New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 4933312 = | 79 (1.090) | coding (1182/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCTGTGGT > NC_002947/4933165‑4933460 | gACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggtgcag < 2:695531/150‑1 (MQ=255) accaaactcgatgaaacggcaagccttggcgatgtgttgagccttgccatcagtcatgaactgccagtgttttcatgtgcggatggcccacgcattcctgacgacctgCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggtgcag > 2:543459‑M1/109‑150 (MQ=255) aCTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggtgcagg < 1:648905/150‑1 (MQ=255) tGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGgtcgt < 1:653685/150‑1 (MQ=255) acacGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAg > 2:759663/1‑150 (MQ=255) acacGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAg > 1:1576324/1‑150 (MQ=255) acacGCTTCATGGTCAACCCGCTCGAAGTCGTTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAg > 1:50262/1‑150 (MQ=255) acGCTTCATGGACAACCAGATCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGa < 2:902266/150‑1 (MQ=255) cGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGaa > 2:1025828/1‑150 (MQ=255) tCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCg > 2:822577/1‑150 (MQ=255) tGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTgg < 1:1565327/150‑1 (MQ=255) tGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTgg < 1:1700515/150‑1 (MQ=255) gTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGc > 1:689631/1‑150 (MQ=255) 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tgtgATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTg < 2:660619/150‑1 (MQ=255) gtgATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTgg < 1:639684/150‑1 (MQ=255) ttgccatcagtcatgaactgccagtggcctatcttaccgatggcccacgcattcctgacgacctgCACCTGCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggtgcag < 2:1165202‑M1/42‑1 (MQ=255) ttgccatcagtcatgaactgccagtggcctatcttaccgatggcccacgcattcctgacgacctgCACCTGCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGgcaggtgcag > 1:1165202‑M1/66‑107 (MQ=255) tgATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGc < 2:1236349/150‑1 (MQ=255) tgATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGc < 1:1754570/150‑1 (MQ=255) 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gaTCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTc < 2:546371/148‑1 (MQ=255) gaTCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCAt < 2:1869346/150‑1 (MQ=255) tCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGa < 2:1570469/150‑1 (MQ=255) aaCATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATg < 1:1289968/150‑1 (MQ=255) aCATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATgg > 2:1365818/1‑150 (MQ=255) 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ctgccgcggggccaccagttggtcacgcgggcggtgCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGAt > 2:1059025‑M2/37‑150 (MQ=255) ccgcGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCa < 1:1365818/150‑1 (MQ=255) cAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCggccag < 1:1025828/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCggccagg > 2:148214/1‑150 (MQ=255) gtggCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCcaca > 2:1105925/1‑150 (MQ=255) gatctcccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGACACCAGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCcaca < 1:407023/145‑1 (MQ=255) ccccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAgcgc < 1:1796668/150‑1 (MQ=255) cccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCaa < 1:188934/85‑1 (MQ=255) cccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCaa > 2:188934/1‑85 (MQ=255) cccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCt > 2:1576870/1‑150 (MQ=255) cccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCt > 1:272789/1‑150 (MQ=255) cccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCt > 2:769364/1‑150 (MQ=255) cccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCCCt > 2:224553/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCtt < 1:445959/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCtt > 2:517296/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCtt > 2:1644774/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCtt < 1:759663/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCtt > 2:642662/1‑150 (MQ=255) ggtgCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCtgt < 2:1687899‑M2/146‑1 (MQ=255) gCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCTGTGGt > 1:1516604‑M2/2‑150 (MQ=255) | GACTTTGCACACGCTTCATGGTCAACCCGCTCGCCGTGGGTTGTGATAGAGATCAGCGAACATGTCGGCCATGGCCTCTTCGCTGGGCTCGTCCTGCTGCTGCACATTCACCGCCCGCGTGACCAACTGGTGGCCCCGCGGCAGGTGCAGGTCGTCAGGAATGCGTGGGCCATCGGTAAGATAGGCCACTGGCAGTTCATGACTGATGGCAAGGCTCAACACATCGCCAAGGCTTGCCGTTTCATCGAGTTTGGTCAGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCTGTGGT > NC_002947/4933165‑4933460 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |