| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5228684 | 78 (1.050) | 9 (0.120) | 9/248 | NT | 11.4% | coding (423/2391 nt) | PP_4606 | ferric siderophore receptor |
| ? | NC_002947 | = 5228712 | 64 (0.880) | coding (395/2391 nt) | PP_4606 | ferric siderophore receptor | |||||
TTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGTTGCCCAGCAGTTGTTGC > NC_002947/5228565‑5228858 | ttGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgg > 2:1396059‑M2/1‑148 (MQ=255) tGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGggg < 2:296221‑M2/150‑4 (MQ=255) ccTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCt > 2:1746958/1‑150 (MQ=255) cTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTg > 2:190282/1‑150 (MQ=255) cTGGGTAATGACCCTGACGCCCGCGAGCGCATCAGCGAGGGTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTg < 2:1852198/150‑1 (MQ=255) cTGGCTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTCCCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATCATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTg < 2:947529/150‑1 (MQ=255) tGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTgg < 2:1579504/150‑1 (MQ=255) tGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTgg > 1:1579504/1‑150 (MQ=255) ggTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGCGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTa < 1:1647134/150‑1 (MQ=255) tccACTGACGTTGGCCAGTGCAGCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTa < 2:521010/149‑1 (MQ=255) gCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTa < 1:1579514/150‑1 (MQ=255) aCTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCCGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAgtc > 1:570748/1‑150 (MQ=255) tGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAgtcgt > 1:14578/1‑150 (MQ=255) aGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAg < 2:612448/150‑1 (MQ=255) atcatcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCAc > 1:785301/1‑150 (MQ=255) atcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggt > 1:504115/1‑150 (MQ=255) atcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggt > 2:1784643/1‑150 (MQ=255) tcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggtg > 2:1585335/1‑150 (MQ=255) tcGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggtg > 2:401266/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCCGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggtggt < 2:570748/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGCGGGGGGCCTGGGCGGGGATGCCGTGCGCCGGTGCCGCGTTGCTGGGCTGGGGGCTGTCCTGGTGCGGGCGCGGGGCGCTCATGAGCGAAGCGCTGGCGGGGGGTTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACggtggt < 2:608153/150‑1 (MQ=255) gggTGGCGCGGGGCCTGGTCGCGGAGGACCGGGGCCGGTAGCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGGCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGgtggtg < 2:97620/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGc > 1:375196/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGAAACGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGCCGTCCAGTTGCGAGGTCCCGGGGGTGGc > 1:50932/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGTGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGcc < 1:278150/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGc > 1:458304/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGc < 2:458304/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGa < 1:296221/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGa < 2:1774540/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGa < 2:1774375/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGa < 1:1255920/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTTCCTGGGGGATGGCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAg < 1:629934/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAg < 2:785301/150‑1 (MQ=255) gTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGc > 2:495799/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCt > 2:1900169/1‑150 (MQ=255) gATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGa < 2:14578/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTAGGGCCCTGGCCGCGCATTACCGAAGCGGTTGCCGTGGGCGGTTTTCGGTAGTCGTCCATGTGCTAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAg < 2:1654811/150‑1 (MQ=255) gACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGgt < 2:1255149/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGGTCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCGAGTTGCGAGGTCAGGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTGCGGAGgtgt > 1:658673/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGgtgt > 1:285810/1‑150 (MQ=255) ggCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGa < 2:1530385/141‑1 (MQ=255) ggCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGa > 1:1530385/1‑141 (MQ=255) gTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGtt > 1:644977/1‑150 (MQ=255) tACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTc < 2:577138/150‑1 (MQ=255) cACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAg < 2:1409955/150‑1 (MQ=255) cACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAg < 1:599882/150‑1 (MQ=255) gTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGgtg < 1:1243276/133‑1 (MQ=255) gTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGgtg > 2:1243276/1‑133 (MQ=255) gATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAg < 1:306874/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAgg < 1:190282/150‑1 (MQ=255) taggggATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGGCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGGGGTGGCCGGCAGGCTAAGGGCTGCGGCGGGGGCTGGTGGATCGAGGGGCAGGCTagtc > 2:271138/3‑147 (MQ=255) ggggATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGc < 1:572835/150‑1 (MQ=255) ggATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCGGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGt > 1:1787113/1‑150 (MQ=255) tCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGAcg > 1:1447414/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGAcgc > 2:1165912/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGATAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGAcgc > 2:751562/1‑150 (MQ=255) tGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGggggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatc > 1:1206526‑M2/1‑40 (MQ=255) tGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGggggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatc < 2:1206526‑M2/96‑57 (MQ=255) tGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACgcgg > 1:1153530/1‑150 (MQ=255) tGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAAGGTCCGTGCGTCGACgcgg > 2:900340/1‑150 (MQ=255) gggCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatccgcgaccaggccccgcgcaacctcgatgatgccctggccaacgtcagtggcattacccagg < 1:1608493‑M2/150‑117 (MQ=255) gggCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTg > 1:1339191/1‑83 (MQ=255) gggCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTg < 2:1339191/83‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatccgcgaccaggccccgcgcaacctcgatgatgccctggccaacgtcagtggcattacccaggg < 2:1785958‑M2/150‑118 (MQ=255) gCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccag < 1:1872743‑M2/81‑50 (MQ=255) gCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccag > 2:1872743‑M2/1‑32 (MQ=255) cccTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCgccaggcc > 2:1469383/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccag < 1:1895431‑M2/53‑26 (MQ=255) tGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccag > 2:1895431‑M2/1‑28 (MQ=255) gcgcATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCa < 1:604630/74‑1 (MQ=255) gcgcATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCa > 2:604630/1‑74 (MQ=255) gcgcATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGccagcccagc < 2:1901406/150‑1 (MQ=255) cATGATCGAAGCGCTGGCCGgggcccgaaccaggacatcccccaggcaatcaacgtggtaccggcccaggtcatccgcgaccaggccccgcgcaacctcgatgatgccctggccaacgtcagtggcattacccagggcaacaacttcggc > 1:1785958‑M2/1‑20 (MQ=255) cATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGtt > 2:1785765/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAgg < 2:1164568/68‑1 (MQ=255) tCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAgg > 1:1164568/1‑68 (MQ=255) tCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGtt > 1:1556579/1‑145 (MQ=255) tCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGtt < 2:1556579/145‑1 (MQ=255) tCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGTTGCCca > 1:744734/1‑150 (MQ=255) cgcTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGTTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGTTGCCCAGCAgtt < 1:495799/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGTTGCCCAGCAgttgtt < 2:1447414/150‑1 (MQ=255) ggCCGGGGTCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGTTGCCCAGCAGttgttg > 2:1786103/1‑150 (MQ=255) gCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGTTGCCCAGCAGTTGTTGc < 2:285810/150‑1 (MQ=255) | TTGCCCTGGGTAATGCCACTGACGTTGGCCAGGGCATCATCGAGGTTGCGCGGGGCCTGGTCGCGGATGACCTGGGCCGGTACCACGTTGATTGCCTGGGGGATGTCCTGGTTCGGGCCCTGGCCGCGCATGATCGAAGCGCTGGCCGGGGGCTGGTAGCTGTAGTCGTCCAGTTGCGAGGTCACGGTGGTGGCCTGCAGGCTGAGGGCTCCGGAGGTGTCTGCTGGTTCGAGGGTCAGGGTACGTGCGTCGACGCGGCGCCAGGCCAGCCCAGCGTTGCCCAGCAGTTGTTGC > NC_002947/5228565‑5228858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |