New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3248965 = | 42 (0.930) | 4 (0.090) | 4/238 | NT | 9.4% | coding (542/1704 nt) | ureC | urease subunit alpha |
? | NC_002947 | 3249080 = | 37 (0.850) | coding (657/1704 nt) | ureC | urease subunit alpha |
ATCCACTTCATTTGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGAAGACTGGGGCTCTACGCCAGCAGCCATCG > NC_002947/3248826‑3249111 | atCCACTTCATTTGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGcc < 2:876146/150‑1 (MQ=255) atCCACTTCATTTGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGcc < 2:367700/150‑1 (MQ=255) aCTTCATTTGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACa < 2:392995/150‑1 (MQ=255) aCTTCATTTGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACa < 1:884991/150‑1 (MQ=255) cTTCATTTGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCAGGTTCATCGGAGGTGGGACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGACGACAg > 1:583418/1‑150 (MQ=255) ttCATTTGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGc < 2:790439/150‑1 (MQ=255) tttGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGc > 2:801594/1‑150 (MQ=255) tttGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGc < 2:1048803/150‑1 (MQ=255) tttGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTAGAGCACCAGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGc > 1:73835/1‑150 (MQ=255) cagcagGTGGCCGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCCGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCGGCCAGCTTGCCGATCAAc < 2:74983/150‑1 (MQ=255) cagGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGACCCCACCTGCACGCCCGGCCCCTTGTACCTTTCTCGCATGTTGTAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATc < 1:626282/150‑1 (MQ=255) gTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCggg > 1:573488/1‑150 (MQ=255) tGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGgc < 1:801594/150‑1 (MQ=255) gAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAg > 1:1124763/1‑114 (MQ=255) gAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAg < 2:1124763/114‑1 (MQ=255) aGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTgg < 2:573488/150‑1 (MQ=255) ttGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTgggcaa < 1:756456/149‑1 (MQ=255) ttGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTgggcaa > 2:756456/1‑149 (MQ=255) gCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGcc > 2:82474/1‑107 (MQ=255) gCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGcc < 1:82474/107‑1 (MQ=255) accacGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCgg > 2:511852/1‑150 (MQ=255) ccacGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGc > 2:57391/1‑150 (MQ=255) gTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTCCCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGa > 1:190239/1‑150 (MQ=255) gcccggacACTGGCAGCAATGCCACGCCCTTCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCATGCGGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGCGCCGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCTCGAGCACATTg < 2:82141/148‑1 (MQ=255) tGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGgcgc > 2:545353/1‑150 (MQ=255) tGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGgcgc > 2:385271/1‑150 (MQ=255) ggCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATg < 2:970732/106‑1 (MQ=255) ggCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATg > 1:970732/1‑106 (MQ=255) gCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGc > 1:1189475/1‑132 (MQ=255) gCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGc < 2:1189475/132‑1 (MQ=255) ccAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCg > 1:1141587/1‑150 (MQ=255) ccAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCg > 2:492520/1‑150 (MQ=255) aaTGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCggg > 2:491864/1‑150 (MQ=255) caggcaacagtcgatggctgctggcgtagagccccagtcttcaTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTc < 1:179757‑M1/107‑1 (MQ=255) caccacCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCgg < 2:73855/144‑1 (MQ=255) caccacCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCgg > 1:73855/1‑144 (MQ=255) caccTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAAt < 1:697441/91‑1 (MQ=255) caccTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAAt > 2:697441/1‑91 (MQ=255) accTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTg > 1:627847/1‑150 (MQ=255) gatggctgctggcgtagagccccagtcttcaTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGaa > 2:179757‑M1/32‑150 (MQ=255) tggctgctggcgtagagccccagtcttcaTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCgg > 2:1013601‑M1/30‑132 (MQ=255) tggctgctggcgtagagccccagtcttcaTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCgg < 1:1013601‑M1/103‑1 (MQ=255) gCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGAAGa < 1:492520/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGAAGACTg < 2:627847/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGAAGACTg < 1:491864/150‑1 (MQ=255) tGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGAAGACTGGGGctct > 2:241736/1‑150 (MQ=255) gcgcgcATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGAAGACTGGGGCTCTACGCcagca < 1:511852/150‑1 (MQ=255) gcgcATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGAAGACTGGGGCTCTACGCCagcagc > 1:115519/1‑150 (MQ=255) tGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGAAGACTGGGGCTCTACGCCAGCAGCCATCg > 2:422829/1‑150 (MQ=255) | ATCCACTTCATTTGCCCACAGCAGGTGGACGAGGCATTGAACAGCGGTGTCACCACGTTCATCGGCGGTGGAACCGGGCCGGCCACTGGCACCAATGCCACCACCTGCACGCCCGGCCCCTGGTACCTTGCGCGCATGTTGCAGGCTGCCGACAGCTTGCCGATCAACATCGGGCTGCTGGGCAAGGGCAATGCCTCGCGGCCAGACGCGCTGCGCGAGCAGATTGCCGCAGGCGCTGTCGGGCTCAAGCTGCATGAAGACTGGGGCTCTACGCCAGCAGCCATCG > NC_002947/3248826‑3249111 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |