New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3013109 = | 87 (1.170) | 5 (0.070) | 5/246 | NT | 5.6% | coding (302/708 nt) | PP_2634 | cellulose synthase |
? | NC_002947 | 3013135 = | 83 (1.150) | coding (328/708 nt) | PP_2634 | cellulose synthase |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCTGGATACGTCCGAGGGCTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTC > NC_002947/3012960‑3013257 | gCTGGATACGTCCGAGGGCTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGAGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATg > 2:1809002/1‑150 (MQ=255) tcgaagtgctcgagcggacgtcgcccgagcagcaggtggctggccatttcggcttctgccaccagtacccgtacatcagtctcgatgccattgccggtggtctcgcccggcaattgcggcaggtcgtacaacagccagtcgaaatgctcg > 1:904108‑M1/150‑150 (MQ=255) tcgaagtgctcgagcggacgtcgcccgagcagcaggtggctggccatttcggcttctgccaccagtacccgtacatcagtctcgatgccattgccggtggtatcgcccggcaattgcggcaggtcgtacaacagccagtcgaaatgctcg > 1:383743‑M1/150‑150 (MQ=255) tGGATACGTCCGAGGGCTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGc < 1:936200/150‑1 (MQ=255) tGGATACGTCCGAGGGCTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGc < 1:597802/150‑1 (MQ=255) cctgctgctcgggcgacgtccgctcgagcagcaggtggctggccatttcggcttctgccaccagtacccgtacatcagtctcgatgccattgccggtggtatcgcccggcaattgcggcaggtcgtacaacagccagtcgaaatgctcgg < 1:1764118‑M1/2‑1 (MQ=255) aagtgctcgagcggacgtcgcccgagcagcaggtggctggccatttcggcttctgccaccagtacccgtacatcagtctcgatgccattgccggtggtatcgcccggcaattgcggcaggtcgtacaacagccagtcgaaatgctcGGcc < 2:129065‑M1/4‑1 (MQ=255) aagtgctcgagcggacgtcgcccgagcagcaggtggctggccatttcggcttctgccaccagtacccgtacatcagtctcgatgccattgccggtggtatcgcccggcaattgcggcaggtcgtacaacagccagtcgaaatgctcGGcc < 2:1710084‑M1/4‑1 (MQ=255) aCGTCCGAGGGCTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGCGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTCTGCCCGATTCGCAGTCATGGCCCGCt > 2:619225/1‑150 (MQ=255) gTCCGAGGGCTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCg > 2:1571256/1‑150 (MQ=255) tCCGAGGGCTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑c < 1:640045/150‑1 (MQ=255) gAGGGCTGGGCGCTGGCCGATCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTCCCCTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAg < 1:589189/150‑1 (MQ=255) gAGGGCTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAg > 1:614966/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGa < 1:885484/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGa < 1:1751367/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGa < 2:1652875/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCTGGCCGAGCGGGAAGGGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGa > 1:1652296/1‑150 (MQ=255) gggCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CTAGGTCGAGc < 2:1519552/150‑1 (MQ=255) 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2:197180/121‑1 (MQ=255) cagcaCCGCGCGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGaa < 1:1271885/150‑1 (MQ=255) agcaCCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAg < 2:1233919/150‑1 (MQ=255) gcaCCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGc < 2:1831893/150‑1 (MQ=255) gcaCCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGc > 1:1831893/1‑150 (MQ=255) gcaCCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGc > 1:1836462/1‑150 (MQ=255) ccGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGa < 2:1009504/150‑1 (MQ=255) ccGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGa < 2:1473800/150‑1 (MQ=255) gtgtGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGaaa < 1:1862545/150‑1 (MQ=255) tgCCTGATGCGCAGTCATGGCCCACTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGTATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATgg < 2:1047231/150‑1 (MQ=255) gCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGgc < 1:1415043/150‑1 (MQ=255) gCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGAGGGACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGgc < 1:1809002/150‑1 (MQ=255) cccGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGgcc > 2:1865596/1‑150 (MQ=255) ccGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGgcca < 2:389975/150‑1 (MQ=255) aaatgctcGGCCAGCTCGACCTGG‑CGAGCGGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACgg < 2:1878841‑M1/107‑1 (MQ=255) aaatgctcGGCCAGCTCGACCTGG‑CGAGCGGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACgg > 1:1878841‑M1/9‑115 (MQ=255) aGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACctgc > 2:580626/1‑150 (MQ=255) cATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCtgctgc < 1:1485844/150‑1 (MQ=255) cATGGCCCGCCCC‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCATCGGCAATGGCATCGAGACTGATCTACGCGTACTGTTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCtgctgc < 1:1571256/150‑1 (MQ=255) tGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTc > 2:769106/1‑150 (MQ=255) | GCTGGATACGTCCGAGGGCTGGGCGCTGGCCGAGCGGGAA‑GGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTC > NC_002947/3012960‑3013257 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |