New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5443554 = | 96 (1.290) | 6 (0.090) | 5/234 | NT | 7.0% | coding (1274/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 5443595 = | 72 (1.050) | coding (1233/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGTGATGAA > NC_002947/5443446‑5443744 | gtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGt > 2:1034567‑M1/109‑150 (MQ=255) caGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGtt < 1:956958/150‑1 (MQ=255) aGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCTAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTg > 1:99818/1‑150 (MQ=255) ccGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCa < 2:1515192/150‑1 (MQ=255) ccGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCa < 1:1443223/150‑1 (MQ=255) cGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAg < 2:237329/150‑1 (MQ=255) cGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAg < 2:1880184/150‑1 (MQ=255) gtgtGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAgg < 1:547409/150‑1 (MQ=255) aTGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAg > 2:358563/1‑150 (MQ=255) tGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCATGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGt > 2:968824/1‑150 (MQ=255) gTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAg > 2:1505406/1‑141 (MQ=255) gTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAg < 1:1505406/141‑1 (MQ=255) gTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTg > 1:1722420/1‑150 (MQ=255) aCTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGCCCAGTTGCAGTT‑TCAGTTGcc > 2:409112/1‑149 (MQ=255) tGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCCGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTcc > 1:1545349/1‑150 (MQ=255) aGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAg > 2:220866/1‑150 (MQ=255) gCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGc < 1:1720770/150‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTa > 2:1429749/1‑150 (MQ=255) cccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGGTTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAg > 1:414761/1‑150 (MQ=255) ccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAg‑t > 1:1703076/1‑150 (MQ=255) ccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAg‑t > 2:211280/1‑150 (MQ=255) ccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAg‑t > 1:737613/1‑150 (MQ=255) ccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTAATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCAGGCAGGCCAGGAAGTCGTCCTTCAGGCGGTGGTTCCTGGGCAGGTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCatt > 2:1653976/1‑148 (MQ=255) cgtCGGCCTGGTGTGCTGCAGCTCGAGCGAGCCAATACCTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTc < 2:659260/148‑1 (MQ=255) cATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTc < 1:77097/150‑1 (MQ=255) cATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTc < 1:1432994/150‑1 (MQ=255) caaggTGTGCATCTTCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCaa > 2:933919/4‑150 (MQ=255) gCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCtgtg < 1:1291417/150‑1 (MQ=255) 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cAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGc > 1:1615260/1‑150 (MQ=255) aaTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCAGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGCCAAAACTGGCTGCTCGCGCAGGCt > 1:1038476/1‑150 (MQ=255) cGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGc > 2:1667487/1‑150 (MQ=255) gTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCg > 2:1785727/1‑150 (MQ=255) gTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCg > 2:764094/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) CAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCAAGGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCaa < 1:116602‑M1/150‑1 (MQ=255) AGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAg < 2:1893061‑M1/150‑1 (MQ=255) AGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAg > 1:968824‑M1/1‑150 (MQ=255) GGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGGTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCGAGCGACAGCAAg < 2:949895‑M1/137‑1 (MQ=255) GGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAg > 1:949895‑M1/1‑137 (MQ=255) 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tCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGaa < 1:1072485/150‑1 (MQ=255) atcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa < 2:1799823‑M2/65‑1 (MQ=255) atcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa > 1:1799823‑M2/29‑93 (MQ=255) atcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAc > 1:1312426‑M2/29‑150 (MQ=255) gTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAcc > 1:980868/1‑150 (MQ=255) gTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAcc > 1:1847594/1‑150 (MQ=255) gTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAcc < 2:1466061/150‑1 (MQ=255) gTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAcc < 1:999069/150‑1 (MQ=255) gTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAcc < 1:676892/150‑1 (MQ=255) tCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa < 1:1061517/91‑1 (MQ=255) tCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa > 2:1061517/1‑91 (MQ=255) ttCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTTGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgc < 2:1615260/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgc > 1:1327567/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCGATTGCTCCCGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCaa < 1:1435802/137‑1 (MQ=255) gCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgctggct < 1:453198/150‑1 (MQ=255) gCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgctggct > 2:1220372/1‑150 (MQ=255) cGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgctggctg < 2:1883074/150‑1 (MQ=255) cTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg > 1:1429019/1‑115 (MQ=255) cTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg < 2:1429019/115‑1 (MQ=255) tcctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCg > 2:1713466‑M2/11‑88 (MQ=255) tcctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCg < 1:1713466‑M2/78‑1 (MQ=255) tcctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACa > 2:857420‑M2/11‑150 (MQ=255) tcctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACa < 2:1312967‑M2/140‑1 (MQ=255) tcctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACa < 1:220866‑M2/140‑1 (MQ=255) ctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCCGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATg < 2:1312426‑M2/142‑1 (MQ=255) ctggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATg > 1:78081‑M2/9‑150 (MQ=255) tggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATgg > 1:1182967‑M2/8‑150 (MQ=255) ggccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGt < 1:482339‑M2/144‑1 (MQ=255) gcagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCGGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGGGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCTCTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtga < 2:658601‑M2/146‑1 (MQ=255) ccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtg < 1:1798518‑M2/145‑1 (MQ=255) ccagTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtg > 2:1798518‑M2/5‑149 (MQ=255) | ACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGT‑TCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAG‑TGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGTGATGAA > NC_002947/5443446‑5443744 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |