGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGa < 2:760581/134‑1 (MQ=255) aCGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGa > 1:760581/1‑134 (MQ=255) ggctgcGT‑AAAGCAGAATGGTTTTACGCAGAGGCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTGGGGGCGCTTCGCa > 1:989044‑M2/7‑150 (MQ=255) ctgcGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTGGGGGCGCtt > 2:1444143‑M2/5‑144 (MQ=255) ctgcGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTGGGGGCGCtt < 1:1444143‑M2/140‑1 (MQ=255) ctgcGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTGGGGGCGCTTCGCAcc > 1:219586‑M2/5‑150 (MQ=255) | AAACCACTGCTGAGCGGTCCACAAGGTGATGCATCCAGTGCAACGCCAATGATCGACGCGCTTCTGAATCCGAACGATCCCTTCCCGCCCAAGCCAGGGCCAACCGAGGCAGTCGCAGAGCAGCCCGCTCAGTCGGCTTCACGGCTGCGT‑AAAGCAGAATGGTTTTAAGCACGATCATCAAGGGTTTGCGGTTCGGTTCATTGTGGGAGCTGCCTTGCCGGACCGGTCGCAGAGGGCCGCAACATGGCCCGGCGATTTGGCTGTGATGCGAAGACCCTGGGGGCGCTTCGCACC > NC_002947/2302216‑2302509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |