New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5362599 = | 42 (0.930) | 4 (0.090) | 4/232 | NT | 9.4% | coding (1215/1341 nt) | glmM | phosphoglucosamine mutase |
? | NC_002947 | 5362655 = | 38 (0.900) | coding (1159/1341 nt) | glmM | phosphoglucosamine mutase |
AGATCTGCGCTGGCAAGCGCCTTCAGACACAAACTTCGCCGACCAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTTC > NC_002947/5362451‑5362748 | aGATCTGCGCTGGCAAGCGCCTTCAGACACAAACTTCGCCGACCAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGAc > 1:911143/1‑150 (MQ=255) gCAAGCGCCTTCAGACACAAACTTCGCCGACCAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCa > 1:1072326/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCTTCAGACACAAACTTCGCCGACCAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAgc < 2:1055760/150‑1 (MQ=255) ttCAGACACAAACTTCGCCGACCAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCACCGCCAGCGCTTCgg > 2:346718/1‑150 (MQ=255) acaAACTTCGCCGACCAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGCCCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCtt < 1:346718/150‑1 (MQ=255) aaaCTTCGCCGACCAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCAACTGGCTTTCGTCCTCGCCCGCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCtttg > 2:577607/1‑148 (MQ=255) gatggcgctcaagcgccggggcgaaaccctggcccaggcccgtcaggccctgcgcaagtgcccgcaggtgctgatcaatgtgcgctttggcgccagcaaggtcgacccgctggagcACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCa < 1:1096363‑M1/34‑1 (MQ=255) ttCGCCGACCAGTTTGGCCAGCGCTTCNGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACt > 1:1086710/1‑150 (MQ=255) aCCAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTcc < 2:1072326/150‑1 (MQ=255) cAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGc < 2:630981/138‑1 (MQ=255) cAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGc > 1:630981/1‑138 (MQ=255) gTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGa > 1:701360/1‑150 (MQ=255) gTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTACTTGa < 1:1008995/150‑1 (MQ=255) tttGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCAGCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGAc > 2:866683/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCgggg > 1:236771/1‑150 (MQ=255) gcTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGc > 1:28122/1‑150 (MQ=255) ttCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTc > 1:826409/1‑150 (MQ=255) tGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCggg < 2:1086710/150‑1 (MQ=255) ccaggcccgtcaggccctgcgcaagtgcccgcaggtgctgatcaatgtgcgctttggcgccagcaaggtcgacccgctggagcACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCggg > 2:1096363‑M1/84‑150 (MQ=255) ccGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCgcc < 2:924329/150‑3 (MQ=255) ccGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGAc < 2:701360/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGc < 2:236771/150‑1 (MQ=255) tttCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACcccgccccgc > 2:406647/1‑79 (MQ=255) tttCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACcccgccccgc < 1:406647/79‑1 (MQ=255) gTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCaaa > 2:295664/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTAGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAgcg > 2:920017/1‑150 (MQ=255) tCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCAGCCCCGACAGCGCTTCGGTAACATTGGCACTGGCTTCCTTGACAGCGGGGTGCTCCACCGGGTCGACCTTGCTCGTGCCAAAgcgc > 2:209152/1‑150 (MQ=255) ccTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACAt > 1:601215/1‑150 (MQ=255) cTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACAtt > 2:573961/1‑150 (MQ=255) ccATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACAGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCa > 2:280846/1‑150 (MQ=255) cATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAg > 1:271300/1‑150 (MQ=255) atcaatgtgcgctttggcgccagcaaggtcgacccgctggagcACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCggg > 2:179913‑M1/44‑97 (MQ=255) atcaatgtgcgctttggcgccagcaaggtcgacccgctggagcACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCggg < 1:179913‑M1/54‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGCCCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAg < 1:521398/144‑1 (MQ=255) ccGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAg > 2:521398/1‑144 (MQ=255) cACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCgg < 2:1149228/150‑1 (MQ=255) gtcccGGACTTGCGCGACAGCACACAACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTGGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAgg < 2:28122/147‑1 (MQ=255) ccGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGGGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGcc > 2:432208/1‑150 (MQ=255) gACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGa < 1:295664/150‑1 (MQ=255) aCTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGAc < 1:920017/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACgg < 2:271300/150‑1 (MQ=255) gcgcAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAAGCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACgggg < 2:826409/150‑2 (MQ=255) aaCAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGc < 2:815883/146‑1 (MQ=255) aaCAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGc > 1:815883/1‑146 (MQ=255) cAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGc > 2:1037629/1‑150 (MQ=255) gCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCa > 2:204261/1‑150 (MQ=255) cacaCGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAg < 1:204261/150‑1 (MQ=255) acGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGt > 1:535115/1‑150 (MQ=255) ACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTTc > 2:911143‑M1/1‑150 (MQ=255) | AGATCTGCGCTGGCAAGCGCCTTCAGACACAAACTTCGCCGACCAGTTTGGCCAGCGCTTCAGCATGGGCCCGCACCTGGCTTTCGTCCTCGCCCTCAACCATGACCCGCACCAACGGCTCGGTACCGGACTTGCGCAACAGCACACGACCCCGCCCCGCCAGCGCTTCGGTAACCTTGGCACTGGCTTCCTTGACGGCGGGGTGCTCCAGCGGGTCGACCTTGCTGGCGCCAAAGCGCACATTGATCAGCACCTGCGGGCACTTGCGCAGGGCCTGACGGGCCTGGGCCAGGGTTTC > NC_002947/5362451‑5362748 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |