New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4828690 = | 33 (1.760) | 3 (0.170) | 3/228 | NT | 11.4% | coding (2545/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | 4828734 = | 16 (0.920) | coding (2501/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
GCACCTTGAGGCTGAAGCGCGCGGCGCTGTGTTCGCGCTGGCTGGCGCGCGGGTGGTCAGTGCACAGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGCGAATTCTTCGAGCAGGATGTTCAGCGACCAGCCGTCGGCAACGATGTG > NC_002947/4828543‑4828828 | gCACCTTGAGGCTGAAGCGCGCGGCGCTGTGTTCGCGCTGGCTGGCGCGCGGGTGGTCAGTGCACAGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGcc > 1:29831/1‑150 (MQ=255) ccTTGAGGCTGAAGCGCGCGGCGCTGTGTGCGCGCTGGCTGGCGCGCGGGTGGTCAGTGCACAGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCt < 1:255550/150‑1 (MQ=255) cTTGAGGCTGAAGCGCGCGGCGCTGTGTTCGCGCTGGCTGGCGCGCGGGTGGTCAGTGCACAGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTg > 1:153999/1‑150 (MQ=255) ggtgcgcctgggggacgaagagcatcagctgtgggtgaccctgcaccacatcgttgccgacggctggtcgctgaacatcctgctcgaagaattcgccaagctgtatgccgctcgctgccaaggcctggaggccaacctggcGCCGCTGcc > 1:151658‑M1/142‑150 (MQ=255) gcgcgcGGCGCTGTGTTCGCGCTGGCTGGCGCGCGGGTGGTCAGTGCACAGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTa < 1:236387/150‑1 (MQ=255) tgaccctgcaccacatcgttgccgacggctggtcgctgaacatcctgctcgaagaattcgccaagctgtatgccgctcgctgccaaggcctggaggccaacctggcGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCagcggcagcggc > 1:322507‑M1/107‑150 (MQ=255) tggcGCGCGGGTGGTCAGTGCACAGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAgcggcg > 2:341033/1‑150 (MQ=255) gcgcgcGGGTGGTCAGTGCACAGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGcc < 2:201205/150‑1 (MQ=255) gggTGGTCAGTGCACAGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTg < 2:504672/150‑1 (MQ=255) acaGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCt < 2:337641/90‑1 (MQ=255) acaGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCt > 1:337641/1‑90 (MQ=255) caGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTg < 2:331231/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGc > 2:78258/1‑105 (MQ=255) gTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGc < 1:78258/105‑1 (MQ=255) ccGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCgg > 1:427871/1‑150 (MQ=255) ggCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCa < 1:341033/150‑1 (MQ=255) caccacCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCg < 2:430760/80‑1 (MQ=255) caccacCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCg > 1:430760/1‑80 (MQ=255) caccacCAAGGTGTGCCTCCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGc < 1:322987/78‑1 (MQ=255) caccacCAAGGTGTGCCTCCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGc > 2:322987/1‑78 (MQ=255) ccaccaAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCACCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTg > 2:367628/1‑150 (MQ=255) caccaAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTgg > 1:446868/1‑150 (MQ=255) accaAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCg < 2:230188/82‑1 (MQ=255) accaAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCg > 1:230188/1‑82 (MQ=255) accaAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGc < 1:91515/150‑1 (MQ=255) caAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCcagcgg < 1:429709/94‑1 (MQ=255) caAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCcagcgg > 2:429709/1‑94 (MQ=255) aaGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGCGaa < 2:29831/150‑1 (MQ=255) ttcgccaagctgtatgccgctcgctgccaaggcctggaggccaacctggcGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTcc > 2:249747‑M1/51‑109 (MQ=255) ttcgccaagctgtatgccgctcgctgccaaggcctggaggccaacctggcGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTcc < 1:249747‑M1/59‑1 (MQ=255) ttCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGCGAATTCTTCGAGc > 1:349214/1‑150 (MQ=255) tCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGCGAATTCTTCGAGCa < 2:153999/150‑1 (MQ=255) tACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTg < 2:151666/129‑1 (MQ=255) tACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTg > 1:151666/1‑129 (MQ=255) tGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGGCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGCGAATTCTTCGAGCAGGATGTTc > 1:359388/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGCGAATTCTTCGAGCAGGATGTTCAGCGACCAGCCg > 2:276595/1‑150 (MQ=255) ggCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGCGAATTCTTCGAGCAGGATGTTCAGCGACCAGCCGTc < 1:135463/150‑1 (MQ=255) agccagccATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGCGAATTCTTCGAGCAGGATGTTCAGCGACCAGCCGTCGGCAACGAtgtg < 2:409464/150‑1 (MQ=255) | GCACCTTGAGGCTGAAGCGCGCGGCGCTGTGTTCGCGCTGGCTGGCGCGCGGGTGGTCAGTGCACAGGTCGAGCGCCGGCAGCTCACCACCAAGGTGTGCCTTCCAGTACTGCAACTGGCGCTCGGCTTCACCGTCAGCCAGCCATTGCCGCTGCCAGCTGCCGTAGTCGGCGTAACCCAGCGGCAGCGGCGCCAGGTTGGCCTCCAGGCCTTGGCAGCGAGCGGCATACAGCTTGGCGAATTCTTCGAGCAGGATGTTCAGCGACCAGCCGTCGGCAACGATGTG > NC_002947/4828543‑4828828 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |