New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 345300 = | 31 (0.690) | 3 (0.070) | 3/234 | NT | 9.1% | coding (306/1068 nt) | mutY | A/G‑specific adenine glycosylase |
? | NC_002947 | 345333 = | 31 (0.730) | coding (273/1068 nt) | mutY | A/G‑specific adenine glycosylase |
CGTCGAGGATCGGTGCGCGGATGCCCATGCTGATGCTGGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTG > NC_002947/345191‑345482 | catgcaggccctgccaacggtgcaacccctggccgaggcaccggaggacgaagtgctgcacctgtggacgggccttggctactacacccgcgcacgcaacctgcaaaagGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCa > 1:170393‑M1/110‑150 (MQ=255) cgGATGCCCATGCTGATGCTGGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGTCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGgtg > 2:152462/1‑150 (MQ=255) ccATGCTGATGCTGGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGc < 2:731189/150‑1 (MQ=255) atgctgatgctgGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCGGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCa > 1:535117/1‑150 (MQ=255) atgctgatgctgGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCa > 1:383153/1‑150 (MQ=255) tgctgatgctgGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCaa > 1:35807/1‑150 (MQ=255) atgctgGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGccc < 2:692284/150‑1 (MQ=255) tgctgGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCg > 1:446502/1‑150 (MQ=255) tgGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTcc > 1:255977/1‑150 (MQ=255) gCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCcac < 1:100246/150‑1 (MQ=255) gATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTNCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTtgcgtgc > 1:556604/1‑120 (MQ=255) gATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTtgcgtgc < 2:556604/120‑1 (MQ=255) tGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGt > 1:614896/1‑150 (MQ=255) aGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTc < 2:35807/150‑1 (MQ=255) ggAGCGGCCAATGCGGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGtc < 2:535117/150‑1 (MQ=255) aGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGGAGCACTTCGtcct > 1:88058/1‑150 (MQ=255) gCGGCCAATGCCAGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTCCGTCCGCAGATCTACTAGCAAAAGCCTGACCTCAGGTGCAGCACTTCGtcctc > 2:734917/1‑150 (MQ=255) ccAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGt < 1:152462/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTgcag < 2:383745/130‑1 (MQ=255) tGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTgcag > 1:383745/1‑130 (MQ=255) ccGGGCAGCGCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCg > 2:392793/1‑150 (MQ=255) aGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCATGGcctgggcg < 2:446502/150‑8 (MQ=255) tgctCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCAATCCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGtt < 1:698712/150‑1 (MQ=255) gcgGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAg > 2:529745/1‑52 (MQ=255) gcgGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAg < 1:529745/52‑1 (MQ=255) cgGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCAt < 2:255977/150‑1 (MQ=255) tgcaaaaggccgccaaggtcgtcgtcgagcaacatggcggcCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGGTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATg > 1:170393‑M2/42‑150 (MQ=255) aTTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGAGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGc < 2:523578/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCg > 1:106348/1‑150 (MQ=255) GCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCgg > 2:1152554‑M1/1‑55 (MQ=255) GCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCgg < 1:1152554‑M1/55‑1 (MQ=255) GCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGaa > 2:383153‑M1/1‑150 (MQ=255) GCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGaa < 1:437099‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCATGTTGATCCGCGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTCGTAGCCAACGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCGGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGaa > 1:1151282‑M1/1‑150 (MQ=255) CCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAg > 2:106348‑M1/1‑150 (MQ=255) CCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAg > 1:531054‑M1/1‑150 (MQ=255) caaggtcgtcgtcgagcaacatggcggcCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAgg < 2:1107276‑M2/49‑1 (MQ=255) caaggtcgtcgtcgagcaacatggcggcCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAgg > 1:1107276‑M2/29‑77 (MQ=255) ttGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAAtt < 1:651287/150‑1 (MQ=255) tCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGc > 2:1044625/1‑150 (MQ=255) tCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGc > 1:785022/1‑150 (MQ=255) acgacgacCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACg < 2:785022/150‑1 (MQ=255) cTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGAc > 2:418422/1‑150 (MQ=255) ttGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGAcc > 1:1106328/1‑150 (MQ=255) gcggcCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTgg < 1:418422‑M2/145‑1 (MQ=255) ggcCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGt > 2:729709‑M2/4‑150 (MQ=255) cTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTctg < 1:729709/150‑1 (MQ=255) | CGTCGAGGATCGGTGCGCGGATGCCCATGCTGATGCTGGCGATGGCGCCGGCAGTGGAGCGGCCAATGCCGGGCAGCTCGGTAAGCTGCTCGACACTGCGCGGGAATTCGCCGCCATGTTGCTCGACGACGACCTTGGCGGCCTTTTGCAGGTTGCGTGCGCGGGTGTAGTAGCCAAGGCCCGTCCACAGGTGCAGCACTTCGTCCTCCGGTGCCTCGGCCAGGGCTTGCACCGTTGGCAGGGCCTGCATGAAGCGGTCGAAGTAATTGAGCACGGTGCTGACCTGGGTCTG > NC_002947/345191‑345482 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |