New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1711779 = | 43 (0.950) | 3 (0.070) | 3/238 | NT | 7.2% | coding (2356/2628 nt) | ppc | phosphoenolpyruvate carboxylase |
? | NC_002947 | 1711821 = | 36 (0.830) | coding (2398/2628 nt) | ppc | phosphoenolpyruvate carboxylase |
CAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGCACCGCCTGCAGGCAGAGTTGCTGGCCCGCTCGCGCAGCCGC > NC_002947/1711674‑1711967 | caacgggtccagataggtattgcgcaggctaatgaattccagtgtctcggggctgtgcgcccatcagcccgcctgcccggtcaggcccagcaccacctggcatgaCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCa > 1:379948‑M1/106‑150 (MQ=255) ggCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGCCCTATTGTCGCAGTCATGcc > 1:214287/1‑150 (MQ=255) ccGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAg < 2:605024/150‑1 (MQ=255) ccGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGATGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAg < 1:33737/150‑1 (MQ=255) ttcttcCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAggtg > 2:916125/1‑150 (MQ=255) agataggtattgcgcaggctaatgaattccagtgtctcggggctgtgcgccagtagcaccggctgcccggtcaggcccagcaccacctggcatgaCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGGCCTATTGTCGCAGTCATGc > 2:9255‑M1/96‑143 (MQ=255) agataggtattgcgcaggctaatgaattccagtgtctcggggctgtgcgccagtagcaccggctgcccggtcaggcccagcaccacctggcatgaCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGGCCTATTGTCGCAGTCATGc < 1:9255‑M1/48‑1 (MQ=255) gCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTgg > 1:33205/1‑150 (MQ=255) gCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTgg > 2:936038/1‑150 (MQ=255) tGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCgg > 2:467025/1‑150 (MQ=255) gAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTg > 2:611447/1‑150 (MQ=255) gAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATGGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTg < 2:514918/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGcaca > 1:36311/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAg > 2:219820/1‑150 (MQ=255) cGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCga < 1:99967/150‑1 (MQ=255) cGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCga < 2:214287/150‑1 (MQ=255) aTGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACTTGTTTGCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCgaga < 1:265217/150‑1 (MQ=255) gcAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCt > 2:259526/1‑102 (MQ=255) gcAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCt < 1:259526/102‑1 (MQ=255) cAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTg < 1:219820/150‑1 (MQ=255) cGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCAt < 2:33205/150‑1 (MQ=255) cTACGACGAACGTCTGGTACAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCt > 2:379288/1‑150 (MQ=255) cTACGACGAACGTCTGGGGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCt > 1:817967/1‑150 (MQ=255) gaACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAAt < 1:660549/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTa > 2:985286/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTAt < 2:36311/150‑1 (MQ=255) ggTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCt < 2:1131195/150‑1 (MQ=255) cAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGAc < 1:611447/150‑1 (MQ=255) gcatgactgcgacaataggccgcgcaggtgcgcacctaaaggacgcagTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCt < 1:9255‑M2/95‑1 (MQ=255) gcatgactgcgacaataggccgcgcaggtgcgcacctaaaggacgcagTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCt > 2:9255‑M2/49‑143 (MQ=255) ccGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAg < 2:939770/101‑1 (MQ=255) ccGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAg > 1:939770/1‑101 (MQ=255) tgactgcgacaataggtcgcgcaggtgcgcacctaaaggacgcagTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGGCGG‑GCTGATGGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTg > 1:379948‑M2/46‑150 (MQ=255) aCCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGc > 1:935645/1‑150 (MQ=255) CTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGa < 2:1056601‑M1/140‑1 (MQ=255) CTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGa > 1:1056601‑M1/1‑140 (MQ=255) gcgcACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGgcg > 2:506495/1‑75 (MQ=255) gcgcACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGgcg < 1:506495/75‑1 (MQ=255) ccTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCCTCCTAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGCACCGCCTGCAGGCAGAGTTGCt < 1:306342/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTg < 2:160875/117‑1 (MQ=255) cTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTg > 1:160875/1‑117 (MQ=255) cTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGCACCGCCTGCAGGCAGAGTTGCTg < 2:817967/150‑1 (MQ=255) tGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTCTCTGGACCCGTTGCACCGCCTGCAGGCAGAGTTGCTgg < 2:696639/150‑1 (MQ=255) tGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGCACCGCCTGCAGGCAGAGTTGCTgg > 1:696639/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGTAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGCACCGCCTGCAGGCAGAGTTGCTGGCCCGCTCgcgc > 1:940597/1‑150 (MQ=255) gTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGCACCGCCTGCACGCAGAGTTGCTGGCCCGCCCGCGGAg > 2:5893/1‑150 (MQ=255) cagTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGCACCGCCTGCAGGCAGAGTTGCTGGCCCGCTCGCGCAGCcgc > 2:217188‑M2/4‑150 (MQ=255) | CAATGGCCGTTCTTCCGCACCCGCATCGACATGCTGGAAATGGTGCTGGCCAAGGCCGATGCGCAAATTGCCGAGGCCTACGACGAACGTCTGGTGCAACCGCACCTGCGTCCTTTAGGTGCGCACCTGCGCGACCTATTGTCGCAGTCATGCCAGGTGGTGCTGGGCCTGACCGGGCAGCCGGTGCT‑ACTGGCGCACAGCCCCGAGACACTGGAATTCATTAGCCTGCGCAATACCTATCTGGACCCGTTGCACCGCCTGCAGGCAGAGTTGCTGGCCCGCTCGCGCAGCCGC > NC_002947/1711674‑1711967 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |