| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5957953 = | 18 (0.960) | 4 (0.230) | 4/230 | NT | 18.3% | coding (1301/2856 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
| ? | NC_002947 | 5957991 = | 19 (1.080) | coding (1339/2856 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
CGCAGCCAATGGAAAGTGCAGCAGGTCGCCGTCGAGCGGCGTGAGCTGGTGGCCGAGCTTAACCTCAGTTATCGCTTCCTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTGGTCCAGGCACCCAACCGCAAGGAGCCGGGCAGCTACCACTGGGAGCTG > NC_002947/5957808‑5958098 | agtgctgtacctcatgggtgctcaggttgccgctgtacagctcccagtggtagctgcccggctccttgcggttgggtgcctggaccagcgtcagggtgtcttcggcgaggtcaggggcgatgccggggttaatcacttcgaccttGCCgg < 1:437747‑M1/5‑1 (MQ=255) gCAGTCAATGGAAAGTGCAGCAGGTCGCCGTCGAGCGGCGTGAGCTGGTGGCCGAGCTTAACCTCAGTTATCGCTTCCTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGgc < 1:213771/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAATGGAAAGTGCAGCAGGTCGCCGTCGAGCGGCGTGAGCTGGTGGCCGAGCTTAACCTCAGTTATCGCTTCCTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGgc < 2:405550/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCGTCGAGCGGCGTGAGCTGGTGGCCGAGCTTAACCTCAGTTATCGCTTCCTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAgcg > 2:207962/1‑150 (MQ=255) tCGCCGTCGAGCGGCGTGAGCTGGTGGCCGAGCTTAACCTCAGTTATCGCTTCCTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGa < 1:261853/145‑1 (MQ=255) tCGCCGTCGAGCGGCGTGAGCTGGTGGCCGAGCTTAACCTCAGTTATCGCTTCCTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGa > 2:261853/1‑145 (MQ=255) ctcccagtggtagctgcccggctccttgcggttgggtgcctggaccagcgtcaaggtgtcttcggcgaggtcaggggcgatgccggggttaatcacttcgaccttGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAgg > 1:331532‑M1/106‑147 (MQ=255) ctcccagtggtagctgcccggctccttgcggttgggtgcctggaccagcgtcaaggtgtcttcggcgaggtcaggggcgatgccggggttaatcacttcgaccttGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAgg < 2:331532‑M1/42‑1 (MQ=255) gCTGGTGGCCGAGCTTAACCTCAGTTATCGCTTCCTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGt < 1:192936/150‑1 (MQ=255) cggctccttgcggttgggtgcctggaccagcgtcagggtgtcttcggcgaggtcaggggcgatgccggggttaatcacttcgaccttGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAgcgccgcgcc > 1:326231‑M1/88‑122 (MQ=255) cggctccttgcggttgggtgcctggaccagcgtcagggtgtcttcggcgaggtcaggggcgatgccggggttaatcacttcgaccttGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAgcgccgcgcc < 2:326231‑M1/35‑1 (MQ=255) cTCAGTCATCGCTTACTCACCCAGCTCGCCCGCACTCAGAACGCAAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTGAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCCCCGGCCAGGTCGAAGTGATTCACCCCGGCATcccc > 2:246879/1‑150 (MQ=255) cTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGaa < 2:72755/150‑1 (MQ=255) cTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGaa < 2:278522/150‑1 (MQ=255) aGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACAccc > 1:171188/1‑150 (MQ=255) aGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACAccc < 1:207962/150‑1 (MQ=255) ccAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTGGTCCa > 1:75466/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTg > 1:388402/1‑138 (MQ=255) gCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTg < 2:388402/138‑1 (MQ=255) cgcgCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTGGTCCAGGCACCCAACCGCAAg < 2:75466/150‑1 (MQ=255) gcCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTGGTCCAGGCACCCAACCGCAAGGAg > 2:100785/1‑150 (MQ=255) cgcgACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTGGTCCAGGCACCCAACCGCAAGGAGCCGGGCAGc < 1:100785/150‑1 (MQ=255) ccTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTGGTCCAGGCACCCAACCGCAAGGAGCCGGGCAGCTACCa > 2:444576/1‑150 (MQ=255) cTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTGGTCCAGGCACCCAACCGCAAGGAGCCGGGCAGCTACCACTGGGAGCTg > 2:477130/1‑150 (MQ=255) | CGCAGCCAATGGAAAGTGCAGCAGGTCGCCGTCGAGCGGCGTGAGCTGGTGGCCGAGCTTAACCTCAGTTATCGCTTCCTCAGCCAGTTCGCCCGCACCCAGAACGCCAGCAGCCGCGCCGACCAGCGCGACCTCAATGTGCTGGGCCGGCGCCTGTACGCCGCCTTCGAGCGCCGCGCCGGCAAGGTCGAAGTGATTAACCCCGGCATCGCCCCTGACCTCGCCGAAGACACCCTGACGCTGGTCCAGGCACCCAACCGCAAGGAGCCGGGCAGCTACCACTGGGAGCTG > NC_002947/5957808‑5958098 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |