New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5680649 = | 86 (1.150) | 4 (0.060) | 4/244 | NT | 5.3% | coding (653/720 nt) | rsmE | 16S rRNA (uracil(1498)‑N(3))‑methyltransferase |
? | NC_002947 | 5680698 = | 59 (0.820) | coding (702/720 nt) | rsmE | 16S rRNA (uracil(1498)‑N(3))‑methyltransferase |
CCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGACGGTGTAG > NC_002947/5680551‑5680843 | ccTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGtt > 1:1800336/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTtg > 2:706478/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTtgt < 2:1569370/150‑1 (MQ=255) ccTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTggg < 1:979463/150‑1 (MQ=255) ttCGGGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGACTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTgggg < 1:1757305/150‑1 (MQ=255) gTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGAc < 1:182176/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGT‑GGGCGACtttt < 1:718206/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCAGGCAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTa < 1:706478/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTaa < 1:1655680/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTaa < 2:699706/150‑1 (MQ=255) ccccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAAcc > 2:36518/1‑149 (MQ=255) aGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGACAAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCa < 2:310680/150‑1 (MQ=255) ccTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGGCGAGGTCGTGGCCGTAGGTGGTACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACAAGCGGACGTaga < 2:1005625/150‑1 (MQ=255) ccTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga < 1:963130/150‑1 (MQ=255) cTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAg > 2:502618/1‑139 (MQ=255) cTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAg < 1:502618/139‑1 (MQ=255) cTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTagag > 2:1041208/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGA‑GGGCGAGCAGGCCAAAGCCGCCCGATTACACCAAGCACGAGTTGTTTCGGTCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGGGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGAGacac > 1:516131/1‑150 (MQ=255) gA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAgcgc > 2:465855/1‑130 (MQ=255) gA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAgcgc < 1:465855/130‑1 (MQ=255) gTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGaa < 2:417752/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGt < 1:1320515/150‑1 (MQ=255) cAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCAt < 1:1643621/150‑1 (MQ=255) gCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGc > 1:1739517/1‑102 (MQ=255) gCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGc < 2:1739517/102‑1 (MQ=255) cAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTACGCGACGTGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGGCTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGc > 1:987870/1‑150 (MQ=255) aaaGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCt < 1:1305633/150‑1 (MQ=255) gccgGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGc > 1:736918/1‑150 (MQ=255) ccgGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCCCCGAGACCGAGCCGGAGGTAGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CGACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCg > 2:544515/1‑150 (MQ=255) cTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga > 1:918239/1‑111 (MQ=255) cTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga < 2:918239/111‑1 (MQ=255) ttCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCATAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGAc > 1:1174205/1‑150 (MQ=255) ttCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTAGTGGCGCTATCGGTGGCACAGCAGTTGTAGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACCCCG‑CCACGAAGTGCATCAGACTGCCAGCGAAGAc > 2:845342/1‑150 (MQ=255) ttCCACGCAGCACGACTTGGTCCGGGCGTTCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGATGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACCCCG‑CCACCAAGTGCATCAGGCTGCCAGCgacgac > 2:169263/1‑150 (MQ=255) ccACGCAGGACGCATTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGACACGTTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGa < 1:1646199/150‑1 (MQ=255) cACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTa < 1:163750/105‑1 (MQ=255) cACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTa > 2:163750/1‑105 (MQ=255) aCGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTTTGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAAc > 1:989843/1‑150 (MQ=255) aCGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAAc > 1:654375/1‑150 (MQ=255) gcagcaCGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAg < 2:1629580/150‑1 (MQ=255) caCGCCTTGGCCCTCGCTGGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGc < 1:1462381/150‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAg > 2:1569060/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGat > 2:573661/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgcc < 2:138337/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgcca < 2:736918/150‑1 (MQ=255) cccGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGAGGCAATAACGGTAGCAGAGTATTTGTGGGTCGACGTTGAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCA‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGCACAGGTGCCAGatgccat > 1:1471215/1‑150 (MQ=255) ccGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgccatg < 1:597644/150‑1 (MQ=255) tgctgtgccaccgacagcgccaccaccggcgcggtctcggtgcgcagcaGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCt > 2:1347717‑M2/50‑110 (MQ=255) tgctgtgccaccgacagcgccaccaccggcgcggtctcggtgcgcagcaGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCt < 1:1347717‑M2/61‑1 (MQ=255) GCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGc > 2:823758‑M1/1‑150 (MQ=255) tgtgccaccgacagcgccaccaccggcgcggtctcggtgcgcagcaGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgcca > 1:1336607‑M2/47‑138 (MQ=255) tgtgccaccgacagcgccaccacaggcgcggtctcggtgcgcagcaGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgcca < 2:1336607‑M2/92‑1 (MQ=255) gagaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTTGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCt < 1:1050816/150‑1 (MQ=255) gagaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCt < 2:1286889/150‑1 (MQ=255) gagaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCt < 1:785603/150‑1 (MQ=255) gaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGaaa < 2:1660864/143‑1 (MQ=255) gaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGaaa > 1:1660864/1‑143 (MQ=255) gaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGt > 1:1134006/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTc > 2:1212285/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGc > 2:1423648/1‑85 (MQ=255) gcgcCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGc < 1:1423648/85‑1 (MQ=255) gcCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAgg < 2:1134006/150‑1 (MQ=255) tggCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGaaa > 2:634331/1‑150 (MQ=255) gcTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCCAAGAAAatga < 2:1459874/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAatgat < 1:1576775/150‑1 (MQ=255) ggTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGa < 1:1212285/150‑1 (MQ=255) ggTGGCACAGCAGTTGTGGGACGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGa > 2:1717547/1‑150 (MQ=255) cacaGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACTTCGTAGAATAAG‑GCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGACGgtg < 2:989843/150‑1 (MQ=255) acaGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCt < 1:935135/118‑1 (MQ=255) acaGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCt > 2:935135/1‑118 (MQ=255) acaGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAgg < 1:1750511/126‑1 (MQ=255) acaGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAgg > 2:1750511/1‑126 (MQ=255) acaGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGACGgtgt > 1:256057/1‑150 (MQ=255) acaGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGACGgtgt < 1:1041208/150‑1 (MQ=255) acaGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGACGgtgt > 2:965395/1‑150 (MQ=255) agcaGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGATCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGCACAGGTGCCAGATGCCATGCCTGAATCTTAAACTGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGACGGTGTAg < 1:799363‑M2/146‑1 (MQ=255) agcaGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGACGGTGTAg < 2:686151‑M2/146‑1 (MQ=255) | CCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGA‑GGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCG‑CCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGCCGACGGTGTAG > NC_002947/5680551‑5680843 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |