| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 337811 | 35 (0.530) | 19 (0.360) | 22/210 | 2.0 | 39.7% | intergenic (‑58/+71) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 337839 | 30 (0.570) | intergenic (‑86/+43) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACC > NC_002947/337663‑337960 | gcgGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGta > 2:531858/1‑150 (MQ=255) tttCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAgc > 2:319590/1‑150 (MQ=255) tCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGACTCTTCGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGTgtagcgc > 2:489809‑M1/1‑143 (MQ=255) cacaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAgcgc > 1:938533/1‑148 (MQ=255) cacaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCc‑a > 1:1026970/1‑150 (MQ=255) cacaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCc‑a > 2:706481/1‑150 (MQ=255) acaGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaa > 2:913608‑M1/1‑140 (MQ=255) tgctgGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGTCGTGATTCGTTGGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCa < 2:1379057/150‑1 (MQ=255) tgGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaat < 1:489809‑M1/150‑19 (MQ=255) cTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCATGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGgc < 1:425466/150‑1 (MQ=255) tCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGGGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcg > 2:339905‑M1/1‑126 (MQ=255) cGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGgcgc < 1:395395/150‑1 (MQ=255) gATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgct > 1:219680‑M1/1‑124 (MQ=255) gATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgct > 1:56812‑M1/1‑124 (MQ=255) cAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctata < 2:219680‑M1/150‑30 (MQ=255) ggAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGGGGTTGGGCATGGCAAGGGTGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCACCCACAGGTgtagcgccaaccttggatgtggggctatagc > 1:599932‑M1/1‑119 (MQ=255) gAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacct > 2:1460710‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtg > 1:339905‑M2/1‑143 (MQ=255) tGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgg > 2:1303665‑M2/1‑142 (MQ=255) tGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgg > 2:56812‑M2/1‑142 (MQ=255) gTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCTCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtggga > 1:1632959‑M2/1‑140 (MQ=255) tCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgt < 2:1347114‑M2/145‑7 (MQ=255) tCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgt > 1:1347114‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggag > 1:319590‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggag > 1:215769‑M2/1‑139 (MQ=255) gAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgggagcg < 2:1565652‑M2/150‑14 (MQ=255) aGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgggagcgg > 1:913608‑M2/1‑136 (MQ=255) aGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgggagcgg > 1:1565652‑M2/1‑136 (MQ=255) gCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCc‑a‑ca < 1:842353/116‑1 (MQ=255) gCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCc‑a‑ca > 2:842353/1‑116 (MQ=255) aGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgc > 2:1026970‑M2/1‑126 (MQ=255) gTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGc < 1:242042/150‑1 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtg > 2:491371‑M1/1‑89 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtg > 1:491371‑M2/1‑117 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCc‑a < 1:92477/98‑1 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCc‑a > 2:92477/1‑98 (MQ=255) ggCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTatagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt < 2:1216786‑M1/114‑35 (MQ=255) ggCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTatagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt > 1:1216786‑M1/1‑80 (MQ=255) gttgtgGAGGTGGTTGGGAATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGTAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGtct < 2:246288/148‑1 (MQ=255) tgtgGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtg < 2:890143‑M2/112‑8 (MQ=255) tgtgGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtg > 1:890143‑M2/1‑105 (MQ=255) tgtgGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgc > 1:802934‑M1/1‑77 (MQ=255) tgtgGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgc < 2:802934‑M1/102‑26 (MQ=255) gtgGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAg > 2:561596/1‑150 (MQ=255) tgGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGc < 1:706481/150‑1 (MQ=255) ggAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCg < 1:561596/150‑1 (MQ=255) ttGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt < 2:1078434‑M1/100‑35 (MQ=255) ttGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt > 1:1078434‑M1/1‑66 (MQ=255) ggATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CAtt < 1:232280/66‑1 (MQ=255) gtgtgGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagc < 1:1247444‑M2/89‑13 (MQ=255) gtgtgGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagc > 2:1247444‑M2/1‑77 (MQ=255) gtggtTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt < 2:148581‑M1/78‑35 (MQ=255) gtggtTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt > 1:148581‑M1/1‑44 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggc < 1:168846‑M1/75‑45 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggc > 2:168846‑M1/1‑31 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgct > 2:1026970‑M1/1‑24 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAA‑CCTTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCa > 1:1585559/1‑150 (MQ=18) aCGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCa > 2:675109/1‑150 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagagg > 2:168846‑M2/1‑44 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagagg < 1:168846‑M2/75‑32 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccct > 1:913608‑M1/1‑14 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccct > 1:1565652‑M1/1‑14 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCAt > 1:1062363/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCAt > 1:247619/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctc < 2:1565652‑M1/150‑138 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATg > 1:505936/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacac > 2:1247444‑M1/1‑12 (MQ=255) gCTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacac < 1:1247444‑M1/89‑78 (MQ=255) cTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcga > 1:319590‑M1/1‑11 (MQ=255) cTCCCACAGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcga > 1:215769‑M1/1‑11 (MQ=255) cccACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACg > 2:605571/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgacca > 2:1303665‑M1/1‑8 (MQ=255) ccACAGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgacca > 2:56812‑M1/1‑8 (MQ=255) ccACAGGTGTAGCGCCAA‑CCTTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACga > 1:1297988/1‑150 (MQ=21) ccACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACga > 2:282961/1‑150 (MQ=255) cacaGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccaca < 2:890143‑M1/112‑106 (MQ=255) cacaGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccaca > 1:890143‑M1/1‑7 (MQ=255) cacaGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccag > 1:339905‑M1/1‑7 (MQ=255) cacaGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaa > 1:491371‑M1/1‑7 (MQ=255) cacaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaa > 2:491371‑M2/1‑35 (MQ=255) acaGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcga > 1:1347114‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGTatagcgccacattcaaggttggcgctacacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcga < 2:1347114‑M1/145‑140 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTATacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcc < 2:1216786‑M2/114‑81 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTATacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcc > 1:1216786‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaa > 1:1078434‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaa < 2:1078434‑M2/100‑67 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccac > 1:148581‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccac < 2:148581‑M2/78‑45 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacct > 2:1073909‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacct < 1:1073909‑M2/38‑5 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 1:328985/1‑150 (MQ=255) aGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttc > 2:1460710‑M1/1‑4 (MQ=255) aGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt > 2:1073909‑M1/1‑4 (MQ=255) aGGTgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgt < 1:1073909‑M1/38‑35 (MQ=255) aGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATc > 1:1219833/1‑95 (MQ=255) aGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATc < 2:1219833/95‑1 (MQ=255) gctatagcCCC‑A‑CATCCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggtgcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacacccttgccatgcccaaccccctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcc > 1:599932‑M2/3‑31 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCtt > 2:1029044/1‑120 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCtt < 1:1029044/120‑1 (MQ=255) tataGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcctg < 2:219680‑M2/150‑122 (MQ=255) | GCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACC > NC_002947/337663‑337960 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |