New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4593801 = | 74 (1.640) | 4 (0.110) | 4/202 | NT | 6.6% | intergenic (+61/+238) | mccA/PP_4068 | methylcrotonyl‑CoA carboxylase biotin‑containing subunit alpha/Cro/CI family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4593905 = | 53 (1.440) | intergenic (+165/+134) | mccA/PP_4068 | methylcrotonyl‑CoA carboxylase biotin‑containing subunit alpha/Cro/CI family transcriptional regulator |
TTTGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACTCAAACCCTTTCAAAAAGCCCCA > NC_002947/4593758‑4594051 | tttGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATc < 1:749848/150‑1 (MQ=255) cGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGAt > 1:727690/1‑150 (MQ=255) cGGCCCTAACGAACCAAAAGGCCACACCTGCCACCGCTCGTAGCAGCTGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGAt < 2:315983/150‑1 (MQ=17) gCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATc < 1:351153/144‑1 (MQ=255) gCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATc > 2:351153/1‑144 (MQ=255) gCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCg < 1:567319/150‑1 (MQ=255) cccTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTCCCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCgg < 1:464700/150‑1 (MQ=255) cccTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCgg < 2:112653/150‑1 (MQ=255) cccTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCgg > 1:417798/1‑150 (MQ=255) ccTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCggg > 2:494596/1‑150 (MQ=255) ccTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCggg < 1:1048857/150‑1 (MQ=255) cTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCgggg < 2:551556/150‑1 (MQ=255) cTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCgggg < 2:727690/150‑1 (MQ=255) cTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCgggg > 2:836184/1‑150 (MQ=255) gCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCATTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGa > 1:353817/1‑150 (MQ=255) acacAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGacac < 1:494596/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGCCCCTACAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGAACACAtat > 1:119495/1‑148 (MQ=255) ggCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTg < 2:890051/150‑1 (MQ=255) gcngccCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCNGGTTTACCCGCGNAAGGGCNGNGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTgg > 1:856586/1‑150 (MQ=255) gccgccCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTgg < 1:780573/150‑1 (MQ=255) cgccCCTCCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTg < 1:562187/150‑1 (MQ=255) cTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATGTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGATCTGGCGGTTAAACTCCCTCCTACCAGCGATGGAGGGCGGACGCATGTCGGTGAttcg > 1:423451/1‑148 (MQ=17) cTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAg < 2:856586/150‑1 (MQ=255) aaCAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGgcgc > 1:1157179/1‑150 (MQ=255) aCAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCa > 2:1138413/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGa < 2:555752/116‑1 (MQ=255) cAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGa > 1:555752/1‑116 (MQ=255) cAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAg > 2:8141/1‑150 (MQ=255) cccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGCGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCCGGcc > 1:892664/1‑150 (MQ=255) cGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCcgc < 1:1138413/150‑1 (MQ=255) cGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCcgc < 1:1162562/150‑1 (MQ=255) TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCgt > 2:1157179‑M1/1‑150 (MQ=255) TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCgt > 1:7897‑M1/1‑150 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTa > 2:417798‑M1/1‑150 (MQ=255) AGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAg > 1:8141‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGTTCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAgg < 1:378297‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAgg < 2:1050572‑M1/150‑1 (MQ=255) CGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGa > 1:721562‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGc > 2:1081179‑M1/1‑150 (MQ=255) GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTaggaacg < 1:46452‑M1/150‑4 (MQ=255) GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCg < 1:217097‑M1/150‑1 (MQ=255) tttacccgcgaatacggtagcggcggcaacggtgagcgacgggtagagattggccagcaggcccggccctttcgcgggtaaacccgctcctacATCCGATCGGGGGTGGACACATGtt < 2:321410‑M2/25‑1 (MQ=255) tttacccgcgaatacggtagcggcggcaacggtgagcgacgggtagagattggccagcaggcccggccctttcgcgggtaaacccgctcctacATCCGATCGGGGGTGGACACATGtt > 1:321410‑M2/94‑118 (MQ=255) TTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCgg < 1:680374‑M1/150‑1 (MQ=255) TTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCggg > 1:836184‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgcgaatacggtagcggcggcaacggtgagcgacgggtagagattggccagcaggcccggccctttcgcgggtaaacccgctcctacATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGgc < 2:255581‑M2/36‑1 (MQ=255) ccgcgaatacggtagcggcggcaacggtgagcgacgggtagagattggccagcaggcccggccctttcgcgggtaaacccgctcctacATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGgc > 1:255581‑M2/89‑124 (MQ=255) CGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTATACACCTGCCTCAGGTTTGCTGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAATCCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 1:1172705‑M1/1‑150 (MQ=255) gagaGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCcg < 2:505083/147‑1 (MQ=255) AAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:506618‑M1/150‑1 (MQ=255) AAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg < 1:612222‑M1/150‑1 (MQ=255) aGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTCCCGTATTCTCGCGTAAACCCTCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTAAACCcgctc < 1:20892/150‑3 (MQ=25) gccgggccTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGagag > 2:254706/1‑150 (MQ=255) gCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCAGATCGGGGGAGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGAAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCctgat > 1:1130188/1‑148 (MQ=255) cccAATATCTACCCGTGGCTCTCCGTTGCCGCTGCTACCGTATTAGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTCATGAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCctgct < 1:254706/149‑1 (MQ=21) aTCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCgg > 2:939387/1‑118 (MQ=255) aTCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCgg < 1:939387/118‑1 (MQ=255) ctACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACATCCCATCGGGAGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCTCCTGGCCaaac > 2:557981/1‑148 (MQ=21) tACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTTCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGACCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGCGCCGGCCCTGCTGGCCAACtt > 1:394838/1‑150 (MQ=255) tACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCAACGGCCGCGGGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTTGCCAACtt > 2:886216/1‑150 (MQ=25) aCCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGa < 1:417005/72‑1 (MQ=255) aCCCGGCGCGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGa > 2:417005/1‑72 (MQ=255) cccGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTcc > 2:696551/1‑150 (MQ=255) gCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTAc > 1:911815/1‑111 (MQ=255) gCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTAc < 2:911815/111‑1 (MQ=255) gCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACccgc > 2:579483/1‑150 (MQ=255) cACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGt < 1:696551/150‑1 (MQ=255) aCCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGGCGGCCCTTCTGGCCAACTTCAACCAGCCGtt > 2:498510/1‑150 (MQ=25) ccGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg < 1:642741/115‑1 (MQ=255) ccGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg > 2:642741/1‑115 (MQ=255) ccGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCAc > 2:545327/1‑141 (MQ=255) ccGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCAc < 1:545327/141‑1 (MQ=255) cGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCa > 1:760099/1‑150 (MQ=255) ccgccgCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGtt < 1:622926/150‑1 (MQ=255) aCCGTATTCGCGGGTAACCACGCTCCTACATCCGTTCGGGGGTGGACATATCTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCac < 1:27560/150‑1 (MQ=21) cgggtaaaccccctcctacATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGCTTAGGCGCAGCCCGCGCGTAGGAGCGCGTTTACCCGCGAAAGGCCCGGCCCTGCTGGCCCACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTCCTCAAAcc < 2:378297‑M2/131‑1 (MQ=255) taaacccgctcctacATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCTTTGCCGCCACTACTCAAACCCttt < 1:886216‑M2/135‑1 (MQ=255) taaacccgctcctacATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACTCAAACCCttt < 1:498510‑M2/135‑1 (MQ=255) ccgctcctacATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACTCAAACCCTTTCaaaa < 2:797208‑M2/140‑1 (MQ=255) cgctcctacATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACTCAAACCCTTTCaaaaa < 2:760099‑M2/141‑1 (MQ=255) ggcTACATCCGAGAGGTGGGCGAGACTTGATGCTGTTTACTCGCAGGACGCGTTTCCGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACTCAAACCCTTTCAAAAAGcc < 2:217097/148‑1 (MQ=18) tacATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACTCAAACCCTTTCAAAAAGCCCCa < 1:1050572‑M2/147‑1 (MQ=255) | TTTGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTACTCAAACCCTTTCAAAAAGCCCCA > NC_002947/4593758‑4594051 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |