New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5508216 | 49 (1.090) | 4 (0.090) | 4/236 | NT | 7.7% | intergenic (+22/‑228) | cycA/urtA | D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease/urea ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 5508241 | 49 (1.140) | intergenic (+47/‑203) | cycA/urtA | D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease/urea ABC transporter substrate‑binding protein |
GCCTGGAGGCGGATACCCGTTCAGCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGCACAGCCCCTCTAAACCGT > NC_002947/5508073‑5508364 | gCCTGGAGGCGGATACCCGTTCAGCCCTGGTGGTGACACAGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTCCGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGc > 2:569969/1‑150 (MQ=255) gCCTGGAGGCGGATACCCGTTCAGCACTGGTGGTGACACAGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGACTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGc > 2:569967/1‑150 (MQ=255) ggAGGCGGATACCCGTTCAGCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACgg < 1:858187/150‑1 (MQ=255) cccGTTCAGCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTc < 1:152282/150‑1 (MQ=255) ccGTTCAGCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTcc < 1:861610/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGATCCCCCACCAGCTCGTACGCAGCAGGCATAATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGa < 1:570906/150‑1 (MQ=255) ttCAGCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGAt < 2:359168/150‑1 (MQ=255) aGCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATgtg < 1:758651‑M2/150‑4 (MQ=255) aGCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATgtg > 2:55398‑M2/1‑147 (MQ=255) gCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATgtgg > 2:758651‑M2/1‑146 (MQ=255) cACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACatcggacggcgtacaccgtgccttcgtggg > 2:1000926‑M1/1‑120 (MQ=255) cTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACatcggacggcgtacaccgtgccttcgtgggaa < 1:417372‑M1/150‑33 (MQ=255) tggtggTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAgc < 1:47322/150‑1 (MQ=255) tggtggTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGAGGGCCTCGGGGGCTGCTCCCACatcggacggcgtacaccgtgccttcgtgggaac < 2:164681‑M1/150‑34 (MQ=255) gtggtgACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCGGTCCGATGTGGGAgcgc > 2:172848/1‑150 (MQ=255) gtggtgACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAgcgc > 1:351914/1‑150 (MQ=255) gtggtgACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTAGTACTCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCGCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAgcgc > 1:1124187/1‑150 (MQ=255) tggtgACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGAt < 2:593860/139‑1 (MQ=255) tggtgACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGAt > 1:593860/1‑139 (MQ=255) ggtgACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGccc < 2:486330/150‑1 (MQ=255) gACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACatcggacggcgtacaccgtgccttcgtgggaacagccccc < 1:1000926‑M1/150‑41 (MQ=255) gACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTtg < 2:1165644/150‑1 (MQ=255) acacCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTAAGCAGCAGGCGCCATCACGGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTAGGCCGTCCGCTGTGGGATCGCCCTtgt > 2:99087/1‑150 (MQ=255) acCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTgtgt > 2:211737/1‑150 (MQ=255) gATCTGGTTTGTCGTACTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTcgc < 2:299851/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGa < 2:320178/150‑1 (MQ=255) ggTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATgg < 2:1043873/150‑1 (MQ=255) ggTTTGTCGCGCAGGTCTTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATgg < 2:1124187/150‑1 (MQ=255) gTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATggg < 1:211737/150‑1 (MQ=255) tttGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGc < 2:717019/150‑1 (MQ=255) tGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCg > 2:551627/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCt > 1:558167/1‑131 (MQ=255) tCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCt < 2:558167/131‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGcggtg > 2:941152/1‑146 (MQ=255) ggCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGc < 2:995830/150‑1 (MQ=255) cTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTtg < 1:848324/117‑1 (MQ=255) cTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTtg > 2:848324/1‑117 (MQ=255) ccAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCCATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCtgtg > 1:1247/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGc > 1:91683/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGc < 2:91683/150‑1 (MQ=255) tCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGcacac < 1:458297/150‑1 (MQ=255) agcagGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCAt < 1:99087/150‑1 (MQ=255) tCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAAc < 1:551627/150‑1 (MQ=255) ccGCACCGCCGTGCGTAACGCCTGATGGCCTCGCGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTg < 1:576720/150‑1 (MQ=255) gCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGa < 2:88872/150‑1 (MQ=255) gCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGa < 2:351914/150‑1 (MQ=255) gTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATccaa > 1:252016/1‑147 (MQ=255) gTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATccaa < 2:252016/147‑1 (MQ=255) gATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGc < 2:588210/88‑1 (MQ=255) gATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGc > 1:588210/1‑88 (MQ=255) cTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGcac > 1:554735/1‑150 (MQ=255) gggggCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATgtgggaacagcccccgaggccatcagccgttacgcacggccgtgcggggatggcgcctgctgcgtacgagctggtaggtcaccgccagcacgacaaaccagatcggtgtc < 1:1000926‑M2/150‑111 (MQ=255) gggggCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGCACAGc < 1:397218/150‑1 (MQ=255) gggCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGCACGCCGTACGATGTTGCTCGGCCGTGCTTTCGCGATGGGCCGCACCGCGCCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGCACAGccc < 1:569969/150‑1 (MQ=255) gggCTGTTCCCACGAAGGCACGGTATATGTTGTCCTTCCAGGTTGCCGCCTTGGGTCTCGATGGGCCGCACAACTGGCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGCACAGccc < 1:569967/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTCGGAGGTCTGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGCACAGcccc > 1:337546/1‑150 (MQ=39) cTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGCACAGCCCctc > 2:1019941/1‑150 (MQ=255) gTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATgtgggagcagcccccgaggccctcagccgttacgcacggccgtgcggggatggcgcctgctgcgtacgagctggtaggtcaccgccagcacgacaaaccagatcggtgtcaccacca < 2:164681‑M2/150‑118 (MQ=255) ttCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATgtgggaacagcccccgaggccatcagccgttacgcacggccgtgcggggatggcgcctgctgcgtacgagctggtaggtcaccgccagcacgacaaaccagatcggtgtcaccaccag < 1:417372‑M2/150‑119 (MQ=255) cccACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATgtgggaacagcccccgaggccatcagccgttacgcacggccgtgcggggatggcgcctgctgcgtacgagctggtaggtcaccgccagcacgacaaaccagatcggtgtcaccaccagtg > 2:1000926‑M2/1‑30 (MQ=255) ccACatcggacggcgtacaccgtgccttcgtgggaacagcccccgaggccatcagccgttacgcacggccgtgcggggatggcgcctgctgcgtacgagctggtaggtcaccgccagcacgacaaaccagatcggtgtcaccaccagtgc > 2:758651‑M1/1‑4 (MQ=255) cacatcggacggcgtacaccgtgccttcgtgggaacagcccccgaggccatcagccgttacgcacggccgtgcggggatggcgcctgctgcgtacgagctggtaggtcaccgccagcacgacaaaccagatcggtgtcaccaccagtgct > 2:55398‑M1/1‑3 (MQ=255) cacatcggacggcgtacaccgtgccttcgtgggaacagcccccgaggccatcagccgttacgcacggccgtgcggggatggcgcctgctgcgtacgagctggtaggtcaccgccagcacgacaaaccagatcggtgtcaccaccagtgct < 1:758651‑M1/150‑148 (MQ=255) aCGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGCACAGCCCCTCTAAACCGt > 1:519395/1‑150 (MQ=255) aCGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGCACAGCCCCTCTAAACCGt > 1:1123022/1‑150 (MQ=255) aCGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGACCCACTCCTGTGCACACAAATCCATGAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACCCGCCAAGACCACGGACAGCCCCTCTAAGCCGt > 1:665149/1‑150 (MQ=255) | GCCTGGAGGCGGATACCCGTTCAGCACTGGTGGTGACACCGATCTGGTTTGTCGTGCTGGCGGTGACCTACCAGCTCGTACGCAGCAGGCGCCATCCCCGCACGGCCGTGCGTAACGGCTGATGGCCTCGGGGGCTGTTCCCACGAAGGCACGGTGTACGCCGTCCGATGTGGGAGCGCCCTTGTGTCGCGATGGGCCGCACCGCGGCCCCAATCCTGTGCACACAAATCCATCAGGCACCAACCTGGATCCAACCAACGCCCCAAGACCTCGCACAGCCCCTCTAAACCGT > NC_002947/5508073‑5508364 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |