New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2429960 | 25 (0.840) | 7 (0.310) | 7/214 | 1.8 | 24.5% | intergenic (+47/+66) | PP_2129/PP_2130 | hypothetical protein/lytic transglycosylase |
? | NC_002947 | = 2429975 | 24 (1.050) | intergenic (+62/+51) | PP_2129/PP_2130 | hypothetical protein/lytic transglycosylase |
AGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTG > NC_002947/2429829‑2430121 | aGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttg > 1:457936‑M2/1‑147 (MQ=255) cGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggag > 2:691751‑M2/1‑141 (MQ=255) gTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtag < 1:603860‑M2/146‑7 (MQ=255) gTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtag > 2:603860‑M2/1‑140 (MQ=255) gCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgg > 1:546791‑M2/1‑138 (MQ=255) cTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCTTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcggg > 1:346006‑M2/1‑137 (MQ=255) cTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcggg > 2:41560‑M2/1‑137 (MQ=255) tgtacagaaCCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcggggtcac < 1:186677‑M2/146‑19 (MQ=255) agtgaacCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgggttgacccg < 1:316128‑M2/147‑22 (MQ=255) aGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGTGAAGCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCtggtaggagcggggtccccggcg < 2:233542‑M2/150‑24 (MQ=255) cTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccg > 1:382432‑M2/1‑118 (MQ=255) tggCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCa < 2:501234/150‑1 (MQ=255) ggATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTATTGCCTGCGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAAGCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATc < 1:295961/150‑1 (MQ=255) ttAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAATCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATAcc < 1:21975/149‑1 (MQ=255) gTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATAcc > 1:257638/1‑150 (MQ=255) aacccTGGAATAGGTGTGTCGCCTGCGCCGGCCTCTTCGCGGGTGACCCCCCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGTGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCa < 1:233542/147‑1 (MQ=38) ttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGc > 2:362361/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTg > 2:218558/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGGACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCg > 2:587134/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCgg < 1:218558/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGc > 1:412322/1‑123 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGc < 2:412322/123‑1 (MQ=255) ccTCTACGCGGGTGAACACGCTCCTTCCCCACACGACCAAATCCTGATATGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCATTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCa < 2:257638/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggcacaggcaacacacctattccaggatttctacttccatccccacctccagccacccactgccatccacagccagg < 2:164304‑M2/150‑109 (MQ=255) tctTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTAGAACAAATACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCAACACTGGCTGCGGTGAATTCAGc > 1:224517/1‑150 (MQ=38) gcgGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGACCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTAAATTTCTg > 1:356204/1‑150 (MQ=255) cgGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGc < 2:204577/150‑1 (MQ=255) gAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggcacaggcaacacacctattccaggatttctacttccatccccacctccagccacccactgccatccacagccaggttctggccgaa > 1:164304‑M2/1‑31 (MQ=255) gAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTGATAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTa > 1:412074/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggcacaggcaacacacctattccaggatttctacttccatccccacctccagccacccactgccatc > 2:303338‑M2/1‑28 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggcacaggcaacacacctattccaggatttctacttccatccccacctccagccacccactgccatc < 1:303338‑M2/126‑99 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGAt > 2:184658/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggtacaggcaacacacctattccaggatttctacttccatccccacctccagccacccactgccatccacagccaggttctggccgaacagc < 2:292479‑M2/150‑124 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGt < 1:472112/126‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGt > 2:472112/1‑126 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATc > 2:335961/1‑150 (MQ=255) cTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggtacaggcaacacacctattccaggatttctacttccatccccacctccagccacccactgccatccacagccaggttctg > 2:371242‑M2/1‑21 (MQ=255) cTACAACGACCGCTCAAACCCttgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggtacaggcaacacacctattccaggatttctacttccatccccacctccagccacccactgccatccacagccaggttctg < 1:371242‑M2/134‑114 (MQ=255) tACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTGAGCTTCTGCCCGTAGATCAcc > 2:151022/1‑146 (MQ=255) tACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCAcc < 1:151022/146‑1 (MQ=255) gcccGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGTGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACa < 2:356204/148‑1 (MQ=255) aCCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCAGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTg > 2:531014/1‑150 (MQ=255) | AGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTG > NC_002947/2429829‑2430121 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |