| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4775655 | 72 (1.020) | coding (3657/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
AGTCGGCGTATTGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTG > NC_002947/4775498‑4775795 | aGTCGGCGTATTGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCT < 2:1023360‑M1/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGTATTGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTg < 1:1612751/150‑1 (MQ=255) gtcGTATTGCACCGCCAGCGCGGGCCGTGCAGCGGTCTGCCCATTACCTTAGCCCTGGTATAGCGACACGGGCGGGTAGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGc < 2:470759/148‑1 (MQ=255) ttGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAag > 2:626730‑M2/1‑148 (MQ=255) ttGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAag > 1:7000‑M2/1‑148 (MQ=255) cACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAaggcg < 1:353744‑M2/150‑6 (MQ=255) aCCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAaggcgc < 1:600545‑M2/150‑7 (MQ=255) gCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCaaa < 1:838317/150‑1 (MQ=255) 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ccTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGt < 1:1844567/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGt < 1:1270617/150‑1 (MQ=255) cTtgaggcccaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatcaccgatggctggtcgatggcggtgctggtcaacgagctcgtggcgctgtaccagggctatcgtcatgggcaggccgtcgaactgcccgcgctggcggtgcaa > 1:7000‑M1/1‑2 (MQ=255) cTtgaggcccaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatcaccgatggctggtcgatggcggtgctggtcaacgagctcgtggcgctgtaccagggctatcgtcatgggcaggccgtcgaactgcccgcgctggcggtgcaa > 2:626730‑M1/1‑2 (MQ=255) cTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGgc < 1:1042891/119‑1 (MQ=255) cTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGgc > 2:1042891/1‑119 (MQ=255) | AGTCGGCGTATTGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTG > NC_002947/4775498‑4775795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |