New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2908576 | 30 (0.660) | 3 (0.070) | 3/238 | NT | 9.0% | coding (162/1341 nt) | hasE | secretion metalloprotease |
? | NC_002947 | = 2908596 | 32 (0.740) | coding (142/1341 nt) | hasE | secretion metalloprotease |
GCCACCGCACGCAGGGCATCGAGGCGCACCACTTCCTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAGGTGGCTGCTCTCGGCGGGGATCAGTTCGGCAT > NC_002947/2908430‑2908721 | gCCACCGCACGCAGGGCATCGAGGCGCACCACTTCCTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGcca > 1:263122‑M1/1‑147 (MQ=255) aCCGCACGCAGGGCATCGAGGCGCACCACTTCCTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACg > 1:668240/1‑150 (MQ=255) cgcacgcaGGGCATCGAGGCGCACCACTTCCTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGcc < 2:812962/150‑1 (MQ=255) gCATCGAGGCGCACCACTTCCTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGt < 1:45267/150‑1 (MQ=255) acTTCCTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGAc < 2:609981/150‑1 (MQ=255) acTTCCTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGAc > 1:556272/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACcac < 1:353580/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGccactggacgccggcgtggtcgccaccggtacggtcaa < 2:263122‑M1/150‑39 (MQ=255) cTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCAcag > 2:111688/1‑150 (MQ=255) caccacATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAAccgcc > 2:996618/1‑150 (MQ=255) cacaTCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTTACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGaa > 1:514121/1‑150 (MQ=255) aTCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGcc > 1:848771/1‑150 (MQ=255) ccTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGGCCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCg > 1:687467/1‑150 (MQ=255) aCCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGcc < 1:285465/89‑1 (MQ=255) aCCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGcc > 2:285465/1‑89 (MQ=255) cATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCa > 1:456177/1‑150 (MQ=255) cTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGcccc > 1:34914/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTa < 2:456177/150‑1 (MQ=255) cACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGccactggacgccggcgtggtcgccaccggtacggtcaag < 1:1097684‑M1/98‑40 (MQ=255) cACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGccactggacgccggcgtggtcgccaccggtacggtcaag > 2:1097684‑M1/1‑59 (MQ=255) gTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGGCCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTc < 2:687467/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTc < 2:556272/150‑1 (MQ=255) ggACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAgat < 1:111688/150‑1 (MQ=255) ccTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCa > 2:729721/1‑150 (MQ=255) tttCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAgg < 2:848771/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAgatcgat < 1:1028456/141‑1 (MQ=255) gTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAgatcgat > 2:1028456/1‑141 (MQ=255) aCCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAgg < 2:681785/135‑1 (MQ=255) aCCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAgg > 1:681785/1‑135 (MQ=255) ccTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAGGTGGCTGCTCTcggcgg < 1:729721/150‑1 (MQ=255) cTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGcgccaccggtacggtcaaggtcaccagcaaccgaaaggcagtccagcacctgagcggtg < 1:1097684‑M2/98‑60 (MQ=255) cTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGcgccaccggtacggtcaaggtcaccagcaaccgaaaggcagtccagcacctgagcggtg > 2:1097684‑M2/1‑39 (MQ=255) ttGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGcgccaccggtacggtcaaggtcaccagcaaccgaaaggcagtccagcacctgagcggtggcaccgttgaagcgatcatggtgcgcgaaggcgatgtggtgaagaaaggccag < 2:263122‑M2/150‑113 (MQ=255) aCCGTACCGGTGGAGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAGGTGGCTGCTCTCGGCGGGGATc > 2:443150/1‑150 (MQ=255) ccGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAGGTGGCTGCTCTCGGCGGGGATCa < 1:443150/150‑1 (MQ=255) ccGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAGGTGGCTGCTCTCGGCGGGGATCa < 1:599954/150‑1 (MQ=255) cGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAGGTGGCTGCTCTCGGCGGGGATCAg > 1:965478/1‑150 (MQ=255) tGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAGGTGGCTGCTCTCGGCGGGGATCAGTTCGGCAt > 2:842458/1‑150 (MQ=255) | GCCACCGCACGCAGGGCATCGAGGCGCACCACTTCCTGGCCTTTCTTCACCACATCGCCTTCGCGCACCATGATCGCTTCAACGGTGCCACCGCTCAGGTGCTGGACTGCCTTTCGGTTGCTGGTGACCTTGACCGTACCGGTGGCGACCACGCCGGCGTCCAGTGGCGCCAGGCAGGACCACAGCAGGAAACCGCCGAAGCCGGCGATGACCAGCCATACGCCCCAGCGTACCGGGCGGCCCGCGTCCAGATCGATCAGGTGGCTGCTCTCGGCGGGGATCAGTTCGGCAT > NC_002947/2908430‑2908721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |