| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 938937 = | 21 (0.950) | 3 (0.140) | 3/244 | NT | 14.0% | coding (6688/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 938967 = | 17 (0.810) | coding (6658/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein | |||||
GTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGCTCGCCCGGTTGCGCGGCTGGGGTGAGG > NC_002947/938790‑939073 | gTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAg < 1:317370/150‑1 (MQ=255) accgccacagtcggcgccaacggaaccttcttggtcgacctcaccccagccgcgcaaccgggcgagcaattgagcctggtgcagaccgatgcgagcggcaacgcctctgaagccctgcaatatgaaatcccggcaaccacgacccCAGcc < 2:497176‑M1/5‑1 (MQ=255) accgccacagtcggcgccaacggaaccttcttggtcgacctcaccccagccgcgcaaccgggcgagcaattgagcctggtgcagaccgatgcgagcggcaacgcctctgaagccctgcaatatgaaatcccggcaaccacgacccCAGcc < 2:350899‑M1/5‑1 (MQ=255) gATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCGGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGctggctgg > 1:305817/1‑150 (MQ=255) aTGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTggg > 1:495833/1‑150 (MQ=255) ggTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGt < 1:306236/150‑1 (MQ=255) gtcgacctcaccccagccgcgcaaccgggcgagcaattgagcctggtgcagaccgatgcgagcggcaacgcctctgaagccctgcaatatgaaatcccggcaaccacgacccCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTg > 1:350899‑M1/113‑150 (MQ=255) gTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCCCCAACAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTg < 1:14874/150‑1 (MQ=255) gTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTgg < 2:553797/128‑1 (MQ=255) gTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTgg > 1:553797/1‑128 (MQ=255) cGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGAACCTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGAttt > 2:221898/1‑150 (MQ=255) cTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGGCGTGGTTGCCGGGATTTCATAtt > 2:354167/1‑150 (MQ=255) ccacACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCg < 2:428483/132‑1 (MQ=255) ccacACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCg > 1:428483/1‑132 (MQ=255) tgCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGc > 1:497176/1‑150 (MQ=255) tgCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATCTCATATTGCAGGGCTGCAGAGGCGTTGCCGc > 2:82783/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCt < 1:381078/150‑1 (MQ=255) cgatgcgagcggcaacgcctctgaagccctgcaatatgaaatcccggcaaccacgacccCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTgggg < 2:277838‑M1/33‑1 (MQ=255) cgatgcgagcggcaacgcctctgaagccctgcaatatgaaatcccggcaaccacgacccCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTgggg > 1:277838‑M1/60‑92 (MQ=255) acGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCaa > 2:472403/1‑150 (MQ=255) tGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGCt > 2:275816/1‑150 (MQ=255) cGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGCTCGcc > 1:251413/1‑150 (MQ=255) gTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGCTCGccc > 1:259105/1‑150 (MQ=255) ggCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGCTCGCCCGGTTg > 1:280395/1‑150 (MQ=255) ccAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGCTCGCCCGGTTGCGCGGCt > 1:95300/1‑150 (MQ=255) aGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGCTCGCCCGGTTGCGCGGCTgg < 1:221898/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTATCAATTTCCGTTATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGCTCGCCCGGTTGCGCGGCTGGGGTGAgg < 1:34559/150‑1 (MQ=38) | GTTCGCCGTTGGCCTGGGCCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCTGCACCAGGCTCAATTGCTCGCCCGGTTGCGCGGCTGGGGTGAGG > NC_002947/938790‑939073 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |