New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1801199 = | 41 (0.910) | 4 (0.090) | 4/238 | NT | 9.8% | coding (1141/3525 nt) | dnaEA | DNA polymerase III subunit alpha |
? | NC_002947 | 1801232 = | 34 (0.790) | coding (1174/3525 nt) | dnaEA | DNA polymerase III subunit alpha |
GACATCATCATCCAGATGGGCTTCCCCGGTTACTTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGT > NC_002947/1801052‑1801344 | ggcggccatggtaccgaaggtgatgatctggctcaccgcgttacggccgtaggcctcagccacgtagtcgatcacccggtcacggccgtccatgcagaagtcgacgtctaagtcgggcatggaaacacgttcagggttgaggaagcgCTc > 2:850234‑M1/148‑150 (MQ=255) gcggccatggtaccgaaggtgatgatctggctcaccgcgttacggccgtaggcctcagccacgtagtcgatcacccggtcacggccgtccatgcagaagtcgacgtcgaagtcgggcatggaaacacgttcagggttgaggaagcgCTCg < 1:373940‑M1/4‑1 (MQ=255) atcatcatcCAGATGGGCTTCCCCGGTTACTTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACGGAtctgggc > 2:433775/1‑146 (MQ=255) tcatcatcCAGATGGGCTTCCCCGGTTACTTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGAcc > 2:817398/1‑150 (MQ=255) catcatcCAGATGGGCTTCCCCGGTTACTTCATGATTGTTATGGAATTGATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCCCGCTGGTGGCCTATGTTCTGAAAATTACCGATCTCGAccc > 2:212475/1‑150 (MQ=255) tcatcCAGATGGGCTTCCCCGGTTACTTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGc > 2:1034172/1‑150 (MQ=255) atcCAGATGGGCTTCCCCGGTTACTTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTTGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTg > 2:1000303/1‑150 (MQ=255) cAGATGGGCTTCCCCTGTTACTTCCTGATTGTGATGGTCTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGcc < 1:433775/150‑1 (MQ=255) gATGGGCTTCCCCGGTTACTTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGCAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTa > 2:167793/1‑150 (MQ=255) ttCCCCGGTTACTTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACctg < 2:550544/150‑1 (MQ=255) cccGGTTACTTCCTGATTGTTATGGCCTTCATCAAATGGGCCAAGAAAAACGACATACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTGCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGCCCTGACGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACctgctg < 1:167793/150‑1 (MQ=255) ttCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAgcgc > 2:607874/1‑150 (MQ=255) tGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTcc < 2:659137/150‑1 (MQ=255) ttATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAAcc < 1:1092903/150‑1 (MQ=255) gACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGaa < 1:212475/150‑1 (MQ=255) ttCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACgt > 1:531306/1‑150 (MQ=255) tcaAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGa < 2:734409/97‑1 (MQ=255) tcaAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGa > 1:734409/1‑97 (MQ=255) tcaAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTc > 2:893869/1‑122 (MQ=255) tcaAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTc < 1:893869/122‑1 (MQ=255) tcaAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGGTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGttt > 2:367505/1‑150 (MQ=255) aaaTGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTcc > 2:687221/1‑150 (MQ=255) ccAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCAt < 1:1080178/145‑1 (MQ=255) ccAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCAt > 2:1080178/1‑145 (MQ=255) ccAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCg > 1:405022/1‑150 (MQ=255) cAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGa > 2:1120179/1‑150 (MQ=255) tcgatcacccggtcacggccgtccatgcagaagtcgacgtcgaagtcgggcatggaaacacgttcagggttgaggaagcgCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAAc < 1:108219‑M1/52‑1 (MQ=255) tcgatcacccggtcacggccgtccatgcagaagtcgacgtcgaagtcgggcatggaaacacgttcagggttgaggaagcgCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAAc > 2:108219‑M1/81‑132 (MQ=255) agcacaatGACGTACGGCTGGGCCAGGGACGTGGTTAGGGTGCCGGCGCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGAGCAGCTCTTCGAGCGCTTCCTCAAACCTCAACGTGTTTCCATGCCCGACt > 2:300137/4‑150 (MQ=255) tcacccggtcacggccgtccatgcagaagtcgacgtcgaagtcgggcatggaaacacgttcagggttgaggaagcgCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGt < 1:624219‑M1/28‑1 (MQ=255) tcacccggtcacggccgtccatgcagaagtcgacgtcgaagtcgggcatggaaacacgttcagggttgaggaagcgCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGt > 2:624219‑M1/77‑104 (MQ=255) gTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGAc > 2:583799/1‑150 (MQ=255) tGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCa < 1:1120179/150‑1 (MQ=255) tGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCAATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCa < 1:317403/150‑1 (MQ=255) ccGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCg > 1:1075980/1‑150 (MQ=255) ggCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGa < 1:502920/149‑1 (MQ=255) ggCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGa > 2:502920/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGCCGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTAc < 1:817398/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACg < 1:821016/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACg > 2:821016/1‑149 (MQ=255) tggtggCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTgg < 1:607874/150‑1 (MQ=255) tggCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTg > 2:133316/1‑150 (MQ=255) ggCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGa < 1:133316/150‑1 (MQ=255) ggCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGa < 1:1000303/150‑1 (MQ=255) aTGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTc > 2:794957/1‑92 (MQ=255) aTGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTc < 1:794957/92‑1 (MQ=255) cTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGc > 1:171280/1‑150 (MQ=255) cTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGc > 2:546274/1‑150 (MQ=255) cTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGc > 2:182554/1‑150 (MQ=255) aCCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAAcgcg < 1:583799/150‑1 (MQ=255) cGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGt > 2:713850/1‑150 (MQ=255) | GACATCATCATCCAGATGGGCTTCCCCGGTTACTTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGT > NC_002947/1801052‑1801344 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |