New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3013109 = | 87 (1.170) | 5 (0.070) | 5/246 | NT | 5.6% | coding (302/708 nt) | PP_2634 | cellulose synthase |
? | NC_002947 | 3013135 = | 83 (1.150) | coding (328/708 nt) | PP_2634 | cellulose synthase |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TGGCCGAGCGGGAAGGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTCCGCTCGAGCACTTCGA > NC_002947/3012986‑3013283 | tGGCCGAGCGGGAAGGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCg < 2:376031/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGCGGGAAGGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGACGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCACTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGa > 1:1047231/1‑150 (MQ=255) agcagcaggtggctggccatttcggcttctgccaccagtacccgtacatcagtctcgatgccattgccggtggtatcgcccggcaattgcggcaggtcgtacaacagccagtcgaaatgctcGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGa > 2:1071067‑M1/123‑150 (MQ=255) 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tggccatgtcggcttctgccaccagtacccgtacatcagtctcgatgccattgccggtggtatcgcccggcaattgcggcaggtcgtacaacagccagtcgaaatgctcggcccgctcgccaggtcgagctggccGAGCATTTCGACTgg < 1:608967‑M2/15‑1 (MQ=255) cggcCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCtg < 1:1578037/150‑1 (MQ=255) gcCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCtgtt < 1:1322757/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTa < 1:723232/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTa > 1:1032843/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) tGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTc > 2:769106/1‑150 (MQ=255) GCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGGCCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGATATAAGACGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCgg > 1:449442‑M1/1‑150 (MQ=255) gccagctcgacctggcgagcgggccGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCgg > 1:1551154‑M2/26‑150 (MQ=255) CCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTGGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCCGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGc < 1:300615‑M1/150‑1 (MQ=255) cGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑g > 2:1784812/1‑150 (MQ=255) gCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCgg > 1:1280957/1‑64 (MQ=255) cTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GAc > 1:1035204/1‑150 (MQ=255) cTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GAc < 2:1032843/150‑1 (MQ=255) cTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATCTCGACTGACTGTTGCACGCCCTCCCGTAATTGACGGGCGATACCACCGGCCATGGCATCGCGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGCAGCCGAAATGGCCAGCCCAGTGCTGATCGGGC‑GAc < 2:748226/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATATCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTcc < 1:249004/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTcc < 2:1225031/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTcc < 2:1395924/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTc < 1:1585346/135‑1 (MQ=255) gTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTc > 2:1585346/1‑135 (MQ=255) gAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCgaga < 1:1727529/79‑1 (MQ=255) gAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTCCGCTCGAg > 1:451423/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGAGCGGACGTcgcccgag < 1:729145/150‑8 (MQ=255) tGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTCCGCTCGAGCACt > 2:1600095/1‑150 (MQ=255) ggccGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTCCGCTCGAGCACtt < 2:129065‑M2/146‑1 (MQ=255) ggccGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTCCGCTCGAGCACtt < 2:1710084‑M2/146‑1 (MQ=255) ccGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGAGCGGACGT‑CGCCcgagcagcagg < 1:1764118‑M2/148‑6 (MQ=255) cGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTCCGCTCGAGCACTTCGa > 1:383743‑M2/2‑150 (MQ=255) cGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGAGACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTCCGCTCGAGCACTTCGa > 1:904108‑M2/2‑150 (MQ=255) | TGGCCGAGCGGGAAGGGCGGCCGTTCAGCGATGCCGTGTACGAGGTGCTCGATGGCCTGTGCCTGCTGCCGTACGGCAACCTGCCTGGCGGTGCGCAGCACCGTGTGCCCGATGCGCAGTCATGGCCCGCTCG‑CCAGGTCGAGCTGGCCGAGCATTTCGACTGGCTGTTGTACGACCTGCCGCAATTGCCGGGCGATACCACCGGCAATGGCATCGAGACTGATGTACGGGTACTGGTGGCAGAAGCCGAAATGGCCAGCCACCTGCTGCTCGGGC‑GACGTCCGCTCGAGCACTTCGA > NC_002947/3012986‑3013283 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |