New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1341033 | 26 (1.180) | 3 (0.140) | 3/246 | NT | 11.8% | coding (242/870 nt) | PP_1165 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1341066 | 20 (0.940) | coding (209/870 nt) | PP_1165 | hypothetical protein |
CTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCGGTCGCTTTCACTTCCCAGTTGACCAGGCTGGCGCCCAAC > NC_002947/1340928‑1341215 | cTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCa < 2:147358/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGtt < 2:195515/150‑1 (MQ=255) tCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTgg > 1:417865/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGgcgc > 1:332518/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGTGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCa < 2:295006/150‑1 (MQ=255) gggtgCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCCGGCACTGCCATGAATCGGGTAAGTGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGCCGGGCAAAGTCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCag < 1:384622/149‑1 (MQ=255) cTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGcgtcg > 1:16176/1‑150 (MQ=255) ctgctgCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTAcc > 2:310760/1‑150 (MQ=255) gCACTGCCATGTATCGGGCAAGCGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTTCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGt < 2:131939/150‑1 (MQ=255) gCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGt > 1:519584/1‑150 (MQ=255) aTGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAg < 2:56594/150‑1 (MQ=255) ggTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCGCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAAt < 2:20494/150‑1 (MQ=255) ccGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCGCCCCTCGGGTCGGGCAAAGCcacccaataccgggcatgacccttacccgatccatggcagtgcctggcagcaggcctggcaggtggagcaccacagtgaacagcgagca > 1:337890‑M2/1‑46 (MQ=255) ccGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCGCCCCTCGGGTCGGGCAAAGCcacccaataccgggcatgacccttacccgatccatggcagtgcctggcagcaggcctggcaggtggagcaccacagtgaacagcgagca < 2:337890‑M2/135‑90 (MQ=255) tATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCcacccaataccgggcatgacccttacccgatccatggcagtgcctggcagcaggcctggcaggtggagcaccacagtgaacagcgagcacggctgacgctagacagtg < 2:69858‑M2/150‑109 (MQ=255) ttGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCg > 1:450469/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCGGTCg > 1:216796/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCGGTCGCttt > 2:527353/1‑150 (MQ=255) gcccTCGGGTTGGGGAAAGCCAGCGTCGCGAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGGCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGGAGCAGGGCTTGCCCGGTCGCTTTCACTTCCCGGtt < 2:206178/149‑1 (MQ=255) gggtcgggCAAAGCCACTCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCGGTCGCTTTCACTTCCCAGTTGACAAg > 2:162452/1‑150 (MQ=255) gtcgggCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCGGTCGCTTTCACTTCCCAGTTGACCAGGc < 2:519584/150‑1 (MQ=255) gggCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCGGTCGCTTTCACTTCCCAGTTGACCAGGc < 2:331408/147‑1 (MQ=255) gggCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCGGTCGCTTTCACTTCCCAGTTGACCAGGc > 1:331408/1‑147 (MQ=255) ccACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCGGTCGCTTTCACTTCCCAGTTGACCAGGCTGGCGCCCAAc > 2:558896/1‑150 (MQ=255) | CTGTCTAGCGTCAGCCGTGCTCGCTGTTCACTGTGGTGCTCCACCTGCCAGGCCTGCTGCCAGGCACTGCCATGGATCGGGTAAGGGTCATGCCCGGTATTGGGTGCCAGTGCCTGCCACCCCTCGGGTCGGGCAAAGCCACCCTCGCCAATGCGGTTGGACCAAGGCGCCAGTGGGTAGCAGGCGAGGCGTCGTGGCGTACCACTTTCAAGTGCGGCCAGGTCGGAATGGCGCAGCAGCGCTTGCCCGGTCGCTTTCACTTCCCAGTTGACCAGGCTGGCGCCCAAC > NC_002947/1340928‑1341215 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |