New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1801199 = | 41 (0.910) | 4 (0.090) | 4/238 | NT | 9.8% | coding (1141/3525 nt) | dnaEA | DNA polymerase III subunit alpha |
? | NC_002947 | 1801232 = | 34 (0.790) | coding (1174/3525 nt) | dnaEA | DNA polymerase III subunit alpha |
TTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGTGAGCCAGATCATCACCTTCGGTACCATGGCCGCC > NC_002947/1801085‑1801378 | ttCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAgcgc > 2:607874/1‑150 (MQ=255) tGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTcc < 2:659137/150‑1 (MQ=255) ttATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAAcc < 1:1092903/150‑1 (MQ=255) gACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGaa < 1:212475/150‑1 (MQ=255) ttCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACgt > 1:531306/1‑150 (MQ=255) tcaAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGGTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGttt > 2:367505/1‑150 (MQ=255) aaaTGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTcc > 2:687221/1‑150 (MQ=255) ccAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCAt > 2:1080178/1‑145 (MQ=255) ccAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCAt < 1:1080178/145‑1 (MQ=255) ccAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCg > 1:405022/1‑150 (MQ=255) cAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGa > 2:1120179/1‑150 (MQ=255) tcgatcacccggtcacggccgtccatgcagaagtcgacgtcgaagtcgggcatggaaacacgttcagggttgaggaagcgCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAAc < 1:108219‑M1/52‑1 (MQ=255) tcgatcacccggtcacggccgtccatgcagaagtcgacgtcgaagtcgggcatggaaacacgttcagggttgaggaagcgCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAAc > 2:108219‑M1/81‑132 (MQ=255) agcacaatGACGTACGGCTGGGCCAGGGACGTGGTTAGGGTGCCGGCGCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGAGCAGCTCTTCGAGCGCTTCCTCAAACCTCAACGTGTTTCCATGCCCGACt > 2:300137/4‑150 (MQ=255) gTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGAc > 2:583799/1‑150 (MQ=255) tGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCa < 1:1120179/150‑1 (MQ=255) tGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCAATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCa < 1:317403/150‑1 (MQ=255) ccGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCg > 1:1075980/1‑150 (MQ=255) ggCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGa < 1:502920/149‑1 (MQ=255) ggCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGa > 2:502920/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGCCGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTAc < 1:817398/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACg > 2:821016/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACg < 1:821016/149‑1 (MQ=255) tggtggCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTgg < 1:607874/150‑1 (MQ=255) tggCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTg > 2:133316/1‑150 (MQ=255) ggCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGa < 1:1000303/150‑1 (MQ=255) ggCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGa < 1:133316/150‑1 (MQ=255) aTGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTc > 2:794957/1‑92 (MQ=255) aTGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTc < 1:794957/92‑1 (MQ=255) gttcagggttgaggaagcgctcgaacagcaggtcgtaggccagcgggtcgagCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGa > 2:108219‑M2/53‑132 (MQ=255) gttcagggttgaggaagcgctcgaacagcaggtcgtaggccagcgggtcgagCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGa < 1:108219‑M2/80‑1 (MQ=255) cTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGc > 2:182554/1‑150 (MQ=255) cTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGc > 2:546274/1‑150 (MQ=255) cTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGc > 1:171280/1‑150 (MQ=255) aCCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAAcgcg < 1:583799/150‑1 (MQ=255) cGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGt > 2:713850/1‑150 (MQ=255) GACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGTGAGCCAg < 2:292813‑M1/150‑1 (MQ=255) acagcaggtcgtaggccagcgggtcgagCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGa < 1:624219‑M2/76‑1 (MQ=255) acagcaggtcgtaggccagcgggtcgagCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGa > 2:624219‑M2/29‑104 (MQ=255) cTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTTAt < 2:1152909/96‑1 (MQ=255) cTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGAt > 1:1152909/1‑96 (MQ=255) ctgctgTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGTGAGCCAGATCATCACCTTCGGTAcc < 1:546274/150‑1 (MQ=255) ttCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGTGAGCCAGATCATCACCTTCGGTACCATGgcc > 1:1046626/1‑150 (MQ=255) cgagCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGTGAGCCAGATCATCACCTTCGGTACCATGgccgc < 1:373940‑M2/146‑1 (MQ=255) gagCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTAGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGTGAGCCAGATCATCACCTTCGGTACCATGgccgcc > 2:850234‑M2/4‑150 (MQ=255) | TTCCTGATTGTTATGGACTTCATCAAATGGGCCAAGAACAACGACGTACCGGTGGGCCCGGGTCGTGGTTCGGGTGCCGGCTCGCTGGTGGCCTATGTCCTGAAGATCACCGATCTCGACCCGCTGGCCTACGACCTGCTGTTCGAGCGCTTCCTCAACCCTGAACGTGTTTCCATGCCCGACTTCGACGTCGACTTCTGCATGGACGGCCGTGACCGGGTGATCGACTACGTGGCTGAGGCCTACGGCCGTAACGCGGTGAGCCAGATCATCACCTTCGGTACCATGGCCGCC > NC_002947/1801085‑1801378 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |