New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1936143 = | 40 (0.890) | 3 (0.070) | 3/240 | NT | 7.4% | coding (402/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1936177 = | 36 (0.820) | coding (436/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein |
GTTTCGTTGGCCACAGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTG > NC_002947/1936028‑1936326 | gTTTCGTTGGCCACAGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCgg > 2:729487/1‑150 (MQ=255) gtcaacggtgcgggtacgccgatacgccggtggcgcagccaggcctcgatggtgccgcggccctggtagaaggtcaccgcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcacCGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGAcc > 2:191685‑M1/111‑150 (MQ=255) tGGCCACAGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGc > 1:1046392/1‑150 (MQ=255) aGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGt < 2:208361/137‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGt > 1:208361/1‑137 (MQ=255) gCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCt < 1:140320/150‑1 (MQ=255) ggctgggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGTCTACGAGTCTg < 2:12853/150‑1 (MQ=255) cgatacgccggtggcgcagccaggcctcgatggtgccgcggccctggtagaaggtcaccgcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcacCGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCgg > 1:114270‑M1/92‑126 (MQ=255) cgatacgccggtggcgcagccaggcctcgatggtgccgcggccctggtagaaggtcaccgcctgaccagactcgtagccaaaggcggtcacCGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCgg < 2:114270‑M1/35‑1 (MQ=255) gctgggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTgg > 1:731438/1‑150 (MQ=255) tgggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCTCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTc < 1:859505/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAg > 1:95415/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCAACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCCGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACACCTTGGCCGCCGAGCAACTGCCCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCgg > 2:78612/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGt > 1:1206780/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCtt‑t > 2:186250/1‑126 (MQ=255) cAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCtt‑t < 1:186250/126‑1 (MQ=255) gTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAggg < 1:15359/150‑1 (MQ=255) cTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCcgc > 1:26585/1‑150 (MQ=255) tCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCtt‑t > 1:456388/1‑107 (MQ=255) tCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCtt‑t < 2:456388/107‑1 (MQ=255) tCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCcgcg > 1:289340/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCt < 2:1206780/150‑1 (MQ=255) aaCGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCg > 1:120542/1‑150 (MQ=255) ccTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCACCTGCGCGCCGTGGAGGTG‑CCACCTTCTATGGTCGCCTGGGGTCCGACGGTGACCTGCAACCAGGACGGCGGGACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCgg < 2:739906/150‑1 (MQ=255) cTGAACCTGGATGGCATTGGCCACGACTTGTAGACCGACCAACAACGGGCCGCGCCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGTGTCTAGCCAGGCGGGCACCTTCTACCAGGGCCGCGGCAGCATCGAGGCCGGCGTGCTCCACCGGCATATGGGc > 2:323350/1‑150 (MQ=255) cTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTa > 1:841996/1‑101 (MQ=255) cTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTa < 2:841996/101‑1 (MQ=255) aCCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTAc < 1:25261/150‑1 (MQ=255) cTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGCTGAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTAccc > 1:869924/1‑150 (MQ=255) gtGGCATCGGCCACGCCTTGGACGCCGAGAAACTGCGCCCCGTGGCGGTGCCCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCAc < 2:95415/149‑1 (MQ=255) cATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGtt > 2:687984/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGa > 1:1131378/1‑150 (MQ=255) tCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGa > 2:641709/1‑150 (MQ=255) ggtcaccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGAc > 2:191685‑M2/41‑150 (MQ=255) cGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGAc < 1:687984/150‑1 (MQ=255) ccACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCAt < 2:262324/150‑1 (MQ=255) ccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCg < 2:114270‑M2/91‑1 (MQ=255) ccgccacggcgcgcagttgctcggcggccaaggcgGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCg > 1:114270‑M2/36‑126 (MQ=255) gccgAGCAACTGCGCGCGGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACctgctg > 1:699832/1‑150 (MQ=255) cgAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGc > 1:580970/1‑150 (MQ=255) gAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGcc > 1:1199617/1‑150 (MQ=255) gCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCCGCACCATCGAGGCCTGGCCGCGCCACCGGGGTATCGGCGAACGCGCACCGTTGACCACGGATCACCTGCTGGcccg > 2:368493/1‑148 (MQ=255) gcgcgcCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTgcggc < 2:550/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTgcggc < 1:729487/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTgcggc < 2:1046392/150‑1 (MQ=255) gTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGctgctg < 2:26585/150‑1 (MQ=255) gTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGctgctg > 1:602068/1‑150 (MQ=255) | GTTTCGTTGGCCACAGCCTGCTGGGGCTGGGTGGCCAGGCCCCCGTGGCGTTGCTCGACAGCAGCCCGTTGCGCAGCCTGCTGCAAACGCACCTGAACCTGGATGGCATCGGCCACGCCTTGGCCGCCGAGCAACTGCGCGCCGTGGCGGTGACCGCCTT‑TGGCTACGAGTCTGGTCAGGCGGTGACCTTCTACCAGGGCCGCGGCACCATCGAGGCCTGGCTGCGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTG > NC_002947/1936028‑1936326 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |