| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4848823 | 71 (0.950) | 5 (0.070) | 4/244 | NT | 6.3% | coding (78/1383 nt) | hemN | oxygen‑independent coproporphyrinogen III dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 4848848 | 81 (1.130) | coding (103/1383 nt) | hemN | oxygen‑independent coproporphyrinogen III dehydrogenase | |||||
CCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGACCGCGCCCGCG > NC_002947/4848702‑4848992 | ccATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgg > 2:30976‑M2/1‑147 (MQ=255) aTAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGCCCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggt > 2:832484‑M2/1‑145 (MQ=255) aTAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggt < 1:142975‑M2/150‑6 (MQ=255) aTAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCGCCGTTGGGATACCGACCTGATACGCCCCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggt < 1:1875310‑M2/150‑6 (MQ=255) aCTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGgttcgt > 1:1127318/1‑150 (MQ=255) cTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGgttcgtt < 1:1701544/150‑1 (MQ=255) tCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGgttcgttc < 1:597258/150‑1 (MQ=255) tCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGgttcgttc > 1:1232964/1‑150 (MQ=255) tCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACAATCTTGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGgttcgttc > 1:1095977/1‑150 (MQ=255) cGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGa > 1:867946/1‑150 (MQ=255) ggTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGAc < 1:1049248/150‑1 (MQ=255) cACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGc < 2:1232964/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCt > 1:883593/1‑150 (MQ=255) tgctCTTTGCAAGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGAGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACg > 2:1506045/1‑150 (MQ=255) ctctTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGcc > 1:1487122/1‑150 (MQ=255) tttCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTg > 1:1874183/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTgc < 2:609459/150‑1 (MQ=255) ttCCGGGGACTACCCGCATGCTCGCCGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGAACTCAGGCTTCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTgc < 1:329122/150‑1 (MQ=255) gggACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCgag > 1:1634338/1‑150 (MQ=255) ggACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTATGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCgaga < 1:1080478/150‑1 (MQ=255) aCTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGATGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGc < 2:1784444/150‑1 (MQ=255) tACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCg > 2:212035/1‑150 (MQ=255) ccTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTTTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGAc > 1:1671288/1‑121 (MQ=255) ccTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGAc < 2:1671288/121‑1 (MQ=255) ccTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACg > 1:1423907/1‑150 (MQ=255) ccTCATGCTCGACGACCTCCGTGGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACg > 2:762884/1‑150 (MQ=255) cTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACgg < 2:1127318/150‑1 (MQ=255) tCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAAGGTCACAGCGAGGTGGGCTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACggg > 1:19464/1‑150 (MQ=255) gacgacCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTgcgc > 2:1802924/1‑150 (MQ=255) cgacCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGccc < 2:142975/150‑1 (MQ=255) gacCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcg > 2:196511/1‑150 (MQ=255) gacCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcg > 1:1300239/1‑150 (MQ=255) acCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgc < 2:127784/150‑1 (MQ=255) ccTCCGTTGGGATACCGACCTGATCGGGCACTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgct > 1:347816/1‑150 (MQ=255) 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aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGGGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtca > 2:71570/1‑149 (MQ=255) aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGGGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtca < 1:71570/149‑1 (MQ=255) aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtcat > 2:1032000/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtcatc < 1:1802924/150‑1 (MQ=255) cgccgTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCAc > 1:103840/1‑150 (MQ=255) aaCTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtc < 2:69087/137‑1 (MQ=255) aaCTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtc > 1:69087/1‑137 (MQ=255) aaCTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGAcc > 2:317858/1‑150 (MQ=255) tGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGAccgcg > 1:1337768/1‑150 (MQ=255) gCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCt > 1:930831/1‑107 (MQ=255) gCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCt < 2:930831/107‑1 (MQ=255) cacaGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCACCGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGAccgcgcc < 2:883593/150‑1 (MQ=255) acaGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGAccgcgccc < 2:1874183/150‑1 (MQ=255) gCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCAt > 2:1872600/1‑80 (MQ=255) gCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCAt < 1:1872600/80‑1 (MQ=255) gCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGAccgcgcccgcg > 2:1867872/1‑150 (MQ=255) | CCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCATCACCAAAGACCGCGCCCGCG > NC_002947/4848702‑4848992 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |