| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4775647 | 73 (0.980) | 8 (0.110) | 6/240 | NT | 10.2% | coding (3665/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
| ? | NC_002947 | = 4775655 | 72 (1.020) | coding (3657/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
TTGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTGAATCACCTG > NC_002947/4775508‑4775804 | ttGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAag > 2:626730‑M2/1‑148 (MQ=255)ttGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAag > 1:7000‑M2/1‑148 (MQ=255) cACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAaggcg < 1:353744‑M2/150‑6 (MQ=255) aCCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAaggcgc < 1:600545‑M2/150‑7 (MQ=255) gCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCaaa < 1:838317/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCaaa < 1:1815577/150‑1 (MQ=255) cAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCCTGACGAAAGCCCTTGTACAGCGCGACGAGCTCGTGGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGCCCTGCTCTGGTGCAGGTCCATCACCAGTACGCGCTCCTGTTCCTCTTTGTGCAAAAg < 2:414478/150‑1 (MQ=255) cAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAg < 1:621770/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGCGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGt > 2:1871020/1‑150 (MQ=255) gggCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAAc > 1:22261/1‑150 (MQ=255) gggCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAAc > 1:1885118/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAAcgc > 1:1075459/1‑150 (MQ=255) ttCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGAt > 2:1086701/1‑150 (MQ=255) ttCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGAt < 1:1756677/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTg < 1:1119541/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTgg < 1:1584011/150‑1 (MQ=255) cccATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGtt > 1:535849/1‑150 (MQ=255) aTGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCaaaa < 1:667580/122‑1 (MQ=255) aTGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCaaaa > 2:667580/1‑122 (MQ=255) aTGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGAc > 2:127765/1‑150 (MQ=255) aCGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTAACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTATTACAGGTTCATCACCAGCAGATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAg < 1:600637/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGaa < 2:1075459/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGaa < 2:1542343/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGaa < 2:1885118/150‑1 (MQ=255) cccTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAg < 1:654534/150‑1 (MQ=255) cccTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGACCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAg < 2:1144551/150‑1 (MQ=255) ccTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACTAGGTCGAAgg < 1:792539/150‑1 (MQ=255) ccTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAgg < 1:1019274/150‑1 (MQ=255) ccTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCAGTTGACCAGGTCGAAgg < 1:543264/150‑1 (MQ=255) ggTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGtt < 1:1679897/150‑1 (MQ=255) gTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTc > 2:1084387/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCACAAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACg > 2:808380/1‑150 (MQ=255) aGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACgg < 2:457425/150‑1 (MQ=255) aGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACgg < 1:1017885/150‑1 (MQ=255) aGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGCGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACgg < 1:1871020/150‑1 (MQ=255) gcgcCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACggg < 1:1854752/150‑1 (MQ=255) gcgcCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACggg > 1:812587/1‑150 (MQ=255) gAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTg > 2:115373/1‑150 (MQ=255) gAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTg > 1:1329295/1‑150 (MQ=255) 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cAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTgcgc > 1:192999/1‑150 (MQ=255) aTGCGCCTGGGCCTCAaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatcaccgatggctggtcgatggcggtgctg < 1:905047‑M2/81‑66 (MQ=255) aTGCGCCTGGGCCTCAaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatcaccgatggctggtcgatggcggtgctg > 2:905047‑M2/1‑16 (MQ=255) aTGCGCCTGGGCCTCAaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatcaccgatggctggtc < 1:1004924‑M2/68‑53 (MQ=255) aTGCGCCTGGGCCTCAaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatcaccgatggctggtc > 2:1004924‑M2/1‑16 (MQ=255) aTGCGCCTGGGCCTCAaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatca > 1:1030495‑M2/1‑16 (MQ=255) aTGCGCCTGGGCCTCAaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatca < 2:1030495‑M2/55‑40 (MQ=255) aTGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATACACCCTGCGCCTCggg > 1:543316/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTGGGCCTCAaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatcaccgatggctggtcgat > 2:143410‑M2/1‑15 (MQ=255) tGCGCCTGGGCCTCAaggcgcatgtgctggtgatgaacctgcaccacatcatcaccgatggctggtcgat < 1:143410‑M2/70‑56 (MQ=255) gcCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCg > 1:1816973/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGt < 1:1270617/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGt < 1:1844567/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGgc > 2:1042891/1‑119 (MQ=255) cTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGgc < 1:1042891/119‑1 (MQ=255) ccTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCCTGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTGAATCa > 2:439928/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTGAATCAc > 1:621468/1‑150 (MQ=255) tCANGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTGAATCAcc > 2:1195665/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCgg > 1:1260749/1‑136 (MQ=255) tCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCgg < 2:1260749/136‑1 (MQ=255) tCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTGAATCAcc < 2:1431238/150‑1 (MQ=255) cAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTGAATCACCt > 1:907033/1‑150 (MQ=255) aaGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTGAATCACCTg < 1:523659/150‑1 (MQ=255) | TTGCACCGCCAGCGCGGGCAGTTCGACGGCCTGCCCATGACGATAGCCCTGGTACAGCGCCACGAGCTCGTTGACCAGCACCGCCATCGACCAGCCATCGGTGATGATGTGGTGCAGGTTCATCACCAGCACATGCGCCTGGGCCTCAAGGCGCAAAAGGTCAACGCGGATCAGTGGGCCGTTGACCAGGTCGAAGGGTTCACGGGCCAACTGCTCGACCGTGGCCTGCAATTCGACAGCATCGACATCCGCCTGGCGCAGGCATGCACCCTGCGCCTCGGGGGCGTGAATCACCTG > NC_002947/4775508‑4775804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |