New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 73699 = | 47 (1.040) | 4 (0.090) | 4/244 | NT | 8.0% | coding (175/888 nt) | PP_0063 | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase |
? | NC_002947 | 73721 = | 46 (1.040) | coding (197/888 nt) | PP_0063 | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase |
CCAAGCTGCCCTGGGGCGCTGTGCAGCGTGTCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAGGCCCTGGCCTCGGGTAAAGGCGTGGTC > NC_002947/73574‑73869 | ccAAGCTGCCCTGGGGTGCTGTGCAGCGGGTCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACtggtgg < 2:191409/150‑1 (MQ=255) ccAAGCTGCCCTGGGGCGCTGTGCAGCGTGTCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACtggtgg > 2:54333/1‑150 (MQ=255) aGCTGCCCTGGGGCGCTGTGCAGCGTGTCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGcc < 1:54333/150‑1 (MQ=255) cTGCCCTGGGGCGCTGTGCAGCGTGTCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAg < 2:1144002/150‑1 (MQ=255) gCGTGTCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTaa < 2:940170/150‑1 (MQ=255) gtgtCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACtggtgg > 1:1126868/1‑123 (MQ=255) gtgtCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACtggtgg < 2:1126868/123‑1 (MQ=255) tCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGATGCGGGATATCGGTAAATCCt < 1:401709/150‑1 (MQ=255) gCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATc < 2:291072/137‑1 (MQ=255) gCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATc > 1:291072/1‑137 (MQ=255) aCCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAg > 2:728356/1‑120 (MQ=255) aCCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAg < 1:728356/120‑1 (MQ=255) gctggctgATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAgtgcct < 2:377296/150‑1 (MQ=255) gtgGACGATCCCCACCGGTGCGCGCAACGTGGTACGGATCAAGCTGGCCAAATGCTTCCGGGAGACGGACCCGGTTGCCCGGGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGAt < 2:528015/150‑1 (MQ=255) aTCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGgccg > 2:474967/1‑150 (MQ=255) cccAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGccgccg > 1:349693/1‑150 (MQ=255) ccAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAgt > 2:1016561/1‑125 (MQ=255) ccAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAgt < 1:1016561/125‑1 (MQ=255) ccAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCcgccgc > 2:506208/1‑150 (MQ=255) cAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTgg > 1:256540/1‑142 (MQ=255) cAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTgg < 2:256540/142‑1 (MQ=255) aaCAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCaa < 1:473555/150‑1 (MQ=255) aaCAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTAGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCaa > 1:1035350/1‑150 (MQ=255) gcgcAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAAcgctcgct < 1:782851/150‑1 (MQ=255) cgcAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTg < 1:474967/150‑1 (MQ=255) aaCGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAg > 1:201470/1‑150 (MQ=255) aaCGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAg < 2:1135110/150‑1 (MQ=255) cGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCt > 1:1020142/1‑150 (MQ=255) tACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAg > 1:358297/1‑68 (MQ=255) tACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAg < 2:358297/68‑1 (MQ=255) gacaaaggatttaccgatatcccgcagcgcctggcccaccggttgcccgtgagcaactggTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCttt < 2:750681‑M2/35‑1 (MQ=255) gacaaaggatttaccgatatcccgcagcgcctggcccaccggttgcccgtgagcaactggTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCttt > 1:750681‑M2/61‑95 (MQ=255) ggATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGcc < 2:852337/63‑1 (MQ=255) ggATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGcc > 1:852337/1‑63 (MQ=255) aaaggatttaccgatatcccgcagcgcctggcccaCCAGTTGCTCACGGGCAACCGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTc > 1:750681‑M1/36‑95 (MQ=255) aaaggatttaccgatatcccgcagcgcctggcccaCCAGTTGCTCACGGGCAACCGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTc < 2:750681‑M1/60‑1 (MQ=255) aaggatttaccgatatcccgcagcgcctggcccaCCGGTTGCCCGTGAGCAACtggtgg < 2:118270‑M1/25‑1 (MQ=255) aaggatttaccgatatcccgcagcgcctggcccaCCGGTTGCCCGTGAGCAACtggtgg > 1:118270‑M1/35‑59 (MQ=255) aTCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTTCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGTCGTTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGTCGCAACGCTCGCTGGATCTGGTCAAGGaa < 2:344310/150‑1 (MQ=255) tCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAg > 1:1074541/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGc > 1:1177597/1‑150 (MQ=255) cTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCAt > 1:609931/1‑150 (MQ=255) ggCCAAATGCTGCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCTGTGGGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTACATCTTCTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATgg < 2:232028/150‑1 (MQ=255) gaaTGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAgtgcctgtgcct > 2:825251/2‑97 (MQ=255) aaaTGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAgtgcctgtgcct < 1:825251/97‑1 (MQ=255) ttCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTg > 1:964350/1‑150 (MQ=255) cccGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCt < 2:201470/150‑1 (MQ=255) cGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTc < 2:882103/122‑1 (MQ=255) cGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTc > 1:882103/1‑122 (MQ=255) ggAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGa < 2:959155/150‑1 (MQ=255) tGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAgg < 2:730450/150‑1 (MQ=255) ccaccagttgctcacgggcaaccggTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCtt > 1:118270‑M2/26‑59 (MQ=255) ccaccagttgctcacgggcaaccggTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCtt < 2:118270‑M2/34‑1 (MQ=255) cccGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAGGCCCTGGCCTCgg < 2:964350/150‑1 (MQ=255) cccGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAGGCCCTGGCCTCgg > 2:869932/1‑150 (MQ=255) ccGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAGGCCCTGGCCTCggg > 1:931025/1‑150 (MQ=255) ggTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCAGCGGGGTATCGGTAGATCCTTTGTCGAACGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCCACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGACCAGGCCCTGGCCTCGGGt > 2:121570/2‑150 (MQ=255) aGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAGGCCCTGGCCTCGGGTAAAg < 2:1177597/150‑1 (MQ=255) cAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAGGCCCTGGCCTCGGGTAAAGGc > 2:963899/1‑150 (MQ=255) tggtggGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAGGCCCTGGCCTCGGGTAAAGGCGTgg < 2:1074541/150‑1 (MQ=255) gTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGACTGAATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAGGCCCTGGCCTCGGGTAAAGGCGTGGTc > 1:1052911‑M2/2‑150 (MQ=255) | CCAAGCTGCCCTGGGGCGCTGTGCAGCGTGTCGGCACCGGTATTGGCTGGCTGATGTGGAAAATCCCCAACAGTTCGCGCAACGTGGTACGGATCAACCTGGCCAAATGCTTCCCGGAGATGGACCCGGTTGCCCGTGAGCAACTGGTGGGCCAGGCGCTGCGGGATATCGGTAAATCCTTTGTCGAAAGTGCCTGTGCCTGGATCTGGCCGCCGCAACGCTCGCTGGAGCTGGTCAAGGAAGTGCATGGCCTGGAAGTGCTGGAGCAGGCCCTGGCCTCGGGTAAAGGCGTGGTC > NC_002947/73574‑73869 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |