| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5796762 = | 48 (1.060) | 4 (0.090) | 4/236 | NT | 7.7% | coding (1194/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| ? | NC_002947 | 5796792 = | 50 (1.160) | coding (1164/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha | |||||
GATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATACCGGCCGG > NC_002947/5796648‑5796941 | gATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc < 2:765266/150‑1 (MQ=255) aTGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTcc > 2:128260/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCt < 2:601958/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCGCAGGCt > 1:106276/1‑150 (MQ=255) tGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAg > 2:1067197/1‑150 (MQ=255) cagcGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCg > 2:83291/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGAt > 2:1089030/1‑150 (MQ=255) cTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTc < 1:128260/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAgg < 2:927655/150‑1 (MQ=255) cgcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTg < 2:570450/150‑1 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGa > 2:574883/1‑150 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGa > 1:650328/1‑150 (MQ=255) cgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGAt > 2:1191224/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTaa > 1:315895/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTaa > 1:691986/1‑150 (MQ=255) accaatggttacatcaccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc > 2:124117‑M1/64‑99 (MQ=255) accaatggttacatcaccatcgcctcggaaatcggcgtatggggctatcagcctgaggaagtgCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc < 1:124117‑M1/36‑1 (MQ=255) tCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtggtg < 2:691986/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑a > 1:1126137/1‑146 (MQ=255) gTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑a < 2:1126137/146‑1 (MQ=255) tCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGAt > 2:676867/1‑91 (MQ=255) tCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGAt < 1:676867/91‑1 (MQ=255) tCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAg > 2:712828/1‑150 (MQ=255) tCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGc < 2:366751/81‑1 (MQ=255) tCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGc > 1:366751/1‑81 (MQ=255) cGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGcca < 2:650328/150‑2 (MQ=255) aGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑Accc > 2:941667/1‑139 (MQ=255) aGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑Accc < 1:941667/139‑1 (MQ=255) ggATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCGGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGGTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGc < 2:157489/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTa < 2:1129386/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGAc > 1:748330/1‑150 (MQ=255) gCCGGTTTCGGTGTCCCGGGCAAGGATCTCGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCCATTTCCTGGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGAcc < 2:106276/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATAc < 1:1161684/84‑1 (MQ=255) gCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATAc > 2:1161684/1‑84 (MQ=255) cGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg > 2:696451/1‑119 (MQ=255) cGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg < 1:696451/119‑1 (MQ=255) gTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTa < 1:83291/150‑1 (MQ=255) tttCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTAc < 1:1191224/150‑1 (MQ=255) tCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACgg < 2:748330/150‑1 (MQ=255) cACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCa < 1:1158230/52‑1 (MQ=255) cACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCa > 2:1158230/1‑52 (MQ=255) aCGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACCCGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAgg < 1:487790/150‑1 (MQ=255) gCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCgg < 2:451187/122‑1 (MQ=255) gCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCgg > 1:451187/1‑122 (MQ=255) gaagtgctggccaagggccgtgtcggcccgggccagCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggt > 2:124117‑M2/37‑99 (MQ=255) gaagtgctggccaagggccgtgtcggcccgggccagCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggt < 1:124117‑M2/63‑1 (MQ=255) aaGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCacac > 2:793663/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg < 2:377994/97‑1 (MQ=255) gATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg > 1:377994/1‑97 (MQ=255) gATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACcgc > 1:819395/1‑150 (MQ=255) TGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCgg > 2:781909‑M1/1‑113 (MQ=255) TGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCgg < 1:781909‑M1/113‑1 (MQ=255) gccaagggccgtgtcggcccgggccagCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATgg > 1:1140724‑M2/28‑74 (MQ=255) gccaagggccgtgtcggcccgggccagCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATgg < 2:1140724‑M2/47‑1 (MQ=255) GCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcg < 2:48310‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcggc < 2:715415‑M1/150‑1 (MQ=255) cacGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcggc < 2:774125/141‑1 (MQ=255) cacGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcggc > 1:774125/1‑141 (MQ=255) acGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCAt < 1:1089030/150‑1 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGa > 1:953318/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGa > 1:222416/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGa > 2:338300/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATa > 2:930371/1‑150 (MQ=255) ggccagCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATAcc < 1:793663‑M2/144‑1 (MQ=255) cagCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATAccggc > 1:351007‑M2/4‑150 (MQ=255) cagCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATAccggc > 1:373305‑M2/4‑150 (MQ=255) cagCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATAccggc > 1:642991‑M2/4‑150 (MQ=255) cACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGCGTCCATTCAT‑TTCCTCGACCCGTCGCTCCGGGCGTACACCCTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATAccggccgg < 1:574883/150‑1 (MQ=255) | GATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTC‑ACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATACCGGCCGG > NC_002947/5796648‑5796941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |