New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5164490 | 70 (0.940) | 5 (0.070) | 5/244 | NT | 7.3% | coding (3438/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
? | NC_002947 | = 5164525 | 59 (0.820) | coding (3403/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
GTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCA > NC_002947/5164376‑5164674 | gTTCAGTGGCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑Caa < 2:1043784/150‑1 (MQ=255) gTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑Caa > 1:483822/1‑150 (MQ=255) tCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAgg > 2:1587746‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCa < 2:483822/150‑1 (MQ=255) ccACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGATGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCAc > 1:1149023/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCt > 1:732605/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCt > 1:583309/1‑150 (MQ=255) cGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCATTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCCTGCTCGATCCAGCTTCCGCACTTTCTTTCAGCCATCTCTGC‑‑CAAGTCCGCACCTTc < 2:960916/150‑1 (MQ=255) cTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGACGCGTTTCTGGAGGCCAGGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCAc < 2:781545/150‑1 (MQ=255) ggCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTg < 1:565099/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGTGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTgg < 2:1288292/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTgg < 2:1777029/150‑1 (MQ=255) tCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCa > 1:1184919/1‑150 (MQ=255) ggTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACg < 1:1475363/150‑1 (MQ=255) gTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACgg > 1:107636/1‑150 (MQ=255) gTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACgg > 1:255260/1‑150 (MQ=255) tCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgt > 2:334496/1‑150 (MQ=255) tCTTGCCCTTGAGGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGCCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgttgtt < 2:642351/150‑1 (MQ=255) tCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgttgtt > 2:907134/1‑150 (MQ=255) cTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTc < 2:674761/150‑1 (MQ=255) ttGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCg > 2:770475/1‑150 (MQ=255) ttGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCg > 1:532599/1‑150 (MQ=255) cccTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCt < 1:382560/150‑1 (MQ=255) ccTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCtt > 1:313771/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGa > 1:369194/1‑150 (MQ=255) gTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGc < 2:842084/150‑1 (MQ=255) tGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTg > 2:506763/1‑150 (MQ=255) gCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGt > 1:729524/1‑150 (MQ=255) cAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTc < 2:1238653/150‑1 (MQ=255) gACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCa > 2:1125910/1‑150 (MQ=255) cATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAgg < 2:1259316‑M2/96‑3 (MQ=255) cATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAgg > 1:1259316‑M2/1‑94 (MQ=255) tGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTg < 1:749752/150‑1 (MQ=255) ccACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGc > 1:175212/1‑150 (MQ=255) acaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCca > 2:1274335/1‑150 (MQ=255) acaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCca > 2:1274293/1‑150 (MQ=255) ttCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGa > 1:295776/1‑150 (MQ=255) tCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgt < 2:1101752/107‑1 (MQ=255) tCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgt > 1:1101752/1‑107 (MQ=255) tCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGaa < 2:107636/150‑1 (MQ=255) tCAGCACTTCCAGGGTCTCCCTCGCAAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGaa < 2:1154381/150‑1 (MQ=255) cAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCAAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CACGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAAt < 2:399424/150‑1 (MQ=255) cACTTCCAGGGTTTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGGGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGCTGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTc < 1:1781655/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTc > 2:1530372/1‑150 (MQ=255) aGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGcc < 2:728261/104‑1 (MQ=255) aGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGcc > 1:728261/1‑104 (MQ=255) gggTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCa < 2:532599/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCtt < 2:1395944/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCtt > 2:819586/1‑150 (MQ=255) cTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCt > 2:246964/1‑150 (MQ=255) cTTGCCAGGCGCTAGGCATGCTCGTGCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCt < 1:1341714/150‑1 (MQ=255) cTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCAt < 1:203780/150‑1 (MQ=255) ggCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTc < 2:1184919/150‑1 (MQ=255) cATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCAc < 1:1032562/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaaga > 1:1182183‑M2/1‑42 (MQ=255) cTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaaga < 2:1182183‑M2/128‑87 (MQ=255) tCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagg > 1:1252637‑M2/1‑41 (MQ=255) tCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagg < 2:1252637‑M2/121‑81 (MQ=255) ggCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTAcag < 2:89437/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTAcagcag < 2:1130992/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTAcagcag < 1:1769303/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCGGCTGggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaagatcgacctgagccaagcggtggcactgaacg < 1:473838‑M2/150‑117 (MQ=255) cgcgCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATAAAAGGGTTAAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCt > 1:1176485/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACgg < 2:23675/133‑1 (MQ=255) gcgcTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACgg > 1:23675/1‑133 (MQ=255) cgcTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCg < 2:1149023/150‑1 (MQ=255) cgcTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTCCACGTTACAGCAGGCCCAGCTCg < 2:369194/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGcc > 1:72499/1‑150 (MQ=255) cagccagcGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCg < 2:1064037/150‑1 (MQ=255) ccagcGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCGATATCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCa > 1:1533826/1‑150 (MQ=255) ccagcGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCa > 1:839339/1‑150 (MQ=255) ccagcGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCa > 1:619202/1‑150 (MQ=255) cagcGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGCCCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCGCGTCAg > 2:33491/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCa < 1:770475/150‑1 (MQ=255) aGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCa < 2:1583820/150‑1 (MQ=255) | GTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCA > NC_002947/5164376‑5164674 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |