New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5680649 = | 86 (1.150) | 4 (0.060) | 4/244 | NT | 5.3% | coding (653/720 nt) | rsmE | 16S rRNA (uracil(1498)‑N(3))‑methyltransferase |
? | NC_002947 | 5680698 = | 59 (0.820) | coding (702/720 nt) | rsmE | 16S rRNA (uracil(1498)‑N(3))‑methyltransferase |
GTCCTGCACCCGGTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATG > NC_002947/5680501‑5680791 | gTCCTGCACCCGGTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGtg > 2:979463/1‑150 (MQ=255) tCCTGCACCCGGTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGTCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGtgc > 1:1787396/1‑150 (MQ=255) ccTGCACCCGGTGGCTGAGCCGCGTATCAGCAATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGtgct < 2:1397116/150‑1 (MQ=255) ctacaccgtcggcatcattttcttcgccttcgacagccgtttccgccactggcatggcatctggcacctgttcgtcatcgctggcagcctgatgcacttcgtggcggtgtcgctctacgtgcgctagttaaaagtcgccccacaactgct < 2:686151‑M1/4‑1 (MQ=255) ctacaccgtcggcatcattttcttcgccttcgacagcagtttaagattcaggcatggcatctggcacctgtgcgtcatcgctggcagcctgatgcacttcgtggcggtgtcgatctacgtgcgctagttaaaagtcgccccacaactgct < 1:799363‑M1/4‑1 (MQ=255) cTGCACCCGGTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGGGtgctg > 1:138337/1‑150 (MQ=255) cTGCACCCGGTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGtgctg > 1:1286889/1‑150 (MQ=255) cTGCACCCGGTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGtgctg > 2:785603/1‑150 (MQ=255) cccGGTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCAc < 2:10392/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGCTGAGCCGATTATAAGCAAGGAAAAGAACAACACACTGGCCGCCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACAACTGTGCCCGCGCGTGCTGCGCAcc > 2:960730/1‑150 (MQ=255) ggTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGACCGCCACCCTGGCCTTCGTGACCGCTAGCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCga < 1:960730/150‑1 (MQ=255) tGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGTCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCgaga < 1:1674060/150‑1 (MQ=255) tGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCgaga < 1:1004634/150‑1 (MQ=255) ggCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGAc < 1:372253/150‑1 (MQ=255) ggCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGAc < 1:371793/150‑1 (MQ=255) gAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACcgcg > 2:1890620/1‑150 (MQ=255) gAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACcgcg > 2:1890541/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCgcgc < 1:1583841/150‑1 (MQ=255) 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tATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCggtggt < 1:148497/150‑1 (MQ=255) tATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCAGAACGTTGCTGTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCggtggt < 2:989289/150‑1 (MQ=255) cggaGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGATTCCCCGACGTCCGAATTCGCTCGAGCGTACTGCGCACCGAGAGCGCGCCGgtggtg > 1:1005625/4‑150 (MQ=255) aTCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGgtggtg < 1:15019/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGACACGCCCCAGGCCGCAGCGAAGCCGA‑GGTCGAACAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCggtggag > 1:1469633/1‑148 (MQ=255) tCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGtggtgg > 1:166526/1‑150 (MQ=255) cAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGTGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGgc < 1:460319/150‑1 (MQ=255) cAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGgc < 1:210553/150‑1 (MQ=255) aGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGgcg > 2:1420606/1‑150 (MQ=255) aTGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGt > 2:718206/1‑150 (MQ=255) 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gCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGc < 2:1739517/102‑1 (MQ=255) cAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTACGCGACGTGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGGCTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGc > 1:987870/1‑150 (MQ=255) aaaGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCt < 1:1305633/150‑1 (MQ=255) gccgGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGc > 1:736918/1‑150 (MQ=255) ccgGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCCCCGAGACCGAGCCGGAGGTAGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCGACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCg > 2:544515/1‑150 (MQ=255) cTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga < 2:918239/111‑1 (MQ=255) cTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga > 1:918239/1‑111 (MQ=255) ttCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCATAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGAc > 1:1174205/1‑150 (MQ=255) ttCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTAGTGGCGCTATCGGTGGCACAGCAGTTGTAGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACCCCGCCACGAAGTGCATCAGACTGCCAGCGAAGAc > 2:845342/1‑150 (MQ=255) ttCCACGCAGCACGACTTGGTCCGGGCGTTCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGATGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACCCCGCCACCAAGTGCATCAGGCTGCCAGCgacgac > 2:169263/1‑150 (MQ=255) ccACGCAGGACGCATTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGACACGTTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGa < 1:1646199/150‑1 (MQ=255) cACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTa < 1:163750/105‑1 (MQ=255) cACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTa > 2:163750/1‑105 (MQ=255) aCGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTTTGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAAc > 1:989843/1‑150 (MQ=255) aCGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAAc > 1:654375/1‑150 (MQ=255) gcagcaCGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAg < 2:1629580/150‑1 (MQ=255) caCGCCTTGGCCCTCGCTGGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGc < 1:1462381/150‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAg > 2:1569060/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGat > 2:573661/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgcc < 2:138337/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgcca < 2:736918/150‑1 (MQ=255) cccGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGAGGCAATAACGGTAGCAGAGTATTTGTGGGTCGACGTTGAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCACCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGCACAGGTGCCAGatgccat > 1:1471215/1‑150 (MQ=255) ccGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgccatg < 1:597644/150‑1 (MQ=255) | GTCCTGCACCCGGTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATG > NC_002947/5680501‑5680791 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |