| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 5812081 | 82 (1.100) | 3 (0.040) | 3/244 | NT | 3.6% | coding (1353/2220 nt) | priA | primosome assembly protein |
| ? | NC_002947 | = 5812115 | 81 (1.130) | coding (1387/2220 nt) | priA | primosome assembly protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCTATCCGACAGACCCTGGAGGCTGGCCAACAAGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCAACCTTGCTGTGCCACGATTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGCATGACCGTGCACCAGCGCTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTACCCGATCC > NC_002947/5811968‑5812262 | gCTATCCGACAGACCCTGGAGGCTGGCCAACAAGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCAACCTTGCTGTGCCACGATTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGCATGACCGTGCACCAGCGCTCCGgc > 2:608738‑M2/1‑148 (MQ=255)gCTATCCGACAGACCCTGGAGGCTGGCCAACAAGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCAACCTTGCTGTGCCACGACTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGTATAACCGTGCACCAGCGCTCCGgc < 2:962401‑M2/150‑3 (MQ=255) tCCGACAGACCCTGGAGGCTGGCCAACAAGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCAACCTTGCTGTGCCACGACTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGCATGACCGTGCACCAGCGCTCCGGCGtgc > 1:1177018/1‑150 (MQ=255) 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tGGCCAACAAGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCAACCTTGCTGTGCCACGATTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGCATGACCGTGCACCAGCGCTCCGGCGTGCTGCGCTGCAACTGCTGTgg > 1:1020641/1‑150 (MQ=255) ggCCAACAAGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCAACCTTGCTGTGCCACGATTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGCATGACCGTGCACCAGCGCTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGc > 2:241143/1‑150 (MQ=255) caacaaGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCAACCTTGCTGTGCCACGATTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGCATGACCGTGCACCAGCGCTCCGgc < 2:1637794‑M2/123‑3 (MQ=255) caacaaGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCAACCTTGCTGTGCCACGATTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGCATGACCGTGCACCAGCGCTCCGgc > 1:1637794‑M2/1‑121 (MQ=255) acgaGTGCGGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCACCCTCGGTGTGCCACGAGTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGGGCATGACCGTGCACCCGGCCTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGa < 1:627092/147‑1 (MQ=255) caaGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTCCCCACACCATGCCATACGTCGACTGCTGCGGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGCATGACCGTGCACCAGCGCTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGAc < 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gTGCACCAGCGCTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCg > 1:1162723/1‑150 (MQ=255) cAGCGCTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCTGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTAc < 2:745667/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTAc < 2:55373/150‑1 (MQ=255) gcgcTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTAccc < 1:156142/150‑1 (MQ=255) gcgcTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTAccc > 1:1676482/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTACCCGAt > 2:1588835/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTACCCGATc > 1:1198714/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTACCCGATc > 1:1327144/1‑150 (MQ=255) cccGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTACCCGATc < 2:1007562/149‑1 (MQ=255) ccGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCTAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTACCCGATcc > 2:1161139/1‑150 (MQ=255) | GCTATCCGACAGACCCTGGAGGCTGGCCAACAAGTGCTGGTGTTCCTCAACCGCCGCGGCTTTGCCCCAACCTTGCTGTGCCACGATTGCGGCTGGCTGTCCGAATGCCCACGCTGCGATGCGCGCATGACCGTGCACCAGCGCTCCGGCGTGCTGCGCTGCCACCACTGTGGCTATGACGAACGCCTGCCGCACCAGTGCCCGCAATGCAACCACGTCGATCTGCGCCCGGTCGGTGCCGGTACCGAACGCGCCGAAGAGCGCCTGAAGGTGCTGTTCCCGGATTACCCGATCC > NC_002947/5811968‑5812262 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |