| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5584582 = | 77 (1.030) | 5 (0.070) | 5/242 | NT | 6.9% | coding (1201/2259 nt) | parC | DNA topoisomerase IV subunit A |
| ? | NC_002947 | 5584605 = | 62 (0.870) | coding (1178/2259 nt) | parC | DNA topoisomerase IV subunit A | |||||
TCCTTCAGCAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACTCCACCAATA > NC_002947/5584434‑5584725 | tCCTTCAGCAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTAGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACgg > 1:1025896/1‑150 (MQ=255)ggccgcagttgaaaaacctgcgaaccctattggtggagtggctggagttccgcaccaataccgttcgtcgccgcctgcagcatcgtctggataaggtcgagaagcgtctgcacctgttggacggtttgctcactgcattcctcaacctgg < 2:934851‑M1/2‑1 (MQ=255) ccgcagttgaaaaacctgcgaaccctattggtggagtggctgaagctttcacatcagaccttttggcttcgcctgcagcatcgtctggataaggtcgagaagcgtctgcacctgttggacggtttgctcactgcattcctcaacctGgat > 1:1377324‑M1/147‑150 (MQ=255) ttCAGCAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACTgatg > 2:1240600/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACAGCCGGTCAGGTCCGGCTTGGGATATTCCTCGGTACGgatg > 1:204828/1‑150 (MQ=255) cgCAAGTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCCCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGTTCAGCGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGatgatg < 2:505882/149‑1 (MQ=255) aGCAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGatgatg < 2:1254088/150‑1 (MQ=255) gCAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGAtgt < 2:1526819/150‑1 (MQ=255) cAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGAtgtg > 1:1861779/1‑150 (MQ=255) cAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGAtgtg < 1:100667/150‑1 (MQ=255) cAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGAtgtg < 2:1276070/150‑1 (MQ=255) aCTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGa > 2:1210044/1‑150 (MQ=255) tCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATc < 1:886589/150‑1 (MQ=255) tCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGTGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTTGATC‑ACt > 2:813873/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACt < 2:1861779/150‑1 (MQ=255) cTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAATCGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTc < 2:1004786/150‑1 (MQ=255) cTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTc < 2:1245971/150‑1 (MQ=255) tGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCa < 1:335963/150‑1 (MQ=255) 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gcgGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGtt > 1:1305260/1‑150 (MQ=255) gcgGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGtt > 2:1804044/1‑150 (MQ=255) ggATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGa < 1:1303113/150‑1 (MQ=255) gATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACTGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAg < 1:1240600/150‑1 (MQ=255) cTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGaa < 1:1276449/150‑1 (MQ=255) tCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATg > 2:234442/1‑150 (MQ=255) tCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATg < 2:1236107/150‑1 (MQ=255) tCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATg > 1:1393644/1‑150 (MQ=255) tctcTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAg > 1:934851/1‑150 (MQ=255) tctTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGAtgt < 2:472588/118‑1 (MQ=255) tctTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGAtgt > 1:472588/1‑118 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gcgcCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGt > 2:1872628/1‑150 (MQ=255) cgcCCACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATTATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTc < 2:739250/150‑1 (MQ=255) gcaccaataccgttcgtcgccgcctgcagcatcgtctggataaggtcgagaagcgtctgcacctgttggacggtttgctcactgcattcctcaacctGgat < 1:6840‑M1/4‑1 (MQ=255) gcaccaataccgttcgtcgccgcctgcagcatcgtctggataaggtcgagaagcgtctgcacctgttggacggtttgctcactgcattcctcaacctGgat > 2:6840‑M1/98‑101 (MQ=255) gcaccaataccgttcgtcgccgcctgcagcatcgtctggataaggtcgagaagcgtctgcacctgttggacggtttgctcactgcattcctcaacctGgat < 1:941656‑M1/4‑1 (MQ=255) gcaccaataccgttcgtcgccgcctgcagcatcgtctggataaggtcgagaagcgtctgcacctgttggacggtttgctcactgcattcctcaacctGgat > 2:941656‑M1/98‑101 (MQ=255) ccAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGga < 1:1240193/99‑1 (MQ=255) 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cGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGaa < 1:85311/150‑1 (MQ=255) aaaCGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACg > 2:1304335/1‑150 (MQ=255) ttCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTAtt > 1:1123463/1‑150 (MQ=255) tCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACCGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTg < 1:234442/150‑1 (MQ=255) aTCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTg > 2:1085386/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCACCTTCAGACTATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGc > 2:628003/1‑150 (MQ=255) cTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTc < 1:1304335/150‑1 (MQ=255) cTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTcc < 1:17433/73‑1 (MQ=255) cTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTcc > 2:17433/1‑73 (MQ=255) cTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTAAGCGAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAg < 1:1260446/150‑1 (MQ=255) ttGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGc > 1:472354/1‑150 (MQ=255) tcactgcattcctcaacctGGATGATGTGGATC‑ACTTCATc > 2:970141‑M1/20‑41 (MQ=255) tcactgcattcctcaacctGGATGATGTGGATC‑ACTTCATc < 1:970141‑M1/22‑1 (MQ=255) gggATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCa > 1:1334621/1‑150 (MQ=255) gATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCt < 2:1320737/93‑1 (MQ=255) gATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCt > 1:1320737/1‑93 (MQ=255) gATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACt > 2:1107036/1‑150 (MQ=255) gATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATACAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACt > 2:1164592/1‑150 (MQ=255) atatTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACTc < 2:230070/150‑1 (MQ=255) attcctcaacctGGCTGAAGTG‑ATCCACATCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATc > 1:602327‑M1/13‑94 (MQ=255) attcctcaacctGGATGAAGTG‑ATCCACATCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATc < 2:602327‑M1/82‑1 (MQ=255) ctgTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACTCCACCAATa < 2:204828/148‑1 (MQ=255) | TCCTTCAGCAACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAGTCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATC‑ACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCG‑ACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACTCCACCAATA > NC_002947/5584434‑5584725 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |