| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5795530 = | 89 (1.190) | 5 (0.070) | 4/242 | NT | 6.1% | coding (2426/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| ? | NC_002947 | 5795555 = | 70 (0.990) | coding (2401/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha | |||||
CAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGA > NC_002947/5795406‑5795704 | cAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgt < 1:675158/150‑1 (MQ=255)cAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgt < 1:1826437/150‑1 (MQ=255)cAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgt < 2:1885633/150‑1 (MQ=255) gCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTATACGGTAGAAGTAATCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCATGGGTTGTTGCGGGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgtgt > 1:1296055/1‑150 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCAACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGTGTGTTGa < 1:1905431/150‑1 (MQ=255) cgaccagaagctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggcctgctgaagttcgtccacggtggcgaataccacgcctacaacccggacgtggtcaacaCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGa > 1:1261865‑M1/120‑150 (MQ=255) gACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTCAACATGTCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCAc > 1:1152331/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACg > 2:724385/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCggg < 1:737785/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCGTGAGCAAGTCACGAAGCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCggg < 1:355141/150‑1 (MQ=255) cagcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGtt < 1:1719987/150‑1 (MQ=255) cagcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGtt > 2:1431574/1‑150 (MQ=255) agcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTg > 2:1633198/1‑150 (MQ=255) gccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAg < 2:1290273/150‑1 (MQ=255) gccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAg < 2:1069811/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCTCAGCCTCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt < 1:801559/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt < 1:748863/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt < 2:1720710/150‑1 (MQ=255) 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ttGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTc < 1:1024284/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTc < 1:188404/150‑1 (MQ=255) cGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGt < 2:1326999/150‑1 (MQ=255) gTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTTACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTc < 1:887081/150‑1 (MQ=255) tcaacaccctgcaagcggctgtgcagcagggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATc < 2:1191513‑M2/74‑1 (MQ=255) tcaacaccctgcaagcggctgtgcagcagggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATc > 1:1191513‑M2/32‑105 (MQ=255) tcaacaccctgcaagcggctgtgcagcagggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCg > 1:1261865‑M2/32‑150 (MQ=255) cctgcaagcggctgtgcagcagggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTc < 2:508157‑M2/34‑1 (MQ=255) cctgcaagcggctgtgcagcagggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTc > 1:508157‑M2/25‑58 (MQ=255) CCTGCTGCACCGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAg > 2:1347953‑M1/1‑116 (MQ=255) CCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAg < 1:1347953‑M1/116‑1 (MQ=255) GCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagcag < 2:1321404‑M1/130‑1 (MQ=255) GCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagcag > 1:1321404‑M1/1‑130 (MQ=255) GCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGTTCGTTTTCCAGGt > 2:392280‑M1/1‑150 (MQ=255) gcACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCtt > 2:224724/1‑150 (MQ=255) gCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAgcgc > 2:372042/1‑150 (MQ=255) gCTTGCAGGGTGTTGAAAAAGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAgcgc < 2:439152/150‑1 (MQ=255) cTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAgcgcg > 2:797232/1‑150 (MQ=255) gcagggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACCTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCTGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCACGTCTTCGAAGCGCGCAc < 2:664827‑M2/144‑1 (MQ=255) agggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGGCGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGACGCGCGCAccc > 2:360472‑M2/5‑150 (MQ=255) agggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGGCTTGGAAGCGCGcacgc < 2:1261865‑M2/146‑3 (MQ=255) tgtTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGa < 2:669069/150‑1 (MQ=255) | CAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGA > NC_002947/5795406‑5795704 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |