New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1747734 = | 65 (1.440) | 4 (0.090) | 4/236 | NT | 6.5% | intergenic (‑184/+347) | PP_5473/PP_5474 | LuxR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1747807 = | 53 (1.230) | intergenic (‑257/+274) | PP_5473/PP_5474 | LuxR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
TGATGCCGAAGCTTCTTGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTG > NC_002947/1747586‑1747882 | tGATGCCGAAGCTTCTTGCGATTTCTTTGGTGCTCAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCt > 1:886202/1‑150 (MQ=255) gCCGAAGCTTCTTGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCAt < 2:1178932/150‑1 (MQ=255) cttcttGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGAAGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGt < 1:687502/150‑1 (MQ=255) tGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGAcgc < 2:1073018/150‑1 (MQ=255) tttCTTTGGTGGTAAGTCATCGAGCAACCTCGAGCAGTCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGAcgctcgct > 2:318550/1‑150 (MQ=255) tttCTCTGGTGATACGTCTTCGAGCAACCTCGAGGAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCCGGCCGCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATCTTTGCTCTCAGTCTGGGGTGCATTGGTCGTTAcgctcgct > 2:318412/1‑150 (MQ=18) tttGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGt < 1:475238/136‑1 (MQ=255) tttGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGt > 2:475238/1‑136 (MQ=255) ttGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGt < 2:652032/150‑1 (MQ=255) ggtggtAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCt < 2:475414/150‑1 (MQ=255) tggtAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTAc > 2:588780/1‑150 (MQ=255) gtAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCGTTTTTGATCTCTGTGTGGGCTGCATTGGTCGTAACGCGCGCTGCCGTCTACCt > 1:61176/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTc > 2:820238/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCGCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTc < 2:5900/150‑1 (MQ=255) aGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCCTTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTccc > 2:152694/1‑150 (MQ=255) gTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATTCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCg < 1:545274/150‑1 (MQ=255) tCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCgg > 1:1032549/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGAcc > 2:602394/1‑150 (MQ=255) gAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCaa < 1:134453/150‑1 (MQ=255) aGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAg < 1:820238/150‑1 (MQ=255) gCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAgg < 2:1032549/150‑1 (MQ=255) gCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAgg > 1:229383/1‑150 (MQ=255) cAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGACTGCACTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAggg < 2:886202/150‑1 (MQ=255) aCCTCGTGAAGGCATTTCTATTCGCTTGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGGCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGa < 2:61176/150‑1 (MQ=18) cTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCCTTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAgg > 2:250076/1‑150 (MQ=255) cTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTAc > 2:156836/1‑131 (MQ=255) cTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTAc < 1:156836/131‑1 (MQ=255) gagaAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCg < 2:37362/150‑1 (MQ=255) gagaAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCg > 1:710269/1‑150 (MQ=255) aGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACg > 2:452968/1‑150 (MQ=255) gCATTGCTATTCGCCACGCGCCAGGCTTCGGCGGAGGTTGGCTATCCATGCGGCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTc < 2:1044906/150‑1 (MQ=18) tGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGa < 2:229383/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGa > 2:729823/1‑150 (MQ=255) gcgAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCa > 1:116734/1‑150 (MQ=255) gcgAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCa > 2:794053/1‑150 (MQ=255) ccatgcagaccttaaggtgcaagcccgtgcgccttacagcccataagacccatccccatcaaccttaaaccgaCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCAc < 2:741567‑M1/62‑1 (MQ=255) ccatgcagaccttaaggtgcaagcccgtgcgccttacagcccataagacccatccccatcaaccttaaaccgaCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCAc > 1:741567‑M1/74‑135 (MQ=255) tggcgCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCt > 1:803989/5‑100 (MQ=255) tggcgCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCt < 2:803989/96‑1 (MQ=255) ccAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGGTAGTGATTGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGttt > 1:1883/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTCACCCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGTAGTCGGtgt > 1:624657/1‑148 (MQ=255) agttcTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCTGTTGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGCCCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTaa < 2:429346/146‑1 (MQ=21) aGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTaa < 1:729823/150‑1 (MQ=255) aGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTaa < 1:815747/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAg < 1:152694/150‑1 (MQ=255) cttaaggtgcaagcccgtgcgccttacagcccataagacccatccccatcaaccttaaaccgaCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGt > 2:814904‑M1/64‑122 (MQ=255) cttaaggtgcaagcccgtgcgccttacagcccataagacccatccccatcaaccttaaaccgaCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGt < 1:814904‑M1/59‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGATCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgat < 1:286621/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatggggatg > 1:286616/1‑150 (MQ=255) tGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatggggatgg < 1:417355/150‑1 (MQ=255) ggCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCaa > 2:769778/1‑96 (MQ=255) ggCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCaa < 1:769778/96‑1 (MQ=255) cTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGGTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCt < 1:1056008/150‑1 (MQ=255) cTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCt > 1:419335/1‑150 (MQ=255) cTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCt > 2:495001/1‑150 (MQ=255) tCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTAt < 1:495001/150‑1 (MQ=255) tCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTAt < 1:452968/150‑1 (MQ=255) gcgcCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTAt < 1:535819/145‑1 (MQ=255) gcgcCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTAt > 2:535819/1‑145 (MQ=255) aTAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAgg < 1:1155394/150‑1 (MQ=255) cGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACggg > 1:780820/1‑150 (MQ=255) tgtCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTTTCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCt < 1:318550/150‑1 (MQ=255) ggtCCATGTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTATACCTGCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCt < 1:318412/149‑1 (MQ=255) tCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGAAGGTTTAGGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTg > 2:822731/1‑150 (MQ=255) tttttGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCAcc > 1:525383/1‑150 (MQ=255) gATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAg < 2:116734/150‑1 (MQ=255) tctcGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatggggatgg > 2:215763/1‑109 (MQ=255) tctcGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGGTgatggggatgg < 1:215763/109‑1 (MQ=255) gtgtGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATg > 2:35594/1‑77 (MQ=255) gtgtGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATg < 1:35594/77‑1 (MQ=255) gCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAg > 2:401587/1‑137 (MQ=255) gCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAg < 1:401587/137‑1 (MQ=255) gCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGgtg > 2:201626/1‑150 (MQ=255) | TGATGCCGAAGCTTCTTGCGATTTCTTTGGTGGTAAGTCCTCGAGCAACCTCGAGAAGGCATTGCAATTCGCGAGGCGCCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTG > NC_002947/1747586‑1747882 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |