| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5488624 = | 59 (1.310) | 4 (0.090) | 4/240 | NT | 6.9% | coding (1905/2772 nt) | PP_4824 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| ? | NC_002947 | 5488652 = | 51 (1.170) | coding (1933/2772 nt) | PP_4824 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator | |||||
CTGGTCATTGCCAAACAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCTTTTGCGCACCAAGGC > NC_002947/5488487‑5488770 | cTGGTCATTGCCAAACAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTgcgc > 2:431055/1‑150 (MQ=255) aTTGCCAAACAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGcc > 1:775875/1‑150 (MQ=255) tGCCAAACAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCcg < 1:615078/150‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCcgc < 1:191413/150‑1 (MQ=255) aaaCAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTg > 2:953586/1‑150 (MQ=255) aaCAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGc > 1:484691/1‑150 (MQ=255) aaCAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGc < 1:409394/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCt > 2:647586/1‑150 (MQ=255) cggtggtCGGTGTGATGGAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCGGCCCCGGGATGGGCAACACCTGGTGGCTGTTCTTGCAGCTGGACCCGTCGCGCCTGGCACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCtgg < 2:100545/144‑1 (MQ=255) gCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCtggt > 2:21896/1‑150 (MQ=255) cTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGcc > 1:139469/1‑124 (MQ=255) cTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGcc < 2:139469/124‑1 (MQ=255) cTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCtggtg < 1:161816/150‑1 (MQ=255) tCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTcg > 2:1178886/1‑150 (MQ=255) ggTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCTCCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCTCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGTTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTcgac < 1:136876/150‑1 (MQ=255) tCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTcgacga > 1:713611/1‑150 (MQ=255) aTGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGacgacaac > 1:933871/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGacgacaacga > 1:908899/1‑150 (MQ=255) ggccagagcctccttgcctgacggcaccgcgctgacgttcatgccccaggcactgcactgctgtacaagcaccttgcggcacgtgtcgttgtcgtcgaccacCAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTcga > 1:79586‑M1/103‑138 (MQ=255) ggccagagcctccttgcctgacggcaccgcgctgacgttcatgccccaggcactgcactgctgtacaagcaccttgcggcacgtgtcgttgtcgtcgaccacCAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTcga < 2:79586‑M1/36‑1 (MQ=255) ggCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACg > 2:281785/1‑150 (MQ=255) ggCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACg > 2:396281/1‑150 (MQ=255) gAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGc > 1:648403/1‑150 (MQ=255) gAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGc < 1:1199683/150‑1 (MQ=255) ggCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAg < 1:1178886/150‑1 (MQ=255) ggCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAg < 2:898110/150‑1 (MQ=255) gCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGc < 1:628537/109‑1 (MQ=255) gCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGc > 2:628537/1‑109 (MQ=255) aTCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTg > 1:224555/1‑150 (MQ=255) aaGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCtt < 1:53374/150‑1 (MQ=255) aaGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTGGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGGCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCtt < 2:266656/150‑1 (MQ=255) agagCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGCCTGGGTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTg < 1:73704/150‑1 (MQ=255) gCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAgcagtgca > 2:889554/1‑150 (MQ=255) aTGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAgcagtgcagt < 2:933871/150‑1 (MQ=255) gggCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCagtgcagtgc < 2:969127/150‑1 (MQ=255) gttcatgccccaggcactgcactgctgtacaagcaccttgcggcacgtgtcgttgtcgtcgaccacCAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTcgac > 2:238372‑M1/67‑103 (MQ=255) gttcatgccccaggcactgcactgctgtacaagcaccttgcggcacgtgtcgttgtcgtcgaccacCAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTcgac < 1:238372‑M1/37‑1 (MQ=255) acacCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTggg < 2:648403/150‑1 (MQ=255) acacCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTggg < 2:224555/150‑1 (MQ=255) acacCTTGTGGCTGACCTGGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTggg < 2:911199/150‑1 (MQ=255) acCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGAt > 2:503594/1‑78 (MQ=255) acCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGAt < 1:503594/78‑1 (MQ=255) tgGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAAc < 2:490546/150‑1 (MQ=255) tgGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAAc < 2:775875/150‑1 (MQ=255) gCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGt > 2:478345/1‑150 (MQ=255) cTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCtggt > 1:28188/1‑83 (MQ=255) cTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCtggt < 2:28188/83‑1 (MQ=255) gCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGt < 1:431055/150‑1 (MQ=255) cTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCg > 2:113503/1‑150 (MQ=255) ccTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGc < 1:478345/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAgcagtg > 2:823392/1‑108 (MQ=255) ttCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAgcagtg < 1:823392/108‑1 (MQ=255) gcgcCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAgg < 2:611555/89‑1 (MQ=255) gcgcCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAgg > 1:611555/1‑89 (MQ=255) gcgcCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAagga > 2:480724/1‑150 (MQ=255) cTGGAACAGCCAACAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGct > 2:567778/1‑150 (MQ=255) gAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAGCCACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTg > 2:891609/1‑150 (MQ=255) gAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTg < 1:113503/150‑1 (MQ=255) gAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTg > 1:1174697/1‑150 (MQ=255) aCAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGc < 2:1174697/150‑1 (MQ=255) accaGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCtttt > 2:330244/1‑150 (MQ=255) caGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCttt > 2:718111/1‑147 (MQ=255) caGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCttt < 1:718111/147‑1 (MQ=255) gCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCTTTTgcgc > 2:588273/1‑150 (MQ=255) ggACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCTTTTGCGCAc < 1:567778/150‑1 (MQ=255) cTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCTTTTGCGCACCAAg > 1:1092702/1‑150 (MQ=255) cTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCTTTTGCGCACCAAg < 1:281785/150‑1 (MQ=255) cGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCTTTTGCGCACCAAGgc < 1:889554/150‑1 (MQ=255) CAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCtt < 1:336443‑M1/64‑1 (MQ=255) CAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCtt > 2:336443‑M1/1‑64 (MQ=255) | CTGGTCATTGCCAAACAGCTGATCGGTCTGATGCAGGGCGAGTTCGGCATCAAGAGCAGCACCGGCATGGGCAACACCTTGTGGCTGACCTTGCCGCTGGACCCTTCGCGCCTGGAACAGCCACCAGCGGACCTCGACAGCCCGCTGCGCGATGCCCGCGTGCTGGTGGTCGACGACAACGACACGTGCCGCAAGGTGCTTGTACAGCAGTGCAGTGCCTGGGGCATGAACGTCAGCGCGGTGCCGTCAGGCAAGGAGGCTCTGGCCCTTTTGCGCACCAAGGC > NC_002947/5488487‑5488770 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |