| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ACAAATCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCAT > NC_002947/4848674‑4848972 | aCAAATCAACACAGTTTCCTACAGACGACCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCA > 1:127784‑M1/1‑150 (MQ=255) cAAATCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCaa < 2:1781513/150‑1 (MQ=255) aaaTCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAAc > 1:1016937/1‑150 (MQ=255) acacAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGt > 2:1701544/1‑150 (MQ=255) acacAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGt > 2:1905478/1‑150 (MQ=255) cacaGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTg > 1:1457566/1‑150 (MQ=255) acaGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACTCGCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGc < 1:962764/150‑1 (MQ=255) acaGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGc > 2:1389764/1‑150 (MQ=255) gTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAAc < 1:1389764/150‑1 (MQ=255) tttCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTATGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACt > 2:1080478/1‑150 (MQ=255) tACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGcaca > 2:329122/1‑150 (MQ=255) aCGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGCGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAg < 1:439029/150‑1 (MQ=255) ccATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgg < 1:1419927‑M1/150‑29 (MQ=255) ccATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgg < 2:1742271‑M1/150‑29 (MQ=255) ccATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgg > 2:30976‑M2/1‑147 (MQ=255) aTAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGCCCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggt > 2:832484‑M2/1‑145 (MQ=255) aTAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggt < 1:142975‑M2/150‑6 (MQ=255) aTAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCGCCGTTGGGATACCGACCTGATACGCCCCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggt < 1:1875310‑M2/150‑6 (MQ=255) 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(MQ=255) cccAACCGCCGTGCAACGGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGt > 1:1097548/1‑150 (MQ=255) ccAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagtctatgg > 2:30976‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgag < 2:510723‑M1/58‑56 (MQ=255) ccAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgag > 1:510723‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagtctatgg < 2:1742271‑M2/150‑123 (MQ=255) ccAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagtctatgg < 1:1419927‑M2/150‑123 (MQ=255) ccAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtc > 2:1387731/1‑150 (MQ=255) aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagc < 1:1773194‑M2/64‑39 (MQ=255) aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagc > 2:1773194‑M2/1‑26 (MQ=255) aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGGGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtca > 2:71570/1‑149 (MQ=255) aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGGGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtca < 1:71570/149‑1 (MQ=255) aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtcat > 2:1032000/1‑150 (MQ=255) | ACAAATCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCAT > NC_002947/4848674‑4848972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |