New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5796762 = | 48 (1.060) | 4 (0.090) | 4/236 | NT | 7.7% | coding (1194/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
? | NC_002947 | 5796792 = | 50 (1.160) | coding (1164/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
CTGGCCACACCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGC > NC_002947/5796613‑5796908 | cTGGCCACACCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATc < 1:972772/150‑1 (MQ=255) cTGGCCACACCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATc > 1:157489/1‑150 (MQ=255) gccggtatcgtcatgaccgaaggccgccacgcggtgtgcctgctcgaccgtaacggtctacgcccggcgcgctgggtgaccaccaccaatggttacatcaccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTg > 1:642991‑M1/148‑150 (MQ=255) gccggtatcgtcatgaccgaaggccgccacgcggtgtgcctgctcgaccgtaacggtctacgcccggcgcgctgggtgaccaccaccaatggttacatcaccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTg > 1:373305‑M1/148‑150 (MQ=255) gccggtatcgtcatgaccgaaggccgccacgcggtgtgcctgctcgaccgtaacggtctacgcccggcgcgctgggtgaccaccaccaatggttacatcaccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTg > 1:351007‑M1/148‑150 (MQ=255) ggtatcgtcatgaccgaaggccgccacgcggtgtgcctgctcgaccgtaacggtctacgcccggcgcgctgggtgaccaccaccaatggttacatcaccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTGGcc < 1:793663‑M1/6‑1 (MQ=255) cacCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCg < 1:522489/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCGCGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCtt < 2:610549/150‑1 (MQ=255) gCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTgg > 1:1129386/1‑150 (MQ=255) tGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTg > 1:1120987/1‑141 (MQ=255) tGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTg < 2:1120987/141‑1 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc < 2:765266/150‑1 (MQ=255) aTGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTcc > 2:128260/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCt < 2:601958/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCGCAGGCt > 1:106276/1‑150 (MQ=255) tGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAg > 2:1067197/1‑150 (MQ=255) cagcGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCg > 2:83291/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGAt > 2:1089030/1‑150 (MQ=255) cTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTc < 1:128260/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAgg < 2:927655/150‑1 (MQ=255) cgcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTg < 2:570450/150‑1 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGa > 2:574883/1‑150 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGa > 1:650328/1‑150 (MQ=255) cgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGAt > 2:1191224/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTaa > 1:315895/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTaa > 1:691986/1‑150 (MQ=255) accaatggttacatcaccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc < 1:124117‑M1/36‑1 (MQ=255) accaatggttacatcaccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc > 2:124117‑M1/64‑99 (MQ=255) tCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtggtg < 2:691986/150‑1 (MQ=255) ccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGc > 1:1140724‑M1/48‑74 (MQ=255) ccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGc < 2:1140724‑M1/27‑1 (MQ=255) gTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCa < 2:1126137/146‑1 (MQ=255) gTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCa > 1:1126137/1‑146 (MQ=255) tCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGAt < 1:676867/91‑1 (MQ=255) tCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGAt > 2:676867/1‑91 (MQ=255) tCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAg > 2:712828/1‑150 (MQ=255) tCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGc > 1:366751/1‑81 (MQ=255) tCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGc < 2:366751/81‑1 (MQ=255) cGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGcca < 2:650328/150‑2 (MQ=255) aGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCAccc > 2:941667/1‑139 (MQ=255) aGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCAccc < 1:941667/139‑1 (MQ=255) ggATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCGGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGGTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGc < 2:157489/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTa < 2:1129386/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGAc > 1:748330/1‑150 (MQ=255) gCCGGTTTCGGTGTCCCGGGCAAGGATCTCGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCCATTTCCTGGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGAcc < 2:106276/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATAc > 2:1161684/1‑84 (MQ=255) gCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATAc < 1:1161684/84‑1 (MQ=255) cGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg < 1:696451/119‑1 (MQ=255) cGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg > 2:696451/1‑119 (MQ=255) gTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTa < 1:83291/150‑1 (MQ=255) tttCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTAc < 1:1191224/150‑1 (MQ=255) tCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACgg < 2:748330/150‑1 (MQ=255) cACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCa < 1:1158230/52‑1 (MQ=255) cACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCa > 2:1158230/1‑52 (MQ=255) aCGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACCCGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAgg < 1:487790/150‑1 (MQ=255) gCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCgg > 1:451187/1‑122 (MQ=255) gCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCgg < 2:451187/122‑1 (MQ=255) aaGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCacac > 2:793663/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg > 1:377994/1‑97 (MQ=255) gATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg < 2:377994/97‑1 (MQ=255) gATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACcgc > 1:819395/1‑150 (MQ=255) | CTGGCCACACCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGC > NC_002947/5796613‑5796908 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |