| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5795530 = | 89 (1.190) | 5 (0.070) | 4/242 | NT | 6.1% | coding (2426/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| ? | NC_002947 | 5795555 = | 70 (0.990) | coding (2401/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha | |||||
CGAAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTC > NC_002947/5795384‑5795672 | gggtgcgcgcgtcgaagacctggaaaacgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgcccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCct > 2:360472‑M1/147‑150 (MQ=255)gcgtgcgcgcttccaagccctggaaaacgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCct < 2:1261865‑M1/4‑1 (MQ=255) gAAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCctg > 1:965812/1‑150 (MQ=255) gAAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCctg > 1:1756570/1‑150 (MQ=255) gtgcgcgcttcgaagacgtggaaaacgaccagaagctgctggcggccgaagccaggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaggttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCctgc < 2:664827‑M1/6‑1 (MQ=255) aaaCGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGGAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCctgc > 2:1328451/1‑150 (MQ=255) aaaCGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCctgc < 2:735046/150‑1 (MQ=255) aCGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACTTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCctgctg < 1:345281/150‑1 (MQ=255) gCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGca > 2:1760885/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGca > 1:1885633/1‑150 (MQ=255) tGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAg < 1:1907634/150‑1 (MQ=255) agacccgccgcCAGCGGCTCGCCCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGCCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGcc < 2:651190/145‑1 (MQ=255) ccTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCa < 1:1654289/150‑1 (MQ=255) ccTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCa < 2:965812/150‑1 (MQ=255) ccTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCa < 2:1813068/150‑1 (MQ=255) cTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAg < 2:1756570/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAggg < 1:1760885/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgt < 2:1885633/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgt < 1:675158/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgt < 1:1826437/150‑1 (MQ=255) gCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTATACGGTAGAAGTAATCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCATGGGTTGTTGCGGGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgtgt > 1:1296055/1‑150 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCAACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGTGTGTTGa < 1:1905431/150‑1 (MQ=255) cgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGa > 1:1261865‑M1/120‑150 (MQ=255) 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cagcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGtt > 2:1431574/1‑150 (MQ=255) agcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTg > 2:1633198/1‑150 (MQ=255) gccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAg < 2:1290273/150‑1 (MQ=255) gccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAg < 2:1069811/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCTCAGCCTCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt < 1:801559/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt < 1:748863/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt < 2:1720710/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTAt > 2:1024284/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTc < 1:1497393/150‑1 (MQ=255) gCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCa > 1:1742345/1‑150 (MQ=255) tttCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAggg < 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(MQ=255) ccaccaGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTgcgcgcgc < 2:601983/150‑1 (MQ=255) caccaGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCt > 2:1261674/1‑150 (MQ=255) gaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAgg > 1:508157‑M1/35‑58 (MQ=255) gaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAgg < 2:508157‑M1/24‑1 (MQ=255) caGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCt < 1:846629/137‑1 (MQ=255) caGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCt > 2:846629/1‑137 (MQ=255) aGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAg < 1:5782/150‑1 (MQ=255) aGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAg < 1:668319/150‑1 (MQ=255) tgtATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCgg > 1:1558927/1‑150 (MQ=255) tgtATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCgg < 2:620762/150‑1 (MQ=255) gtATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGgc > 2:852789/1‑150 (MQ=255) tATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGgcc > 2:1254849/1‑150 (MQ=255) aTTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGCACTTCAGCAGGCCCCCTTGCTTGATCTGCTTTCGCTCGCTCCAGGCTTCGgccg < 2:878706/150‑1 (MQ=255) ttCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGgccgc > 2:188404/1‑150 (MQ=255) cTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGgccgcccg > 1:392280/1‑148 (MQ=255) ttGAACTTGGTGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTg < 1:1006560/71‑1 (MQ=255) ttGAACTTGGTGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTg > 2:1006560/1‑71 (MQ=255) ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGATCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagc > 2:834192/1‑150 (MQ=255) ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagc > 1:439152/1‑150 (MQ=255) ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCaagc > 1:835419/1‑150 (MQ=255) gAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagcag < 2:1784347/150‑1 (MQ=255) gAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagcag > 2:926812/1‑150 (MQ=255) ttGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTc < 1:1024284/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTc < 1:188404/150‑1 (MQ=255) cGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGt < 2:1326999/150‑1 (MQ=255) gTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTTACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTc < 1:887081/150‑1 (MQ=255) | CGAAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTC > NC_002947/5795384‑5795672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |