New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5795612 = | 59 (1.310) | 3 (0.070) | 3/242 | NT | 5.5% | coding (2344/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
? | NC_002947 | 5795659 = | 46 (1.040) | coding (2297/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
TTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGCACCGCGGTACGAGGCGATGGTGGAGATAC > NC_002947/5795512‑5795806 | ttGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGAGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCATGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTGCAGCTGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagc > 2:1041344/1‑150 (MQ=255) tggcctggccgaggaagtggtcggcctgagcttcaagggcgtgtccagccgcatcaagggtgcgcgcttcgaagacctggaaaacgaccagaagctgctGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagca > 2:775245‑M1/100‑150 (MQ=255) ggcctggccgaggaagtggtcggcctgagcttcaagggcgtgtccagccgcatcaagggtgcgcgcttcgaagacctggaaaacgaccagaagctgctGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCcagcag > 2:40083‑M1/99‑150 (MQ=255) gTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTc > 2:935420/1‑150 (MQ=255) tCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGttt < 1:4994/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTc > 2:348209/1‑150 (MQ=255) cccTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTcc > 1:208257/1‑150 (MQ=255) gctgcACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGt > 1:478189/1‑150 (MQ=255) cacaGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTc > 1:748619/1‑150 (MQ=255) gCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTAGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAgcgc > 2:875390/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCtt > 2:37353/1‑150 (MQ=255) ttGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATg < 1:37353/150‑1 (MQ=255) gggTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACg > 1:1058069/1‑150 (MQ=255) gggtGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTc > 1:1204381/4‑98 (MQ=255) ggTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTc < 2:1204381/98‑1 (MQ=255) ggCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCca > 2:1145352/1‑83 (MQ=255) ggCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCca < 1:1145352/83‑1 (MQ=255) gCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCATCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTc > 1:31112/1‑95 (MQ=255) gCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTc < 2:31112/95‑1 (MQ=255) gCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGaa < 1:1046111/149‑1 (MQ=255) gCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGaa > 2:1046111/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAg < 2:110317/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGAGCACCCTTGATACGGCTGGGCACGCCCTTGAAg > 2:975235/1‑150 (MQ=255) cGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCa > 1:826430/1‑102 (MQ=255) cGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCa < 2:826430/102‑1 (MQ=255) ggTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCATTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCa < 2:1197003/150‑1 (MQ=255) cGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCGGGTCGTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGa < 2:813826/150‑1 (MQ=255) gCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGAc < 2:748619/150‑1 (MQ=255) gCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGAc > 1:1044886/1‑150 (MQ=255) ccACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTc > 1:706821/1‑89 (MQ=255) ccACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTc < 2:706821/89‑1 (MQ=255) cACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGc > 2:1136883/1‑120 (MQ=255) cACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGc < 1:1136883/120‑1 (MQ=255) cGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACtt > 2:77031/1‑150 (MQ=255) tGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTc > 2:610420/1‑135 (MQ=255) tGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTc < 1:610420/135‑1 (MQ=255) ttCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCggccagg > 2:1114211/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCggccagg < 2:1044886/150‑1 (MQ=255) ctgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggccAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCggccaggcc > 2:40083‑M2/53‑150 (MQ=255) cagcagGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGa < 1:546663/119‑1 (MQ=255) cagcagGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGa > 2:546663/1‑119 (MQ=255) tgctggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggccAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCggccaggcca > 2:775245‑M2/52‑150 (MQ=255) ggcggccgaagcctggagcgcgcgcaagccgatccagcaaggtggccAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATgg < 1:775245‑M2/103‑1 (MQ=255) GCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGt > 1:1077069‑M1/1‑71 (MQ=255) GCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGt < 2:1077069‑M1/71‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGATACAGGATTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCtt < 2:800877/150‑1 (MQ=255) ggATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCt > 1:130779/1‑150 (MQ=255) gATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCtg > 2:992830/1‑150 (MQ=255) aTCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCtgt < 1:348209/150‑1 (MQ=255) cGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGc < 1:77031/150‑1 (MQ=255) gCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGCAc < 2:478189/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGCACCGCGGt > 2:1098668/1‑150 (MQ=255) gcTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGCACCGCGGTACGa < 2:878528/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGCTGCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCGGAGCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGCACCGCGGTACGAg < 2:59676/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGCACCGCGGTACGAGGCGAtg < 1:1098668/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGCACCGCGGTACGAGGCGAtggt < 1:992830/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGACGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACCCGCCCTTGAAGCTCCGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACATCTGTGCACCGCGGTACGAGGCGATGGTGga < 2:647855/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGCACCGCGGTACGAGGCGATGGTGga < 2:208257/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCCCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCCGGCCAATGGCTTCGATCACCTGTGCACCTCGGTACGTGGCGATGTTGGTGATAc > 2:263532‑M2/3‑150 (MQ=255) | TTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCGCGCTCCAGGCTTCGGCCGCCAGCAGCTTCTGGTCGTTTTCCAGGTCTTCGAAGCGCGCACCCTTGATGCGGCTGGACACGCCCTTGAAGCTCAGGCCGACCACTTCCTCGGCCAGGCCAATGGCTTCGAACAGCTGTGCACCGCGGTACGAGGCGATGGTGGAGATAC > NC_002947/5795512‑5795806 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |