New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3455021 = | 43 (0.950) | 6 (0.140) | 6/236 | NT | 13.8% | coding (913/1953 nt) | aacs | acetoacetyl‑CoA synthetase |
? | NC_002947 | 3455047 = | 34 (0.790) | coding (887/1953 nt) | aacs | acetoacetyl‑CoA synthetase |
CTCGGCCTCTATCAGGTCCAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGAATAGAGGATGTACAGCGGGTGGTCGAACGGCAG > NC_002947/3454872‑3455156 | cTCGGCCTCTATCAGGTCCAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATc < 2:909813/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTCTATCAGGTCCAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCTGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCg > 2:55744/1‑150 (MQ=255) ttcttccagcccggcggcgagccccgtttcaccccgctgccgttcgaccacccgctgtacatcctctattccagtggcaccaccggcgtgcccaagtgcattgtccatcgcgccggaggcgtgctgttgcaacacctcaaggaacaCGGc > 2:447944‑M1/147‑150 (MQ=255) ggCGTCTATCAGATCCAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAAAAGCACGTCATCGGc > 2:503225/1‑150 (MQ=255) ctctATCAGGTCCAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCtt > 2:13577/1‑150 (MQ=255) ctctATCAGGTCCAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCtt > 1:624254/1‑150 (MQ=255) tATCAGGTCCAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAg < 1:1107883/150‑1 (MQ=255) cAGGTCCAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTc < 2:970206/150‑1 (MQ=255) ccggcggcgagccccgtttcaccccgctgccgttcgaccacccgctgtacatcctctattccagtggcaccaccggcgtgcccaagtgcattgtccatcgcgccggaggcgtgctgttgcaacacctcaaggaacaCGGCCTTCAGGTCg < 2:187716‑M1/14‑1 (MQ=255) ccAGAGGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTtgt < 2:344320/150‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTtgtg > 1:193786/1‑150 (MQ=255) ggCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGc < 1:13577/150‑1 (MQ=255) gcTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCTGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCg‑t > 2:39060/1‑150 (MQ=255) ccgtttcaccccgctgccgttcgaccacccgctgtacatcctctattccagtggcaccaccggcgtgcccaagtgcattgtccatcgcgccggaggcgtgctgttgcaacacctcaaggaacaCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCg‑t < 2:219147‑M1/27‑1 (MQ=255) ccgtttcaccccgctgccgttcgaccacccgctgtacatcctctattccagtggcaccaccggcgtgcccaagtgcattgtccatcgcgccggaggcgtgctgttgcaacacctcaaggaacaCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCg‑t > 1:187716‑M1/124‑150 (MQ=255) cggggTGGAAGGGGGGGCGGTCGTACAGGACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGa < 2:624254/148‑1 (MQ=255) cccgctgccgttcgaccacccgctgtacatcctctattccagtggcaccaccggcgtgcccaagtgcattgtccatcgcgccggaggcgtgctgttgcaacacctcaaggaacaCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGa > 1:219147‑M1/115‑150 (MQ=255) gAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTg < 1:818957/150‑1 (MQ=255) cgctgtacatcctctattccagtggcaccaccggcgtgcccaagtgcattgtccatcgcgccggaggcgtgctgttgcaacacctcaaggaacaCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTcc < 1:372251‑M1/32‑1 (MQ=255) cgctgtacatcctctattccagtggcaccaccggcgtgcccaagtgcattgtccatcgcgccggaggcgtgctgttgcaacacctcaaggaacaCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTcc > 2:372251‑M1/95‑126 (MQ=255) aCAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAgg < 1:334983/113‑1 (MQ=255) aCAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAgg > 2:334983/1‑113 (MQ=255) ccggCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTCGCCAGCCAGTTCCACAGCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGAt < 1:1150012/147‑1 (MQ=255) tctattccagtggcaccaccggcgtgcccaagtgcattgtccatcgcgccggaggcgtgctgttgcaacacctcaaggaacaCg < 1:416464‑M1/2‑1 (MQ=255) tctattccagtggcaccaccggcgtgcccaagtgcattgtccatcgcgccggaggcgtgctgttgcaacacctcaaggaacaCg > 2:416464‑M1/83‑84 (MQ=255) tGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACaa < 2:290923/150‑1 (MQ=255) ggCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAAt < 2:3292/150‑1 (MQ=255) gCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAAt < 1:38606/149‑1 (MQ=255) gCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCAGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAAt > 2:38606/1‑149 (MQ=255) cacccaccGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCTTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGc < 2:472409/150‑1 (MQ=255) acccaccGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTg < 1:622991/117‑1 (MQ=255) acccaccGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTg > 2:622991/1‑117 (MQ=255) caccGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACtt < 1:303079/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTgg < 2:1196228/150‑1 (MQ=255) agccagTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCa < 2:193786/150‑1 (MQ=255) ccagTTCCACATCATCCCGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACt < 1:364887/150‑1 (MQ=255) ctgTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTg < 1:55744/148‑1 (MQ=255) cagTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTg < 2:1004291/150‑1 (MQ=255) ttCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCAGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGTCGGGGGTGCCACTggga > 1:816522/1‑148 (MQ=255) cacaTCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTGAGTGATGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGACTag > 1:384672/1‑150 (MQ=255) cacaTCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATg < 2:1042937/117‑1 (MQ=255) cacaTCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATg > 1:1042937/1‑117 (MQ=255) acaTCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGAATaga > 1:64063/1‑150 (MQ=255) tcatcCAGCCGCAGGTGGTGTGATAGAGCAGCACTTCAGCTGCCTTCAGGTCGTTGTGTAGGCCGACGGAACTT‑AGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGAATAGAGGa < 1:625555/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCggtgg > 2:358650/1‑124 (MQ=255) ccGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCggtgg < 1:358650/124‑1 (MQ=255) gtggtgTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCggt > 2:1111034/1‑116 (MQ=255) gtggtgTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCggt < 1:1111034/116‑1 (MQ=255) tagtagAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCGTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGAATAGAGGATGTACAGCGGGTGGTCGAAc < 1:39060/150‑1 (MQ=255) agtagAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGAATAGAGGATGTACAGCGGGTGGTCGAACg < 2:64063/150‑1 (MQ=255) gtagAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGAATAGAGGATGTACAGCGGGTGGTCGAACgg > 2:789736/1‑150 (MQ=255) tagAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGAATAGAGGATGTACAGCGGGTGGTCGAACGGc > 2:1043714/1‑150 (MQ=255) gAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGAATAGAGGATGTACAGCGGGTGGTCGAACGGCAg > 1:298146/1‑150 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTgg < 1:754761/88‑1 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTgg > 2:754761/1‑88 (MQ=255) | CTCGGCCTCTATCAGGTCCAGAAGGCGCTCGGGGCCCGGGTGGAACGGCGAGCCGTCGTACAGCACCAGCGTGGCACCCACCGCCAGGCCGCTGGCCAGCCAGTTCCACATCATCCAGCCGCAGGTGGTGTAGTAGAACAGCACGTCATCGGCCTTCAGGTCGTTGTGCAGGCCG‑TGTTCCTTGAGGTGTTGCAACAGCACGCCTCCGGCGCGATGGACAATGCACTTGGGCACGCCGGTGGTGCCACTGGAATAGAGGATGTACAGCGGGTGGTCGAACGGCAG > NC_002947/3454872‑3455156 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |