New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4055050 = | 26 (0.870) | 7 (0.240) | 6/270 | 2.7 | 21.2% | coding (237/393 nt) | PP_3574 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4055078 = | 27 (0.940) | coding (265/393 nt) | PP_3574 | hypothetical protein |
CAAGCTGGTGGGCCTGGGTGACCCGCGCGCACAAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCG > NC_002947/4054930‑4055224 | cAAGCTGGTGGGCCTGGGTGACCCGCGCGCACAAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGCCTCTCCCCGACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTa > 2:169157/1‑150 (MQ=255) gtggGCCTGGGTGACCCGCGCGCACAAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAaggag < 1:202040/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGTGACCCGCTCGCACAAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGATCCGGTGTACAAGGAGGTgg < 2:318157/150‑1 (MQ=255) cggcgatcacgtcgatctccatcagccactcggcctgggccaacccggccaccaccaacccggtggaaatcgggaacacgcccttgagccacttgcccacctccttgtacaccgacccgcgcttccgcgagccggtgTACAAGGAGGTgg < 1:256653‑M2/13‑1 (MQ=255) cTGGGTGACCCGCGCGCACAAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGc > 1:61317/1‑150 (MQ=255) gggTGACCCGCGCGCACAATCCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGACGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCaa < 2:465687/150‑1 (MQ=255) gcGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGAGCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTcc < 1:683008/149‑1 (MQ=255) cGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTccc < 2:61317/150‑1 (MQ=255) actcggcctgggccaacccggccaccaccaacccggtggaaatcgggaacacgcccttgagccacttgcccacctccttgtacaccgacccgcgcttccgcgagccggtgTACAAGGAGGTg < 2:484168‑M2/12‑1 (MQ=255) actcggcctgggccaacccggccaccaccaacccggtggaaatcgggaacacgcccttgagccacttgcccacctccttgtacaccgacccgcgcttccgcgagccggtgTACAAGGAGGTg > 1:484168‑M2/111‑122 (MQ=255) gATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCgtg < 1:135675/136‑1 (MQ=255) gATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCgtg > 2:135675/1‑136 (MQ=255) gaaCGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGtt > 2:636821/1‑150 (MQ=255) aaCGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTtg < 1:318526/150‑1 (MQ=255) ttCAAGCAGTTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCAACGGGAtggtg > 1:287676/2‑150 (MQ=255) ttCAAGCAGTTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCAGCGCTTCCGCGAGCGGATGTAAAAGAAGGTGGGCAGAGGGCTCAATAGCGTGTTACCGATTTCCACCGGGTtggtg > 2:682371/2‑150 (MQ=255) gTCAAGCCACTGCTTGAACAAGCCCTCCCCGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCCCCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTtggtg < 2:5971/150‑1 (MQ=255) agaagCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCa > 2:3014/1‑150 (MQ=255) cGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGCCGCACTCAGGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGTTGTTGTACGGGATGGCCCAGGCCGa > 1:12858/1‑150 (MQ=255) gCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGt < 1:636821/150‑1 (MQ=255) tCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCAAGAGGTTGTTGTTGGCCGTGTTGGCCCAGGCCGAGTgg > 2:505856/1‑150 (MQ=255) gCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGAGCTTGAAGCCGGCGATGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGAt > 1:303068/1‑150 (MQ=255) acaTCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCg > 2:275572/1‑150 (MQ=255) gTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTg > 2:655016/1‑150 (MQ=255) gTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTg > 1:344736/1‑150 (MQ=255) tCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGa > 2:179443/1‑150 (MQ=255) aaGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATc > 2:425044/1‑150 (MQ=255) ccacctccttgtaCACCGGCTCGCGGAAGCGCGGGTCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCg < 1:256653‑M1/137‑1 (MQ=255) cacctccttgtaCACCGGCTCGCGGAAGCGCGGGTCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGt > 1:484168‑M1/13‑122 (MQ=255) cacctccttgtaCACCGGCTCGCGGAAGCGCGGGTCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGt < 2:484168‑M1/110‑1 (MQ=255) ccTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCAGATTGGGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGttt > 1:470997/1‑149 (MQ=255) CACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCa > 1:425044‑M1/1‑150 (MQ=255) accggctcgcggaagcgcgggtcggtgTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATc < 1:675887‑M2/96‑1 (MQ=255) accggctcgcggaagcgcgggtcggtgTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATc > 2:675887‑M2/28‑123 (MQ=255) accggctcgcggaagcgcgggtcggtgTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAg > 2:124517‑M2/28‑150 (MQ=255) ACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAg < 2:601783‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGc > 1:601783‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgcggaagcgcgggtcggtgTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGa < 2:256653‑M2/129‑1 (MQ=255) ccGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGa > 2:393415/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGAcc < 1:393415/150‑1 (MQ=255) gtgTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGTCCTGAATGGCg < 1:3014‑M2/147‑1 (MQ=255) | CAAGCTGGTGGGCCTGGGTGACCCGCGCGCACAAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCCGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCG > NC_002947/4054930‑4055224 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |