New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5012886 | 74 (0.990) | 6 (0.090) | 5/232 | NT | 7.8% | intergenic (‑200/‑342) | PP_5677/PP_5678 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5012897 | 74 (1.090) | intergenic (‑211/‑331) | PP_5677/PP_5678 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GAGCCACCTTTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCACCTCTTTTCTACC > NC_002947/5012749‑5013046 | gAGCCACCTTTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCa > 1:573581‑M2/1‑149 (MQ=255) ccACCTTTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCattt > 2:434030‑M2/1‑146 (MQ=255) ccACCTTTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCattt < 1:300964‑M2/150‑5 (MQ=255) cACCTTTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCatttt < 2:676990‑M2/150‑6 (MQ=255) tgcttTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCatttta < 1:833732‑M2/148‑7 (MQ=255) ccTTTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAGATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCattttaa < 1:372980‑M2/150‑8 (MQ=255) ccTTTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCattttaa > 1:640634‑M2/1‑143 (MQ=255) cTTTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCattttaag < 1:300712‑M2/150‑9 (MQ=255) cTTTCGGCCTCAAGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTAGACTTACCTGCCAT‑TTGTTATATCAGATCCAGTAGTTCGACATGAGCGATTGCATCCCACGAAATCTCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAg < 1:1383369/150‑1 (MQ=255) tttCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCattttaagg < 1:1718445‑M2/150‑10 (MQ=255) gCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATg < 1:106010/150‑1 (MQ=255) gCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATg < 1:1120104/150‑1 (MQ=255) tcGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCtt < 2:744489/150‑1 (MQ=255) ggCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTaa < 1:1008703/150‑1 (MQ=255) ggCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTaa < 2:297733/150‑1 (MQ=255) ggCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTaa > 1:1024537/1‑150 (MQ=255) gCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTNCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACATGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAAc > 1:1540051/1‑150 (MQ=255) cTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCATCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATGTTAAGCGCATGCACTTAACAtc > 2:136560/1‑149 (MQ=255) ttCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCattttaaggg < 1:1490995‑M2/134‑11 (MQ=255) gggCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCNT‑CCATGNCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGa > 1:1544945/1‑150 (MQ=255) gggCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGCGGTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGa < 1:119105/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGAt < 2:1504020/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGAt > 2:1920117/1‑150 (MQ=255) tCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTaaa < 2:1881113/150‑1 (MQ=255) cATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAAt < 2:833732/150‑1 (MQ=255) cATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAAt < 1:76189/150‑1 (MQ=255) aTCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGa > 1:344128/1‑142 (MQ=255) aTCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGa < 2:344128/142‑1 (MQ=255) aTCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAAtt > 2:307982/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGTGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGata > 2:531202/1‑150 (MQ=255) gcgcTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGaa > 2:1855228/1‑150 (MQ=255) gcgcTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGGTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTTGaa < 1:65782/150‑1 (MQ=255) ctGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGACATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTc < 1:1556256/150‑1 (MQ=255) gCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTACGTCTGTGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCct > 1:116640/1‑150 (MQ=255) gCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCct > 1:1765650/1‑150 (MQ=255) cTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAAtt > 1:1722124/1‑128 (MQ=255) cTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAAtt < 2:1722124/128‑1 (MQ=255) ttGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCctct > 2:492817/1‑150 (MQ=255) ttGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCctct > 1:1529549/1‑150 (MQ=255) ccTAGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGACATCTTAATGTTGATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGc < 1:1058883/150‑1 (MQ=255) tCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGATATGAGCAACACATTTCATCGGAAACCCCGTTAATAGCGTTCACTCCCATTTTAAGGGCATGCCCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCtt > 1:35686/1‑150 (MQ=255) gCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCAt < 1:857958/96‑1 (MQ=255) gCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCAt > 2:857958/1‑96 (MQ=255) aT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAAtttt > 1:840336/1‑136 (MQ=255) aT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAAtttt < 2:840336/136‑1 (MQ=255) ccATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGa < 1:1612364/150‑1 (MQ=255) ccATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGa < 2:1024537/150‑1 (MQ=255) cATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAGATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGAc < 2:372980/150‑1 (MQ=255) cATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGAc < 1:676990/150‑1 (MQ=255) cATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGAc > 2:442823/1‑150 (MQ=255) gTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGa > 1:1683880/1‑146 (MQ=255) gTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGa < 2:1683880/146‑1 (MQ=255) tCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACATGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACt > 2:516501/1‑150 (MQ=255) aGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTTGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTcc > 1:42590/1‑150 (MQ=255) aGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGctc < 1:1427709/89‑1 (MQ=255) aGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGctc > 2:1427709/1‑89 (MQ=255) atCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGt > 1:909021/1‑150 (MQ=255) atCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGt > 2:1008903/1‑150 (MQ=255) ttCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGt > 1:1345853/1‑150 (MQ=255) aGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCAt < 1:1920117/150‑1 (MQ=255) gTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGTTCTTTACATACCGATTTAATTTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTGATGGTCTTCAtt > 1:134010/1‑150 (MQ=255) gTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCAtt < 1:461915/150‑1 (MQ=255) ttCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCAttt < 1:492817/150‑1 (MQ=255) ggccTGGGTGATGGCACTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCtt < 2:1047978/148‑1 (MQ=255) gACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCtt > 2:134553/1‑150 (MQ=255) gACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCtt < 2:1544945/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTAcccc < 2:35686/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTAGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTAcccc > 1:1413342/1‑150 (MQ=255) ttGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTTGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAg < 2:42590/150‑1 (MQ=255) ttGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAg < 2:1540051/150‑1 (MQ=255) ttGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAg < 2:198285/150‑1 (MQ=255) tctntAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGgaga > 2:1188113/1‑150 (MQ=255) tctctAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGgaga < 2:1345853/150‑1 (MQ=255) tctctAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACGCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGgaga < 2:667236/150‑1 (MQ=255) tctAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGgagaga > 1:1444570/1‑150 (MQ=255) tAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGaaa > 1:1750992/1‑150 (MQ=255) tAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGaaa > 1:1127026/1‑150 (MQ=255) gCCCTTAAAATTGTGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTCAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATga < 2:1029674/150‑1 (MQ=255) cccTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATgag > 1:1202162/1‑150 (MQ=255) ccTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATgaga > 2:187049/1‑150 (MQ=255) cTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGAt > 1:1290395/1‑150 (MQ=255) ttAAAATTGGGCACTCCCattttaagggcgatttcttagagagcaatcgcccaggtcgaactcctgaagctgatatgctgacatggatgcgaggcaagcagagcgcgcagg > 1:1122016‑M2/1‑18 (MQ=255) ttAAAATTGGGCACTCCCattttaagggcgatttcttagagagcaatcgcccaggtcgaactcctgaagctgatatgctgacatggatgcgaggcaagcagagcgcgcagg < 2:1122016‑M2/111‑94 (MQ=255) ttAAAATTGGGCACTCCCattttaagggcgatttcttagagagcaatcgcccaggt < 1:1666456‑M2/56‑39 (MQ=255) ttAAAATTGGGCACTCCCattttaagggcgatttcttagagagcaatcgcccaggt > 2:1666456‑M2/1‑18 (MQ=255) ttAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATc < 2:1529549/150‑1 (MQ=255) tgaaaaTTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATc > 2:1762261/3‑150 (MQ=255) tAAAATTGGGCACTCCCattttaagggcgatttcttagagagcaatcgcccaggtcgaactcctgaagctg > 2:885353‑M2/1‑17 (MQ=255) tAAAATTGGGCACTCCCattttaagggcgatttcttagagagcaatcgcccaggtcgaactcctgaagctg < 1:885353‑M2/71‑55 (MQ=255) aaTTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCa < 1:377230/150‑1 (MQ=255) aTTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGga < 2:1344960/126‑1 (MQ=255) aTTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGga > 1:1344960/1‑126 (MQ=255) aTTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCAc > 2:479062/1‑150 (MQ=255) aCTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCACCTCtttt < 1:1008903/150‑1 (MQ=255) tCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGGTTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCACCTCTTTTCt > 1:366704/1‑150 (MQ=255) tCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCACCTCTTTTCt > 2:25116/1‑150 (MQ=255) ccATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCACCTCTTTTCTAc > 1:715497/1‑150 (MQ=255) ccATTTTAAGGCCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCACCTCTTTTCTAc < 1:1461686/150‑1 (MQ=255) cATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCACCTCTTTTCTAcc < 1:955593/150‑1 (MQ=255) cATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCACCTCTTTTCTAcc > 1:130324/1‑150 (MQ=255) | GAGCCACCTTTCGGCGTCTCGGCCCTTCGGGCTTTCATCCTCGCGCCTGCGCGCTCTGCTTGCCTCGCAT‑CCATGTCAGCATATCAGCTTCAGGAGTTCGACCTGGGCGATTGCTCTCTAAGAAATCGCCCTTAAAATTGGGCACTCCCATTTTAAGGGCATGCTCTTAACATACTGATTTAAATTGATATTTCTTAGAATTTTCCTCTCGCTTCCTTGACCACTCCAGCGTCATGGTCTTCATTTCTTGTTACCCCCAGGAGAGAAATAGCCATGAGATCAGCACCTCTTTTCTACC > NC_002947/5012749‑5013046 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |