| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5228684 | 78 (1.050) | 9 (0.120) | 9/248 | NT | 11.4% | coding (423/2391 nt) | PP_4606 | ferric siderophore receptor |
| ? | NC_002947 | = 5228712 | 64 (0.880) | coding (395/2391 nt) | PP_4606 | ferric siderophore receptor | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATAACCGTGTCGGATGTGCCGCCGAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCA > NC_002947/5228535‑5228832 | aTAACCGTGTCGGATGTGCCGCCGAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCTCTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCACCGAGTTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCC > 1:1774375‑M1/1‑150 (MQ=255)aTAACCGTGTCGGATGTGCCGCCGAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTGGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCC > 1:1409955‑M1/1‑150 (MQ=255)aTAACCGTGTCGGATATGCCGCCGAAGTTGTTGCCCACAGTCATGAAACCAACTTTGTCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCC > 1:1774540‑M1/1‑150 (MQ=255) tCGGATGTGCCGCCGAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCgcgc > 1:1255149/1‑150 (MQ=255) ggATGTGCCGCCGAAGTTGTTGCCCCGGGTAAGGCCCCGGACGTTGGCCAGGGC‑ATCTTCGAGGGTGCGCGGGGCCTGGGCGCCGGTGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGCTGTCGTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCAt < 2:845470/150‑1 (MQ=255) gtgCCGCCGAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTGCCACGTGGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGAta > 2:728947/1‑149 (MQ=255) gtgCCGCCGAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATc < 1:508320/150‑1 (MQ=255) tgCCGCCGAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑ACCTGGCCGAGCATGATCg > 2:107540/1‑150 (MQ=255) ccgccgAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGGGCGGGCTATC‑TCTAGGGTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGaa > 1:1774359/1‑150 (MQ=255) ccgccgAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGaa > 2:278150/1‑150 (MQ=255) ccgccgAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGaa < 2:1774359/150‑1 (MQ=255) gccgAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCcggccagcgcttcgatcatg > 1:1785958‑M1/1‑130 (MQ=255) gccgAAGGTGTTGCCCTGGGTAAGGCGACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAgc < 1:1835192/150‑1 (MQ=255) gAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCt > 2:572835/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATCCCCTCGGCCGGTACCACATGACCTGCCTGGCATTGTTCGGGGGTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCt < 1:331239/150‑1 (MQ=255) aaGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTg < 2:1749318/150‑1 (MQ=255) gttgttGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTATTGTTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGc > 1:577138/1‑150 (MQ=255) ttgttgCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGcc > 1:612448/1‑150 (MQ=255) ttgCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGaa > 1:848336/1‑138 (MQ=255) ttgCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGaa < 2:848336/138‑1 (MQ=255) ttGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgg > 2:1396059‑M2/1‑148 (MQ=255) tGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGggg < 2:296221‑M2/150‑4 (MQ=255) cccTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCcggccagcgcttcgatcatgcgcggccagggcc < 2:1785958‑M1/150‑34 (MQ=255) ccTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCcggccagcgcttcgatcatgcgcggccagggccc < 1:1608493‑M1/150‑35 (MQ=255) ccTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCt > 2:1746958/1‑150 (MQ=255) cTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTg > 2:190282/1‑150 (MQ=255) cTGGGTAATGACCCTGACGCCCGCGAGCGC‑ATCAGCGAGGGTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTg < 2:1852198/150‑1 (MQ=255) cTGGCTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTCCCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATCATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTg < 2:947529/150‑1 (MQ=255) tGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTgg < 2:1579504/150‑1 (MQ=255) tGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTgg > 1:1579504/1‑150 (MQ=255) ggTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGCGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTa < 1:1647134/150‑1 (MQ=255) tccACTGACGTTGGCCAGTGC‑AGCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTa < 2:521010/149‑1 (MQ=255) gCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAgcg < 2:1808283/127‑1 (MQ=255) gCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAgcg > 1:1808283/1‑127 (MQ=255) gCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTa < 1:1579514/150‑1 (MQ=255) aCTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCCGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAgtc > 1:570748/1‑150 (MQ=255) tGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAgtcgt > 1:14578/1‑150 (MQ=255) aGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAg < 2:612448/150‑1 (MQ=255) atcatcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCAc > 1:785301/1‑150 (MQ=255) atcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTg < 2:608264/106‑1 (MQ=255) atcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTg > 1:608264/1‑106 (MQ=255) atcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggt > 2:1784643/1‑150 (MQ=255) atcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggt > 1:504115/1‑150 (MQ=255) tcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggtg > 2:401266/1‑150 (MQ=255) tcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggtg > 2:1585335/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCCGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggtggt < 2:570748/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGCGGGGGGCCTGGGCGGGGATGCCGTGCGCCGGTGCCGCGTTGCTGGGCTGGGGGCTGTCCTGGTGCGGG‑CGCGGGGCGCTCATGAGCGAAGCGCTGGCGGGGGGTTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggtggt < 2:608153/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGc > 1:375196/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGAAACGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGCCGTCCAGTTGCGAGGTCCCGGGGGTGGc > 1:50932/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGTGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGcc < 1:278150/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGc > 1:458304/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGc < 2:458304/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGa < 1:296221/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGa < 2:1774540/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGa < 2:1774375/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGa < 1:1255920/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTTCCTGGGGGATGGCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAg < 1:629934/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAg < 2:785301/150‑1 (MQ=255) gTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGc > 2:495799/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCt > 2:1900169/1‑150 (MQ=255) gATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCCcggccagcgcttcgatcatgcgcggccagggcccgaacca < 2:1206526‑M1/96‑41 (MQ=255) gATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCCcggccagcgcttcgatcatgcgcggccagggcccgaacca > 1:1206526‑M1/1‑56 (MQ=255) gATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGa < 2:14578/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTAGGG‑CCCTGGCCGCGCATTACCGAAGCGGTTGCCGTGGGCGGTTTTCGGTAGTCGTCCATGTGCTAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAg < 2:1654811/150‑1 (MQ=255) gACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGgt < 2:1255149/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGGTCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCGAGTTGCGAGGTCAGGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTGCGGAGgtgt > 1:658673/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGgtgt > 1:285810/1‑150 (MQ=255) cTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCcggccagcgcttcgatcatgcgcggccagggc < 1:1872743‑M1/81‑33 (MQ=255) cTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCcggccagcgcttcgatcatgcgcggccagggc > 2:1872743‑M1/1‑49 (MQ=255) ggCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGa > 1:1530385/1‑141 (MQ=255) ggCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGa < 2:1530385/141‑1 (MQ=255) gTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGtt > 1:644977/1‑150 (MQ=255) tACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTc < 2:577138/150‑1 (MQ=255) cACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAg < 1:599882/150‑1 (MQ=255) cACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAg < 2:1409955/150‑1 (MQ=255) gTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGgtg < 1:1243276/133‑1 (MQ=255) gTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGgtg > 2:1243276/1‑133 (MQ=255) gATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAg < 1:306874/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAgg < 1:190282/150‑1 (MQ=255) cTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCcggccagcgcttcgatcatgcgcggcca > 2:1895431‑M1/1‑25 (MQ=255) cTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCcggccagcgcttcgatcatgcgcggcca < 1:1895431‑M1/53‑29 (MQ=255) taggggATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGGCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGGGGTGGCCGGCAGGCTAAGGGCTGCGGCGGGGGCTGGTGGATCGAGGGGCAGGCTagtc > 2:271138/3‑147 (MQ=255) ggggATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGc < 1:572835/150‑1 (MQ=255) ggATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCGGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGt > 1:1787113/1‑150 (MQ=255) tCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGAcg > 1:1447414/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGAcgc > 2:1165912/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGATAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGAcgc > 2:751562/1‑150 (MQ=255) tGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGggggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatc > 1:1206526‑M2/1‑40 (MQ=255) tGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGggggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatc < 2:1206526‑M2/96‑57 (MQ=255) tGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACgcgg > 1:1153530/1‑150 (MQ=255) tGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAAGGTCCGTGCGTCGACgcgg > 2:900340/1‑150 (MQ=255) ggg‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatccgcgaccaggccccgcgcaacctcgatgatgccctggccaacgtcagtggcattacccagg < 1:1608493‑M2/150‑117 (MQ=255) ggg‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTg < 2:1339191/83‑1 (MQ=255) ggg‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTg > 1:1339191/1‑83 (MQ=255) gg‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatccgcgaccaggccccgcgcaacctcgatgatgccctggccaacgtcagtggcattacccaggg < 2:1785958‑M2/150‑118 (MQ=255) g‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccag > 2:1872743‑M2/1‑32 (MQ=255) g‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccag < 1:1872743‑M2/81‑50 (MQ=255) ccccggccagcgcttcgatcatgcgcggccagggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatccgcgaccaggccccgcgcaacctcgatgatgccctggccaacgtcagtggcattacccagggca < 2:296221‑M1/150‑148 (MQ=255) cccTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCgccaggcc > 2:1469383/1‑150 (MQ=255) cccggccagcgcttcgatcatgcgcggccagggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatccgcgaccaggccccgcgcaacctcgatgatgccctggccaacgtcagtggcattacccagggcaa > 2:1396059‑M1/1‑2 (MQ=255) | ATAACCGTGTCGGATGTGCCGCCGAAGTTGTTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGC‑ATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGG‑CCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCA > NC_002947/5228535‑5228832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |