New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1711779 = | 43 (0.950) | 3 (0.070) | 3/238 | NT | 7.2% | coding (2356/2628 nt) | ppc | phosphoenolpyruvate carboxylase |
? | NC_002947 | 1711821 = | 36 (0.830) | coding (2398/2628 nt) | ppc | phosphoenolpyruvate carboxylase |
CTTGGCCCGAGGTCAGGGTGAGTTGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGC > NC_002947/1711631‑1711926 | cTTGGCCCGAGGTCAGGGTGAGTTGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCt < 2:158130/150‑1 (MQ=255) gcggctgcgcgagcgggccagcaactctgcctgcaggcggtgcaacgggtccagataggtattgcgcaggctaatgaattccagtgtctcggggctgtgcgccagtagcaccggctgcccggtcaggcccagcaccacctggcatgaCTg > 2:217188‑M1/148‑150 (MQ=255) tGGCCCGAGGTCAGGGTGAGTTGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGc < 2:1184344/150‑1 (MQ=255) gCCCGAGGTCAGGGTGAGTTGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCAAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGt > 1:499506/1‑150 (MQ=255) ccGAGGTCAGGGTGAGTTGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGGACAACCGCGCCTGCGGcc > 2:278214/1‑150 (MQ=255) ggTCAGGGTGAGTTGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTa < 2:232058/150‑1 (MQ=255) cAGGGTGAGTTGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAACTTGCCTATGCCTAGGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGt < 1:329438/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTgc < 2:599438/143‑1 (MQ=255) ttGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTgc > 1:599438/1‑143 (MQ=255) tGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGcgcg > 2:127500/1‑150 (MQ=255) gCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGAc < 2:1001093/150‑1 (MQ=255) cacaGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGAcc > 2:660549/1‑150 (MQ=255) acaGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCTCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGAc > 1:309893/1‑148 (MQ=255) acaGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCTCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGAc < 2:309893/148‑1 (MQ=255) gATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGGAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTAtt < 2:875187/150‑1 (MQ=255) caacgggtccagataggtattgcgcaggctaatgaattccagtgtctcggggctgtgcgcccatcagcccgcctgcccggtcaggcccagcaccacctggcatgaCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCa > 1:379948‑M1/106‑150 (MQ=255) ggCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGCCCTATTGTCGCAGTCATGcc > 1:214287/1‑150 (MQ=255) ccGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAg < 2:605024/150‑1 (MQ=255) ccGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGATGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAg < 1:33737/150‑1 (MQ=255) cGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTa > 2:319869/1‑131 (MQ=255) cGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTa < 1:319869/131‑1 (MQ=255) ttcttcCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAggtg > 2:916125/1‑150 (MQ=255) agataggtattgcgcaggctaatgaattccagtgtctcggggctgtgcgccagtagcaccggctgcccggtcaggcccagcaccacctggcatgaCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGGCCTATTGTCGCAGTCATGc < 1:9255‑M1/48‑1 (MQ=255) agataggtattgcgcaggctaatgaattccagtgtctcggggctgtgcgccagtagcaccggctgcccggtcaggcccagcaccacctggcatgaCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGGCCTATTGTCGCAGTCATGc > 2:9255‑M1/96‑143 (MQ=255) gCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTgg > 2:936038/1‑150 (MQ=255) gCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTgg > 1:33205/1‑150 (MQ=255) tGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCa > 1:839275/1‑115 (MQ=255) tGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCa < 2:839275/115‑1 (MQ=255) tGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCgg > 2:467025/1‑150 (MQ=255) gAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCt < 2:794591/71‑1 (MQ=255) gAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCt > 1:794591/1‑71 (MQ=255) gAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTg > 2:611447/1‑150 (MQ=255) gAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATGGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTg < 2:514918/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGcaca > 1:36311/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAg > 2:219820/1‑150 (MQ=255) cGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCga < 2:214287/150‑1 (MQ=255) cGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCga < 1:99967/150‑1 (MQ=255) aTGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACTTGTTTGCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCgaga < 1:265217/150‑1 (MQ=255) gcAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCt < 1:259526/102‑1 (MQ=255) gcAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCt > 2:259526/1‑102 (MQ=255) cAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTg < 1:219820/150‑1 (MQ=255) cGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCAt < 2:33205/150‑1 (MQ=255) cTACGACGAACGTCTGGTACAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCt > 2:379288/1‑150 (MQ=255) cTACGACGAACGTCTGGGGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCt > 1:817967/1‑150 (MQ=255) gaACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAAt < 1:660549/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTa > 2:985286/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTAt < 2:36311/150‑1 (MQ=255) ggTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCt < 2:1131195/150‑1 (MQ=255) cAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGAc < 1:611447/150‑1 (MQ=255) ccGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAg > 1:939770/1‑101 (MQ=255) ccGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAg < 2:939770/101‑1 (MQ=255) aCCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGc > 1:935645/1‑150 (MQ=255) CTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGa > 1:1056601‑M1/1‑140 (MQ=255) CTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGa < 2:1056601‑M1/140‑1 (MQ=255) | CTTGGCCCGAGGTCAGGGTGAGTTGCTGGCACAGATGCGCGAGCAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCTACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGC > NC_002947/1711631‑1711926 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |