New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1747734 = | 65 (1.440) | 4 (0.090) | 4/236 | NT | 6.5% | intergenic (‑184/+347) | PP_5473/PP_5474 | LuxR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1747807 = | 53 (1.230) | intergenic (‑257/+274) | PP_5473/PP_5474 | LuxR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
CCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCG > NC_002947/1747664‑1747942 | ccAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGGTAGTGATTGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGttt > 1:1883/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTCACCCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGTAGTCGGtgt > 1:624657/1‑148 (MQ=255) agttcTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCTGTTGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGCCCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTaa < 2:429346/146‑1 (MQ=21) aGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTaa < 1:729823/150‑1 (MQ=255) aGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTaa < 1:815747/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAg < 1:152694/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGATCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgat < 1:286621/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatggggatg > 1:286616/1‑150 (MQ=255) tGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatggggatgg < 1:417355/150‑1 (MQ=255) cTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGGTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCt < 1:1056008/150‑1 (MQ=255) cTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCt > 2:495001/1‑150 (MQ=255) cTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCt > 1:419335/1‑150 (MQ=255) tCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTAt < 1:452968/150‑1 (MQ=255) tCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTAt < 1:495001/150‑1 (MQ=255) gcgcCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTAt > 2:535819/1‑145 (MQ=255) gcgcCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTAt < 1:535819/145‑1 (MQ=255) aTAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAgg < 1:1155394/150‑1 (MQ=255) cGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACggg > 1:780820/1‑150 (MQ=255) tgtCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTTTCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCt < 1:318550/150‑1 (MQ=255) ggtCCATGTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTATACCTGCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCt < 1:318412/149‑1 (MQ=255) tCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGAAGGTTTAGGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTg > 2:822731/1‑150 (MQ=255) tttttGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCAcc > 1:525383/1‑150 (MQ=255) gATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAg < 2:116734/150‑1 (MQ=255) tctcGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatggggatgg > 2:215763/1‑109 (MQ=255) tctcGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGGTgatggggatgg < 1:215763/109‑1 (MQ=255) gCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAg > 2:401587/1‑137 (MQ=255) gCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAg < 1:401587/137‑1 (MQ=255) gCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGgtg > 2:201626/1‑150 (MQ=255) TGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGggtgtt > 1:602394‑M1/1‑149 (MQ=255) TGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGgtgtg < 2:71887‑M1/150‑1 (MQ=255) GCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGgtgtgt > 1:794053‑M1/1‑150 (MQ=255) ATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatggggatgg < 2:920402‑M1/93‑1 (MQ=255) ATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTgatggggatgg > 1:920402‑M1/1‑93 (MQ=255) TTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCCCGGGCTTGCACCTTAAGGTCCGATCGCGTGTGTGAt < 1:548109‑M1/150‑1 (MQ=255) TTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGAt > 1:201626‑M1/1‑150 (MQ=255) TTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGAt > 2:539332‑M1/1‑150 (MQ=255) gTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTg > 1:939186/1‑150 (MQ=255) gTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTg > 2:1025126/1‑150 (MQ=255) cGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGTTGTGTGATCTGAc < 2:710269/150‑1 (MQ=255) cGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGAc < 1:588780/150‑1 (MQ=255) gtgacgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcacgaccaatgcagTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATgg < 2:741567‑M2/73‑1 (MQ=255) gtgacgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcacgaccaatgcagTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATgg > 1:741567‑M2/63‑135 (MQ=255) gACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCgg > 1:113854/1‑150 (MQ=255) acgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcacgaccaatgcagTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAg > 2:814904‑M2/60‑122 (MQ=255) acgttcgccctccccttggtccgggaggtagacggcagcgagcgtcacgaccaatgcagTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAg < 1:814904‑M2/63‑1 (MQ=255) aCGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATggg < 1:248875/93‑1 (MQ=255) aCGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATggg > 2:248875/1‑93 (MQ=255) ccGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCgg < 2:1018301/150‑1 (MQ=255) gTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAg > 1:1063823/1‑88 (MQ=255) gTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAg < 2:1063823/88‑1 (MQ=255) tCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGgtgtgt > 1:940927/1‑119 (MQ=255) tCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGgtgtgt < 2:940927/119‑1 (MQ=255) tCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCAtttt < 2:939186/150‑1 (MQ=255) ccGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGt < 2:407599/103‑1 (MQ=255) ccGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGt > 1:407599/1‑103 (MQ=255) ccGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGgtgtg < 2:225911/116‑1 (MQ=255) ccGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGgtgtg > 1:225911/1‑116 (MQ=255) ccGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTc > 2:53084/1‑131 (MQ=255) ccGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTc < 1:53084/131‑1 (MQ=255) ccGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCAtttttt < 1:250076/150‑1 (MQ=255) cAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGa < 2:1108751/113‑1 (MQ=255) cAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGa > 1:1108751/1‑113 (MQ=255) aGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAg > 2:694268/1‑150 (MQ=255) aaCGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGGACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGt < 2:419335/150‑1 (MQ=255) cACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTGATTGCTGCATGGGTGTGTGCTCTAACCGGCGCAGCGCCGTGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCg > 1:270722/1‑150 (MQ=255) cACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCg > 2:995086/1‑150 (MQ=255) | CCAGGCCTCGGCCGAGGTGGCCTATCCATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCG > NC_002947/1747664‑1747942 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |