| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4129658 | 43 (0.950) | 5 (0.120) | 4/234 | NT | 10.4% | coding (231/942 nt) | PP_3633 | ArgC‑like N‑acetyl‑gamma‑glutamyl‑phosphate reductase |
| ? | NC_002947 | = 4129681 | 46 (1.080) | coding (254/942 nt) | PP_3633 | ArgC‑like N‑acetyl‑gamma‑glutamyl‑phosphate reductase | |||||
GATCTTCGCCTGCTGACCCTCCCCGAGGCCGAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCTATCCCACCGGCGCCATCGCGCTGCTGC > NC_002947/4129509‑4129806 | gATCTTCGCCTGCTGACCCTCCCCGAGGCCGAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGG < 1:838836‑M1/150‑1 (MQ=255) tCTTCGCCTGCTGACCCTCCCCGAGGCCGAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGt > 1:539910/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGCTGACCCTCCCCGAGGCCGAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGAt > 2:927645/1‑150 (MQ=255) aCCCTCCCCGAGGCCGAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGc < 2:539910/150‑1 (MQ=255) ccTCCCCGAGGCCGAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGtgcgccgagctggcgtc > 2:168616‑M1/1‑133 (MQ=255) cTCCCCGAGGCCGAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCg > 2:803593/1‑150 (MQ=255) cGAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCAccgcac < 2:1150166‑M2/150‑7 (MQ=255) gAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCAccgcacc < 1:35752‑M2/150‑8 (MQ=255) gAGCGCAAGCACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGtgcgccgagctggcgtcgatcacccgcacc < 2:167183‑M1/150‑31 (MQ=255) aGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACCGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGcacca < 1:918092/150‑1 (MQ=255) cgcAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGtgcgccgagctggcgtcgatcacccgcacctgg < 1:168616‑M1/150‑34 (MQ=255) aaGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGcaccacacca > 2:459344/1‑150 (MQ=255) ggACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGtgcgccgagctggcgtcgatcacccgcacctgg < 2:1185339‑M1/145‑34 (MQ=255) ggACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGtgcgccgagctggcgtcgatcacccgcacctgg > 1:1185339‑M1/1‑112 (MQ=255) cggCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTgg > 2:911892/3‑150 (MQ=255) aTCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCCGGCCGGCGACCCCGCGCGGGAGGCCGTGGGCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGGGATCGACGCCCGCTCGGCGCCCCGCACCCCAACAGGCTGGGTGTATGGCCGGCCGGGGCtt < 2:74092/150‑1 (MQ=255) cAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACCCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGa < 1:436041/150‑1 (MQ=255) aaCAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGAc > 1:195972/1‑150 (MQ=255) ccGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGc > 1:683954/1‑150 (MQ=255) cGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGa < 2:992937/135‑1 (MQ=255) cGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGa > 1:992937/1‑135 (MQ=255) aTCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGcc > 1:741327/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTggg > 1:1150115/1‑110 (MQ=255) ccTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTggg < 2:1150115/110‑1 (MQ=255) ctgccCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAAGCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTTACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCaa > 1:440782/1‑150 (MQ=255) tgccCGACTACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATAGACGCCAGCTCTGCCCATCGCACCACACCAGGCTTGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCaaa < 1:749575/150‑1 (MQ=255) tgccCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCaaa < 1:459344/150‑1 (MQ=255) ccGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCACGCAAAGCa < 1:229773/150‑1 (MQ=255) cgacgaCGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAGCAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCAc > 2:993380/1‑150 (MQ=255) cgacgaCGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAg > 1:213511/1‑147 (MQ=255) cgacgaCGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAg < 2:213511/147‑1 (MQ=255) cgacgaCGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCAc > 2:1160396/1‑150 (MQ=255) acgacgCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCAcgc < 1:911892/150‑1 (MQ=255) acgacgCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCAcgc < 2:35752/150‑1 (MQ=255) gccggccgCGAGGCCGTGGCGGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTc > 2:444086/1‑150 (MQ=255) gccgccCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAg > 1:457918/1‑121 (MQ=255) gccgccCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAg < 2:457918/121‑1 (MQ=255) ccgcccgcGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCa > 2:457123/1‑150 (MQ=255) cgcccgcGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAg > 2:726042/1‑150 (MQ=255) cgcccgcGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAg > 1:453132/1‑150 (MQ=255) gcgAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTAt > 1:1013374/1‑86 (MQ=255) gcgAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTAt < 2:1013374/86‑1 (MQ=255) gAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATccc > 2:987038/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGt < 1:803593/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCt > 2:469936/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCTa < 1:469936/150‑1 (MQ=255) gCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCTAt < 1:987038/150‑1 (MQ=255) cGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCgt > 1:639992/1‑127 (MQ=255) cGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCgt < 2:639992/127‑1 (MQ=255) ccccAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCTATCCCACCGGCGCCCTc > 2:450620/1‑150 (MQ=255) ccccAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCTATCCCACCGGCGCCATc > 2:584601/1‑150 (MQ=255) ccccAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCTATCCCACCGGCGCCATc > 1:47619/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCAccgcacctgggggttgtggattgcggccacggcctcgcgggcggcgtcgtcgggcaggcacagcagggcgatgtcggcactgttgatcgcttcgcagcggcgttgcgggtccttgcg < 1:168616‑M2/150‑118 (MQ=255) ccAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCAccgcacctgggggttgtggattgcggccacggcctcgcgggcggcgtcgtcgggcaggcacagcagggcgatgtcggcactgttgatcgcttcgcagcggcgttgcgggtcc < 2:1185339‑M2/145‑113 (MQ=255) ccAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCAccgcacctgggggttgtggattgcggccacggcctcgcgggcggcgtcgtcgggcaggcacagcagggcgatgtcggcactgttgatcgcttcgcagcggcgttgcgggtcc > 1:1185339‑M2/1‑33 (MQ=255) aGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCTATCCCACCGGCGCCATCgcgc < 1:1139041/150‑1 (MQ=255) ggtgcggtgcgccgagctggcgtcgatcacccgcacctgggggttgtggattgcggccacggcctcgcgggcggcgtcgtcgggcaggcacagcagggcgatgtcggcactgttgatcgcttcgcagcggcgttgcgggtccttgcgctc < 1:35752‑M1/150‑144 (MQ=255) ggTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCAccgcacctgggggttgtggattgcggccacggcctcgcgggcggcgtcgtcgggcaggcacagcagggcgatgtcggcactgttgatcgcttcgcagcggcgttgcgggtgcttgcgctc < 2:167183‑M2/150‑121 (MQ=255) gtgcggtgcgccgagctggcgtcgatcacccgcacctgggggttgtggattgcggccacggcctcgcgggcggcgtcgtcgggcaggcacagcagggcgatgtcggcactgttgatcgcttcgcagcggcgttgcgggtccttgcgctcg < 2:1150166‑M1/150‑145 (MQ=255) gggTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCTATCCCACCGGCGCCATCGCGCtgctgc < 1:782932/150‑1 (MQ=255) | GATCTTCGCCTGCTGACCCTCCCCGAGGCCGAGCGCAAGGACCCGCAACGCCGCTGCGAAGCGATCAACAGTGCCGACATCGCCCTGCTGTGCCTGCCCGACGACGCCGCCCGCGAGGCCGTGGCCGCAATCCACAACCCCCAGGTGCGGGTGATCGACGCCAGCTCGGCGCACCGCACCACACCAGGCTGGGTGTATGGCCTGCCGGAGCTTGACGAACAGCAAGCCGAGCGCATCGCGCAAAGCACGCGTGTCAGCAATCCCGGTTGCTATCCCACCGGCGCCATCGCGCTGCTGC > NC_002947/4129509‑4129806 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |